| 摘要 | 第3-9页 |
| ABSTRACT | 第9-14页 |
| 第一章 前言 | 第18-21页 |
| 第二章 2009～2013年深圳市手足口病的病原谱调查 | 第21-45页 |
| 2.1 实验材料 | 第21-23页 |
| 2.1.1 研究对象 | 第21页 |
| 2.1.2 实验所需主要试剂 | 第21-22页 |
| 2.1.3 实验主要仪器 | 第22-23页 |
| 2.2 实验方法 | 第23-36页 |
| 2.2.1 样本的前处理 | 第23-24页 |
| 2.2.2 RNA的提取 | 第24页 |
| 2.2.3 Real time RT-PCR检测EV71、CA16和通用肠道病毒 | 第24-25页 |
| 2.2.4 RT-snPCR检测通用肠道病毒型别 | 第25-28页 |
| 2.2.5 RT-PCR扩增EV71 VP1全序列 | 第28-29页 |
| 2.2.6 RT-PCR扩增CA16VP1序列 | 第29-31页 |
| 2.2.7 Real time RT-PCR检测 CA6、CA10和CA4 | 第31-34页 |
| 2.2.8 病毒分离培养 | 第34-36页 |
| 2.2.9 病毒株的鉴定 | 第36页 |
| 2.2.10 统计分析 | 第36页 |
| 2.3 实验结果 | 第36-42页 |
| 2.3.1 2009～2013年深圳市手足口病患者人口学特征 | 第36-37页 |
| 2.3.2 2009～2013年深圳市手足口病病原谱 | 第37-42页 |
| 2.4 讨论 | 第42-44页 |
| 2.5 小结 | 第44-45页 |
| 第三章 肠道病毒病原体的同源性比较和遗传进化分析 | 第45-54页 |
| 3.1 材料 | 第45页 |
| 3.1.1 分析所用序列 | 第45页 |
| 3.1.2 分析所用软件 | 第45页 |
| 3.2 方法 | 第45-46页 |
| 3.2.1 序列拼接 | 第45页 |
| 3.2.2 序列信息 | 第45页 |
| 3.2.3 核苷酸和氨基酸同源性比对 | 第45页 |
| 3.2.4 系统进化树构建 | 第45-46页 |
| 3.3 结果 | 第46-51页 |
| 3.3.1 EV71 VP1核苷酸和氨基酸同源性 | 第46页 |
| 3.3.2 CA6 VP1核苷酸和氨基酸同源性 | 第46-47页 |
| 3.3.3 EV71系统进化分析 | 第47-49页 |
| 3.3.4 CA6系统进化分析 | 第49-51页 |
| 3.4 讨论 | 第51-53页 |
| 3.5 小结 | 第53-54页 |
| 第四章 不同肠道病毒与临床症状关系 | 第54-74页 |
| 4.1 EV71感染与临床特征关系 | 第55-59页 |
| 4.2 CA16感染与临床特征关系 | 第59-61页 |
| 4.3 EV71和CA16混合感染与临床特征关系 | 第61-62页 |
| 4.4 CA 6感染与临床特征关系 | 第62-63页 |
| 4.5 CA10感染与临床特征关系 | 第63-65页 |
| 4.6 其它肠道病毒A组病毒感染与临床特征关系 | 第65-67页 |
| 4.7 B组肠道病毒感染与临床特征关系 | 第67-71页 |
| 4.8 C组肠道病毒感染与临床特征关系 | 第71页 |
| 4.9 讨论 | 第71-73页 |
| 4.10 小结 | 第73-74页 |
| 全文小结 | 第74-75页 |
| 参考文献 | 第75-83页 |
| 攻读硕士期间的研究成果 | 第83-84页 |
| 附录一: 深圳市肠病毒标本送检单 | 第84-85页 |
| 附录二: 英文缩写注释 | 第85-86页 |
| 附录三: 2009～2013年深圳市手足口病病原谱 | 第86-89页 |
| 附录四: 2009～2013年深圳市重症手足口病病原谱 | 第89-90页 |
| 附录五: 2009～2013年深圳市轻症手足口病病原谱 | 第90-92页 |
| 致谢 | 第92-93页 |
