| 摘要 | 第4-7页 |
| Abstract | 第7-11页 |
| 第1章 绪论 | 第16-28页 |
| 1.1 引言 | 第16页 |
| 1.2 细胞色素 P450 的由来与发展 | 第16-17页 |
| 1.3 细胞色素 P450 的催化循环概述 | 第17-21页 |
| 1.4 P450 催化反应类型简述 | 第21页 |
| 1.5 反弹机制与双自旋态反应性机制 | 第21-24页 |
| 1.6 单电子转移机理和氢原子转移机理 | 第24-25页 |
| 1.7 本论文的主要内容 | 第25-28页 |
| 第2章 理论基础与计算方法 | 第28-46页 |
| 2.1 引言 | 第28-29页 |
| 2.2 量子力学理论 | 第29-32页 |
| 2.2.1 薛定格方程 | 第29-30页 |
| 2.2.2 波恩-奥本海默（Born-Oppenheimer）近似 | 第30页 |
| 2.2.3 单电子近似与 Hartree-Fock 近似 | 第30-32页 |
| 2.3 密度泛函理论（DFT） | 第32-38页 |
| 2.3.1 Thomas-Fermi 模型 | 第32-33页 |
| 2.3.2 Hohenberg-Kohn 定理 | 第33-34页 |
| 2.3.3 Kohn-Sham 方法 | 第34-37页 |
| 2.3.4 近似泛函所存在的问题 | 第37-38页 |
| 2.3.4.1 自相互作用错误与离域化错误 | 第37-38页 |
| 2.3.4.2 静态相关错误 | 第38页 |
| 2.4 过渡态理论 | 第38-46页 |
| 2.4.1 Eyring 方程的应用 | 第41-46页 |
| 第3章 细胞色素 P450 酶催化四氯化碳还原性代谢及其对 P450 酶自杀性抑制的理论研究 | 第46-62页 |
| 3.1 引言 | 第46-49页 |
| 3.2 计算方法 | 第49页 |
| 3.3 计算结果与讨论 | 第49-59页 |
| 3.3.1 三氯甲基自由基的生成 | 第50-55页 |
| 3.3.2 二氯卡宾的生成 | 第55-58页 |
| 3.3.3 三氯甲基自由基对 P450 的破坏 | 第58-59页 |
| 3.4 结论 | 第59-62页 |
| 第4章 细胞色素 P4502C8 催化全反式维甲酸 4-位羟基化代谢的理论研究 | 第62-84页 |
| 4.1 引言 | 第62-65页 |
| 4.2 计算方法 | 第65-67页 |
| 4.2.1 分子对接计算 | 第65页 |
| 4.2.2 量化计算 | 第65-67页 |
| 4.3 结果与讨论 | 第67-82页 |
| 4.3.1 分子对接 | 第67-70页 |
| 4.3.2 量化计算 | 第70-82页 |
| 4.3.2.1 自相互错误问题 | 第70-72页 |
| 4.3.2.2 模型 1 中碳-氢键的羟基化 | 第72-78页 |
| 4.3.2.3 模型 2 中 C-H 键的羟基化 | 第78-82页 |
| 4.4 结论 | 第82-84页 |
| 第5章 细胞色素 P450 酶介导 1,4-二氢吡啶 4-烷基取代衍生物的生物活化 | 第84-102页 |
| 5.1 引言 | 第84-86页 |
| 5.2 计算方法 | 第86-88页 |
| 5.3 结果与讨论 | 第88-100页 |
| 5.3.1 氮-氢键的活化 | 第88-91页 |
| 5.3.2 DDEP 的脱乙基反应 | 第91-95页 |
| 5.3.3 取代基对反应的影响 | 第95-100页 |
| 5.4 结论 | 第100-102页 |
| 第6章 细胞色素 P450 酶对 1-甲基-4-苯基-1,2,3,6-四氢吡啶解毒作用的理论研究 | 第102-122页 |
| 6.1 引言 | 第102-104页 |
| 6.2 计算方法 | 第104-106页 |
| 6.3 结果与讨论 | 第106-119页 |
| 6.3.1 Cpd I 催化 MPTP 进行 N-去甲基反应 | 第106-111页 |
| 6.3.1.1 羟胺的生成 | 第106-110页 |
| 6.3.1.2 羟胺的进一步降解 | 第110-111页 |
| 6.3.2 MPTP 在 Cpd I 作用下的芳基羟基化反应 | 第111-119页 |
| 6.3.2.1 Cpd I 对底物的加成 | 第112-115页 |
| 6.3.2.2 重排过程 | 第115-119页 |
| 6.4 结论 | 第119-122页 |
| 参考文献 | 第122-162页 |
| 个人简介以及攻读博士学位期间取得的科研成果 | 第162-164页 |
| 致谢 | 第164页 |
