| 致谢 | 第5-11页 |
| 摘要 | 第11-14页 |
| 1.文献综述 | 第14-22页 |
| 1.1 转录组学 | 第14-17页 |
| 1.1.1 基于新一代测序技术的高通量转录组学研究方法 | 第14-17页 |
| 1.1.1.1 第一代测序技术 | 第14页 |
| 1.1.1.2 第二代测序技术 | 第14-16页 |
| 1.1.1.3 第三代测序技术 | 第16-17页 |
| 1.2 能量限制 | 第17-19页 |
| 1.2.1 能量限制的研究现状 | 第17页 |
| 1.2.2 能量限制在鸡生产中的应用 | 第17-19页 |
| 1.2.2.1 能量限制目的及意义 | 第17-18页 |
| 1.2.2.2 能量限制对肉鸡生产性能、免疫机能及基因表达的影响 | 第18-19页 |
| 1.3 鸡的免疫系统概述及脾脏的免疫功能 | 第19-20页 |
| 1.3.1 鸡的免疫系统概述 | 第19-20页 |
| 1.3.2 脾脏的免疫功能 | 第20页 |
| 1.4 TNFSF13B研究进展 | 第20-22页 |
| 1.4.1 TNFSF13B与B细胞发育 | 第20-21页 |
| 1.4.2 TNFSF13B与自身免疫性疾病 | 第21页 |
| 1.4.3 TNFSF13B与其他疾病 | 第21-22页 |
| 2 引言 | 第22-23页 |
| 3 试验一能量限制对肉鸡生长性能及免疫机能的影响 | 第23-33页 |
| 3.1 材料与方法 | 第23-26页 |
| 3.1.1 试验动物与分组 | 第23页 |
| 3.1.2 试验动物饲养管理 | 第23页 |
| 3.1.3 试验饲粮配制与饲喂方式 | 第23-24页 |
| 3.1.4 日粮配方及营养水平 | 第24-25页 |
| 3.1.5 样品采集和制备 | 第25页 |
| 3.1.5.1 组织样品的制备 | 第25页 |
| 3.1.5.2 血样的采集及处理 | 第25页 |
| 3.1.5.3 血清制备 | 第25页 |
| 3.1.5.4 淋巴细胞的分离提取 | 第25页 |
| 3.1.6 测定指标和方法 | 第25-26页 |
| 3.1.6.1 生产性能 | 第25-26页 |
| 3.1.6.2 免疫器官指数的测定和计算 | 第26页 |
| 3.1.6.3 T淋巴细胞的测定 | 第26页 |
| 3.1.6.4 血清中免疫球蛋白的测定 | 第26页 |
| 3.1.6.5 血清生化指标测定 | 第26页 |
| 3.1.7 数据统计与分析 | 第26页 |
| 3.2 结果与分析 | 第26-29页 |
| 3.2.1 能量限制对肉鸡产性能的影响 | 第26-27页 |
| 3.2.2 能量限制对肉鸡免疫器官指数的影响 | 第27-28页 |
| 3.2.3 能量限制对肉鸡血清中免疫球蛋白的影响 | 第28页 |
| 3.2.4 能量限制对T-淋巴细胞亚群的影响 | 第28-29页 |
| 3.2.5 能量限制对血清生化指标的影响 | 第29页 |
| 3.3 讨论 | 第29-32页 |
| 3.3.1 能量限制对肉鸡生产性能的影响 | 第29-30页 |
| 3.3.2 能量限制对肉鸡免疫功能的影响 | 第30-31页 |
| 3.3.2.1 对免疫器官指数的影响 | 第30页 |
| 3.3.2.2 能量限制对肉鸡血清中免疫球蛋白的影响 | 第30-31页 |
| 3.3.2.3 能量限制对T-淋巴细胞亚群的影响 | 第31页 |
| 3.3.3 能量限制对血清生化指标的影响 | 第31-32页 |
| 3.4 小结 | 第32-33页 |
