| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第一章 绪论 | 第11-45页 |
| 1.1 核酸 | 第11-18页 |
| 1.1.1 DNA的组成 | 第11-12页 |
| 1.1.2 DNA的双螺旋结构 | 第12-14页 |
| 1.1.3 特殊DNA二级结构 | 第14-17页 |
| 1.1.4 核酸的紫外吸收特性 | 第17页 |
| 1.1.5 DNA分子的解链温度 | 第17-18页 |
| 1.2 DNA甲基化 | 第18-36页 |
| 1.2.1 表观遗传学 | 第18-19页 |
| 1.2.2 DNA甲基化与去甲基化 | 第19-25页 |
| 1.2.2.1 5-甲基胞嘧啶 | 第19-21页 |
| 1.2.2.2 甲基转移酶 | 第21-22页 |
| 1.2.2.3 去甲基化酶 | 第22-25页 |
| 1.2.3 DNA甲基化与疾病 | 第25-26页 |
| 1.2.4 甲基胞嘧啶的检测 | 第26-36页 |
| 1.2.4.1 限制性内切酶法 | 第28-29页 |
| 1.2.4.2 免疫沉淀法 | 第29-30页 |
| 1.2.4.3 亚硫酸氢钠法 | 第30-32页 |
| 1.2.4.4 化学法 | 第32-34页 |
| 1.2.4.5 其他检测方法 | 第34-36页 |
| 1.3 链交换反应 | 第36-45页 |
| 1.3.1 同源重组修复中的链交换反应 | 第36-39页 |
| 1.3.2 Toehold策略的链交换反应 | 第39-40页 |
| 1.3.3 其他链交换反应策略 | 第40-45页 |
| 第二章 课题设计 | 第45-51页 |
| 2.1 背景 | 第45页 |
| 2.2 构思 | 第45-47页 |
| 2.3 实验设计 | 第47-51页 |
| 2.3.1 实验序列选择 | 第47-48页 |
| 2.3.2 检测方法 | 第48-49页 |
| 2.3.3 分析方法 | 第49-50页 |
| 2.3.4 实验内容 | 第50-51页 |
| 第三章 基于链交换反应的甲基化检测方法 | 第51-98页 |
| 3.1 梗概 | 第51页 |
| 3.2 仪器与试剂 | 第51-55页 |
| 3.2.1 仪器 | 第51-52页 |
| 3.2.2 试剂 | 第52-54页 |
| 3.2.3 常用实验用品的制备 | 第54-55页 |
| 3.3 链交换反应实验流程 | 第55-56页 |
| 3.4 链交换反应结果分析方法 | 第56-60页 |
| 3.4.1 凝胶电泳结果分析 | 第56-58页 |
| 3.4.2 链交换反应产率的计算方法 | 第58-60页 |
| 3.5 影响链交换反应的因素 | 第60-73页 |
| 3.5.1 孵育温度对链交换反应的影响 | 第60-61页 |
| 3.5.2 孵育时间和探针相对浓度对链交换反应的影响 | 第61-62页 |
| 3.5.3 探针链长度对链交换反应的影响 | 第62-63页 |
| 3.5.4 PEG200体积分数对链交换反应的影响 | 第63-64页 |
| 3.5.5 pH对链交换反应的影响 | 第64-65页 |
| 3.5.6 盐浓度对链交换反应的影响 | 第65-66页 |
| 3.5.7 缓冲液组分对链交换反应的影响 | 第66-67页 |
| 3.5.8 小结与讨论 | 第67-73页 |
| 3.5.8.1 链交换反应中各反应条件的选择 | 第67-71页 |
| 3.5.8.2 聚乙二醇对链交换反应的影响 | 第71-73页 |
| 3.6 邻近双位点的5-甲基胞嘧啶的检测 | 第73-76页 |
| 3.6.1 邻近甲基化位点检测的实验设计思路 | 第73-74页 |
| 3.6.2 实验结果与分析 | 第74-76页 |
| 3.7 多个甲基化位点的同时检测 | 第76-80页 |
| 3.7.1 多甲基化位点检测的实验设计思路 | 第76页 |
| 3.7.2 实验结果及分析 | 第76-79页 |
| 3.7.3 本节小结 | 第79-80页 |
| 3.8 链交换反应动力学研究 | 第80-82页 |
| 3.8.1 FRET实验原理 | 第80页 |
| 3.8.2 FRET实验设计 | 第80-81页 |
| 3.8.3 FRET实验结果及分析 | 第81-82页 |
| 3.9 链交换产物结构 | 第82-90页 |
| 3.9.1 引言 | 第82-83页 |
| 3.9.2 短链DNA的链交换产物结构 | 第83-87页 |
| 3.9.3 长链DNA的链交换产物结构 | 第87-89页 |
| 3.9.4 本节小结 | 第89-90页 |
| 3.10 解链温度测定实验 | 第90-92页 |
| 3.11 讨论 | 第92-98页 |
| 全文总结 | 第98-99页 |
| 参考文献 | 第99-115页 |
| 攻读博士期间发表论文 | 第115-116页 |
| 致谢 | 第116页 |