| 摘要 | 第6-8页 |
| ABSTRACT | 第8-10页 |
| 本文所用缩略词 | 第11-12页 |
| 第一部分 文献综述 | 第12-26页 |
| 第一章 内含子长度多态性标记及其应用 | 第12-16页 |
| 1.1 分子标记简介 | 第12-13页 |
| 1.2 内含子标记及其在植物中的应用 | 第13-16页 |
| 1.2.1 内含子标记 | 第13-14页 |
| 1.2.2 内含子标记在植物中的应用 | 第14-16页 |
| 第二章 棉花关联分析研究进展 | 第16-20页 |
| 2.1 关联分析概念 | 第16页 |
| 2.2 关联分析研究策略 | 第16-17页 |
| 2.3 关联分析在植物研究中的应用 | 第17-20页 |
| 第三章 棉花耐盐研究进展 | 第20-24页 |
| 3.1 棉花盐胁迫 | 第20-21页 |
| 3.2 棉花耐盐机制及其研究进展 | 第21-24页 |
| 本研究的目的和意义 | 第24-26页 |
| 第二部分 研究报告 | 第26-60页 |
| 第四章 内含子长度多态性标记的开发及验证 | 第26-36页 |
| 1 材料与方法 | 第26-29页 |
| 1.1 内含子标记开发 | 第26-27页 |
| 1.2 植物材料 | 第27页 |
| 1.3 DNA提取 | 第27-28页 |
| 1.4 内含子标记的扩增与电泳 | 第28-29页 |
| 2 结果与分析 | 第29-33页 |
| 2.1 全基因组比较二倍体和四倍体棉种间的同源性 | 第29-31页 |
| 2.2 同源基因内含子差异生物信息学分析 | 第31页 |
| 2.3 棉花内含子长度多态性标记的开发和鉴定 | 第31-33页 |
| 3 讨论 | 第33-36页 |
| 第五章 利用内含子标记挖掘耐盐基因并对候选基因进行耐盐功能验证 | 第36-60页 |
| 1 材料 | 第36-37页 |
| 1.1 植物材料 | 第36页 |
| 1.2 VIGS试验转化菌株和载体 | 第36页 |
| 1.3 培养基 | 第36-37页 |
| 1.4 植物抗生素的配制 | 第37页 |
| 1.5 试剂 | 第37页 |
| 1.6 引物 | 第37页 |
| 2 方法 | 第37-47页 |
| 2.1 棉花叶片RNA提取 | 第37-38页 |
| 2.2 RNA反转录 | 第38-39页 |
| 2.3 实时荧光定量PCR分析 | 第39-40页 |
| 2.4 大肠杆菌感受态细胞制备、转化及阳性克隆检测 | 第40-41页 |
| 2.5 农杆菌感受态细胞的制备及转化 | 第41页 |
| 2.6 质粒提取及检测 | 第41-42页 |
| 2.7 双酶切法构建载体 | 第42-45页 |
| 2.8 棉花幼苗VIGS方法 | 第45页 |
| 2.9 沉默后盐胁迫处理 | 第45页 |
| 2.10 沉默植株胁迫处理后相应生理指标的测定 | 第45-47页 |
| 3 结果与分析 | 第47-57页 |
| 3.1 陆地棉中内含子标记和耐盐性状关联分析 | 第47-51页 |
| 3.2 候选基因的表达分析 | 第51-52页 |
| 3.3 候选基因的沉默 | 第52-54页 |
| 3.4 五个基因耐盐功能鉴定 | 第54-57页 |
| 4 讨论 | 第57-60页 |
| 全文结论 | 第60-62页 |
| 附录 | 第62-66页 |
| 参考文献 | 第66-74页 |
| 致谢 | 第74-76页 |
| 攻读硕士期间发表论文 | 第76页 |