| 致谢 | 第6-8页 |
| 摘要 | 第8-10页 |
| ABSTRACT | 第10-11页 |
| 缩略词 | 第17-18页 |
| 第一章 文献综述 | 第18-44页 |
| 1.1 引言 | 第18-19页 |
| 1.2 遗传多样性的定义和研究方法 | 第19-23页 |
| 1.2.1 遗传多样性的定义 | 第19-20页 |
| 1.2.2 遗传结构及其影响因素 | 第20-23页 |
| 1.2.3 遗传多样性的研究方法 | 第23页 |
| 1.3 豇豆的起源、分类和驯化 | 第23-35页 |
| 1.3.1 豇豆的分类 | 第23-25页 |
| 1.3.2 野生豇豆的特点和分类 | 第25-26页 |
| 1.3.3 野生豇豆的起源 | 第26-29页 |
| 1.3.4 栽培豇豆的特点 | 第29-30页 |
| 1.3.5 栽培豇豆的驯化与传播 | 第30-31页 |
| 1.3.6 豇豆资源的收集与分子数据库的建立 | 第31-32页 |
| 1.3.7 豇豆基于分子标记的遗传多样性 | 第32-35页 |
| 1.4 基于连锁不平衡(LD)的基因定位 | 第35-44页 |
| 1.4.1 连锁不平衡(LD)的概念及原理 | 第35-37页 |
| 1.4.2 连锁不平衡(LD)的影响因素 | 第37-39页 |
| 1.4.3 关联分析的基本方法 | 第39-41页 |
| 1.4.4 关联分析在自交作物中的应用 | 第41-44页 |
| 第二章 豇豆表型性状遗传多样性研究 | 第44-63页 |
| 2.1 引言 | 第44-45页 |
| 2.2 材料与方法 | 第45-49页 |
| 2.2.1 试验材料 | 第45-46页 |
| 2.2.2 田间试验设计 | 第46页 |
| 2.2.3 形态性状调查 | 第46-48页 |
| 2.2.4 数据统计分析 | 第48-49页 |
| 2.3 结果与分析 | 第49-60页 |
| 2.3.1 数量性状在各群体中的分布,及多样性情况 | 第49-51页 |
| 2.3.2 质量性状在各群体中的分布,及多样性情况 | 第51-53页 |
| 2.3.3 豇豆农艺性状Shannon-weaver指数分析 | 第53-60页 |
| 2.3.3.1 各地理群体间表型多样性的关系 | 第54-56页 |
| 2.3.3.2 主成分分析 | 第56-57页 |
| 2.3.3.3 基于形态学性状的聚类分析 | 第57-60页 |
| 2.4 讨论与小结 | 第60-63页 |
| 2.4.1 形态性状分析 | 第60页 |
| 2.4.2 变异系数及Shannon-weaver指数 | 第60-61页 |
| 2.4.3 豇豆表型遗传多样性在地理类群中的分布 | 第61-62页 |
| 2.4.4 本章小结 | 第62-63页 |
| 第三章 基于SNP标记的豇豆遗传多样性研究 | 第63-80页 |
| 3.1 引言 | 第63页 |
| 3.2 材料与方法 | 第63-65页 |
| 3.2.1 供试材料 | 第63-64页 |
| 3.2.2 DNA提取与测序 | 第64页 |
| 3.2.3 数据分析 | 第64-65页 |
| 3.3 结果分析 | 第65-76页 |
| 3.3.1 SNP标记特征分析 | 第65页 |
| 3.3.2 群体结构 | 第65页 |
| 3.3.3 基因池分池 | 第65-68页 |
| 3.3.4 地区间遗传多样性分析 | 第68-69页 |
| 3.3.5 基于SNP标记的主成分分析 | 第69-72页 |
| 3.3.5.1 基于群体结构分组的主成份分析 | 第69-72页 |
| 3.3.5.2 基于地理标记的主成份分析 | 第72页 |
| 3.3.6 系统树的构建 | 第72-76页 |
| 3.4 讨论与小结 | 第76-80页 |
| 3.4.1 SNP在本研究中的应用 | 第76-77页 |
| 3.4.2 豇豆各类群的遗传关系 | 第77-79页 |
| 3.4.3 本章小结 | 第79-80页 |
| 第四章 豇豆若干农艺性状关联分析 | 第80-101页 |
| 4.1 引言 | 第80-82页 |
| 4.2 材料方法 | 第82页 |
| 4.2.1 实验材料、地点和田间试验设计 | 第82页 |
| 4.2.2 表型数据收集和基因型鉴定 | 第82页 |
| 4.2.3 统计分析 | 第82页 |
| 4.2.3.1 表型分析 | 第82页 |
| 4.2.3.2 群体结构分析 | 第82页 |
| 4.2.3.3 LD的衡量及关联分析 | 第82页 |
| 4.3 结果分析 | 第82-92页 |
| 4.3.1 各亚群的表型分析 | 第82-85页 |
| 4.3.2 各亚群基因型分析 | 第85-86页 |
| 4.3.3 群体及各亚群的LD分析 | 第86-87页 |
| 4.3.4 关联分析 | 第87-92页 |
| 4.3.4.1 模型比较 | 第87页 |
| 4.3.4.2 普通线性模型(GLM)的关联分析 | 第87-89页 |
| 4.3.4.3 混合线性模型(MLM)的关联分析 | 第89-92页 |
| 4.3.4.4 显著相关标记簇分析 | 第92页 |
| 4.4 分析与讨论 | 第92-101页 |
| 4.4.1 表型性状的变异及广义遗传力 | 第92-93页 |
| 4.4.2 群体分析 | 第93-98页 |
| 4.4.3 基因型数据对LD及关联模型的影响 | 第98-99页 |
| 4.4.4 关联分析 | 第99-100页 |
| 4.4.5 本章小结 | 第100-101页 |
| 参考文献 | 第101-111页 |
| 附图/表 | 第111-150页 |
| 个人简历 | 第150页 |
