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基于转录组学分析的饲粮能量限制调控肉鸡免疫机能的分子机理

致谢第5-11页
摘要第11-14页
1.文献综述第14-22页
    1.1 转录组学第14-17页
        1.1.1 基于新一代测序技术的高通量转录组学研究方法第14-17页
            1.1.1.1 第一代测序技术第14页
            1.1.1.2 第二代测序技术第14-16页
            1.1.1.3 第三代测序技术第16-17页
    1.2 能量限制第17-19页
        1.2.1 能量限制的研究现状第17页
        1.2.2 能量限制在鸡生产中的应用第17-19页
            1.2.2.1 能量限制目的及意义第17-18页
            1.2.2.2 能量限制对肉鸡生产性能、免疫机能及基因表达的影响第18-19页
    1.3 鸡的免疫系统概述及脾脏的免疫功能第19-20页
        1.3.1 鸡的免疫系统概述第19-20页
        1.3.2 脾脏的免疫功能第20页
    1.4 TNFSF13B研究进展第20-22页
        1.4.1 TNFSF13B与B细胞发育第20-21页
        1.4.2 TNFSF13B与自身免疫性疾病第21页
        1.4.3 TNFSF13B与其他疾病第21-22页
2 引言第22-23页
3 试验一能量限制对肉鸡生长性能及免疫机能的影响第23-33页
    3.1 材料与方法第23-26页
        3.1.1 试验动物与分组第23页
        3.1.2 试验动物饲养管理第23页
        3.1.3 试验饲粮配制与饲喂方式第23-24页
        3.1.4 日粮配方及营养水平第24-25页
        3.1.5 样品采集和制备第25页
            3.1.5.1 组织样品的制备第25页
            3.1.5.2 血样的采集及处理第25页
            3.1.5.3 血清制备第25页
            3.1.5.4 淋巴细胞的分离提取第25页
        3.1.6 测定指标和方法第25-26页
            3.1.6.1 生产性能第25-26页
            3.1.6.2 免疫器官指数的测定和计算第26页
            3.1.6.3 T淋巴细胞的测定第26页
            3.1.6.4 血清中免疫球蛋白的测定第26页
            3.1.6.5 血清生化指标测定第26页
        3.1.7 数据统计与分析第26页
    3.2 结果与分析第26-29页
        3.2.1 能量限制对肉鸡产性能的影响第26-27页
        3.2.2 能量限制对肉鸡免疫器官指数的影响第27-28页
        3.2.3 能量限制对肉鸡血清中免疫球蛋白的影响第28页
        3.2.4 能量限制对T-淋巴细胞亚群的影响第28-29页
        3.2.5 能量限制对血清生化指标的影响第29页
    3.3 讨论第29-32页
        3.3.1 能量限制对肉鸡生产性能的影响第29-30页
        3.3.2 能量限制对肉鸡免疫功能的影响第30-31页
            3.3.2.1 对免疫器官指数的影响第30页
            3.3.2.2 能量限制对肉鸡血清中免疫球蛋白的影响第30-31页
            3.3.2.3 能量限制对T-淋巴细胞亚群的影响第31页
        3.3.3 能量限制对血清生化指标的影响第31-32页
    3.4 小结第32-33页
4 试验二能量限制致鸡脾脏差异表达基因的功能注释及分析第33-76页
    4.1 材料与方法第33-39页
        4.1.1 试验动物与分组第33页
        4.1.2 试验动物饲养管理第33页
        4.1.3 试验饲粮配制与饲喂方式第33页
        4.1.4 日粮配方及营养水平第33页
        4.1.5 样品采集和制备第33-34页
        4.1.6 测定指标和方法第34页
            4.1.6.1 脾脏总RNA的提取及质量检测第34页
        4.1.7 cDNA链特异性文库构建和测序第34-35页
        4.1.8 测序数据评估与分析第35页
        4.1.9 差异基因数据分析第35-36页
        4.1.10 实时荧光定量(RT-qPCR)检测第36-39页
    4.2 结果与分析第39-71页
        4.2.1 脾脏总RNA的质量及电泳结果第39-40页
        4.2.2 原始序列数据第40页
        4.2.3 测序数据质量评估第40-42页
        4.2.4 参考序列比对分析第42-45页
        4.2.5 基因表达水平分析第45页
        4.2.6 RNA-seq整体质量评估第45-46页
        4.2.7 基因差异表达分析第46-71页
            4.2.7.1 不同处理间基因表达水平对比第46-47页
            4.2.7.2 不同处理间差异表达基因列表及功能注释第47-59页
            4.2.7.3 不同能量限制梯度间共同差异表达基因列表及功能注释第59-61页
            4.2.7.4 不同处理间差异表达基因聚类分析第61-62页
            4.2.7.5 差异基因GO富集分析第62-66页
            4.2.7.6 差异基因KEGG富集分析第66-71页
        4.2.8 实时荧光定量验证分析(qRT-PCR)第71页
    4.3 讨论第71-75页
        4.3.1 28 日龄肉鸡脾脏差异基因分析第72-73页
        4.3.2 42 日龄肉鸡脾脏差异基因分析第73-75页
    4.4 小结第75-76页
5 试验三TNFSF13B基因调节肉鸡免疫作用机制研究第76-83页
    5.1 材料与方法第76-79页
        5.1.1 主要仪器及试剂第76-77页
        5.1.2 试验方法第77-79页
        5.1.3 数据分析第79页
    5.2 结果第79-81页
        5.2.1 TNFSF13B沉默效率的鉴定第79-80页
        5.2.2 TNNFSF13B调控NFκB和TGF-β基因的表达第80-81页
        5.2.3 TNNFSF13B调控NFκBp65和NFκBpP65蛋白的表达第81页
    5.3 讨论第81-82页
        5.3.1 TNFSF13B调控NFκB和TGF-β表达分析第81-82页
        5.3.2 TNFSF13B调控NFκBp65和NFκBPp65蛋白表达分析第82页
    5.4 小结第82-83页
6 全文总结及展望第83-84页
    6.1 全文总结第83页
    6.2 展望第83-84页
7.本研究创新点第84-85页
参考文献第85-98页
abstract第98-100页
附录一 常用词语缩写第101-102页
附录二 技术路线图第102页

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