| 摘要 | 第3-4页 |
| Abstract | 第4页 |
| 第1章 绪论 | 第8-11页 |
| 1.1 研究背景及意义 | 第8-9页 |
| 1.1.1 研究背景 | 第8-9页 |
| 1.1.2 研究意义 | 第9页 |
| 1.3 论文的主要工作及创新点 | 第9-10页 |
| 1.4 论文的组织结构 | 第10-11页 |
| 第2章 相关工作 | 第11-20页 |
| 2.1 基因序列及其搜索技术 | 第11-13页 |
| 2.1.1 基因序列相关介绍 | 第11-12页 |
| 2.1.2 基因序列搜索技术 | 第12-13页 |
| 2.2 基因序列索引结构 | 第13-15页 |
| 2.2.1 后缀树 | 第13-14页 |
| 2.2.2 后缀数组 | 第14-15页 |
| 2.2.3 其他索引结构 | 第15页 |
| 2.3 后缀树索引结构的建立 | 第15-19页 |
| 2.3.1 Ukkonen算法相关术语 | 第15-16页 |
| 2.3.2 Ukkonen算法设计 | 第16-19页 |
| 2.4 本章小结 | 第19-20页 |
| 第3章 基于LM-Suffix算法的后缀树索引结构 | 第20-36页 |
| 3.1 LM-Suffix算法思想 | 第20-21页 |
| 3.1.1 定义介绍 | 第20页 |
| 3.1.2 基本思想 | 第20-21页 |
| 3.2 LM-Suffix算法设计 | 第21-32页 |
| 3.2.1 长字符串划分为短字符串 | 第21-25页 |
| 3.2.2 确定分支结点 | 第25-29页 |
| 3.2.3 构造子后缀树 | 第29-32页 |
| 3.3 内存分配 | 第32-33页 |
| 3.4 LM-Suffix算法的搜索技术 | 第33-35页 |
| 3.5 本章小结 | 第35-36页 |
| 第4章 实验验证及分析 | 第36-41页 |
| 4.1 实验数据及实验环境 | 第36-37页 |
| 4.1.1 实验数据 | 第36页 |
| 4.1.2 实验环境 | 第36-37页 |
| 4.2 实验验证 | 第37-39页 |
| 4.2.1 索引建立 | 第37-39页 |
| 4.2.2 搜索方法 | 第39页 |
| 4.3 本章小结 | 第39-41页 |
| 第5章 总结与展望 | 第41-43页 |
| 5.1 工作总结 | 第41-42页 |
| 5.2 工作展望 | 第42-43页 |
| 参考文献 | 第43-45页 |
| 致谢 | 第45页 |