| 4 试验二能量限制致鸡脾脏差异表达基因的功能注释及分析 | 第33-76页 |
| 4.1 材料与方法 | 第33-39页 |
| 4.1.1 试验动物与分组 | 第33页 |
| 4.1.2 试验动物饲养管理 | 第33页 |
| 4.1.3 试验饲粮配制与饲喂方式 | 第33页 |
| 4.1.4 日粮配方及营养水平 | 第33页 |
| 4.1.5 样品采集和制备 | 第33-34页 |
| 4.1.6 测定指标和方法 | 第34页 |
| 4.1.6.1 脾脏总RNA的提取及质量检测 | 第34页 |
| 4.1.7 cDNA链特异性文库构建和测序 | 第34-35页 |
| 4.1.8 测序数据评估与分析 | 第35页 |
| 4.1.9 差异基因数据分析 | 第35-36页 |
| 4.1.10 实时荧光定量(RT-qPCR)检测 | 第36-39页 |
| 4.2 结果与分析 | 第39-71页 |
| 4.2.1 脾脏总RNA的质量及电泳结果 | 第39-40页 |
| 4.2.2 原始序列数据 | 第40页 |
| 4.2.3 测序数据质量评估 | 第40-42页 |
| 4.2.4 参考序列比对分析 | 第42-45页 |
| 4.2.5 基因表达水平分析 | 第45页 |
| 4.2.6 RNA-seq整体质量评估 | 第45-46页 |
| 4.2.7 基因差异表达分析 | 第46-71页 |
| 4.2.7.1 不同处理间基因表达水平对比 | 第46-47页 |
| 4.2.7.2 不同处理间差异表达基因列表及功能注释 | 第47-59页 |
| 4.2.7.3 不同能量限制梯度间共同差异表达基因列表及功能注释 | 第59-61页 |
| 4.2.7.4 不同处理间差异表达基因聚类分析 | 第61-62页 |
| 4.2.7.5 差异基因GO富集分析 | 第62-66页 |
| 4.2.7.6 差异基因KEGG富集分析 | 第66-71页 |
| 4.2.8 实时荧光定量验证分析(qRT-PCR) | 第71页 |
| 4.3 讨论 | 第71-75页 |
| 4.3.1 28 日龄肉鸡脾脏差异基因分析 | 第72-73页 |
| 4.3.2 42 日龄肉鸡脾脏差异基因分析 | 第73-75页 |
| 4.4 小结 | 第75-76页 |
| 5 试验三TNFSF13B基因调节肉鸡免疫作用机制研究 | 第76-83页 |
| 5.1 材料与方法 | 第76-79页 |
| 5.1.1 主要仪器及试剂 | 第76-77页 |
| 5.1.2 试验方法 | 第77-79页 |
| 5.1.3 数据分析 | 第79页 |
| 5.2 结果 | 第79-81页 |
| 5.2.1 TNFSF13B沉默效率的鉴定 | 第79-80页 |
| 5.2.2 TNNFSF13B调控NFκB和TGF-β基因的表达 | 第80-81页 |
| 5.2.3 TNNFSF13B调控NFκBp65和NFκBpP65蛋白的表达 | 第81页 |
| 5.3 讨论 | 第81-82页 |
| 5.3.1 TNFSF13B调控NFκB和TGF-β表达分析 | 第81-82页 |
| 5.3.2 TNFSF13B调控NFκBp65和NFκBPp65蛋白表达分析 | 第82页 |
| 5.4 小结 | 第82-83页 |
| 6 全文总结及展望 | 第83-84页 |
| 6.1 全文总结 | 第83页 |
| 6.2 展望 | 第83-84页 |
| 7.本研究创新点 | 第84-85页 |
| 参考文献 | 第85-98页 |
| abstract | 第98-100页 |
| 附录一 常用词语缩写 | 第101-102页 |
| 附录二 技术路线图 | 第102页 |
