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基于生物组学的羟基磷灰石骨诱导机理研究

摘要第4-6页
Abstract第6-8页
英文缩写词表第9-14页
第一章 绪论第14-64页
    1.1 硬组织修复材料研究进展第14-19页
        1.1.1 硬组织修复材料概述第14-15页
        1.1.2 硬组织修复用无机生物材料第15-17页
        1.1.3 硬组织修复用金属材料第17页
        1.1.4 硬组织修复用高分子材料第17-18页
        1.1.5 硬组织修复用复合材料第18-19页
    1.2 羟基磷灰石研究进展第19-23页
        1.2.1 羟基磷灰石的骨传导性和骨诱导性第19-21页
        1.2.2 羟基磷灰石成骨诱导的研究方法第21-22页
        1.2.3 羟基磷灰石的来源及其比较第22-23页
    1.3 间充质干细胞及其成骨分化研究进展第23-35页
        1.3.1 间充质干细胞的来源、提取方法及表面标志物第24-29页
        1.3.2 间充质干细胞的培养第29-30页
        1.3.3 间充质干细胞的分化潜能及各分化方向标志物第30-34页
        1.3.4 国内关于小鼠骨髓间充质干细胞的分离、提取及分化的相关研究第34-35页
    1.4 蛋白质组学技术及其生物信息学分析第35-42页
        1.4.1 蛋白质组学简介第35-36页
        1.4.2 蛋白质组学研究的主要技术手段第36-38页
        1.4.3 蛋白质组学数据的生物信息学分析第38-41页
        1.4.4 系统生物学及不同组学数据的生物信息学联合分析第41-42页
    1.5 microRNA及其在成骨中的调节作用研究进展第42-44页
        1.5.1 microRNA简介第42-43页
        1.5.2 microRNA的研究方法第43-44页
        1.5.3 microRNA在成骨中的调节作用进展第44页
    1.6 本论文的工作基础和主要研究内容第44-46页
        1.6.1 本课题组前期工作基础第45页
        1.6.2 本文主要研究内容第45-46页
    1.7 参考文献第46-64页
第一部分 天然和合成羟基磷灰石理化性质及生物学性能的比较研究第64-162页
    第二章 天然与合成羟基磷灰石材料的制备与表征第64-79页
        2.1 天然和合成羟基磷灰石粉体及圆盘状试样的制备第64-67页
            2.1.1 实验材料与仪器第64-65页
            2.1.2 实验方法第65-67页
        2.2 天然和合成羟基磷灰石圆盘状试样的表征第67-76页
            2.2.1 实验材料与仪器第67-68页
            2.2.2 试验方法第68-70页
            2.2.3 结果与讨论第70-76页
        2.3 本章小结第76-77页
        2.4 参考文献第77-79页
    第三章 培养于天然与合成羟基磷灰石表面的骨髓间充质干细胞的细胞学研究第79-93页
        3.1 小鼠骨髓间充质干细胞的分离与提取第79-85页
            3.1.1 实验材料与仪器第79-81页
            3.1.2 小鼠骨髓间充质干细胞的分离与培养第81-83页
            3.1.3 骨髓间充质干细胞的流式细胞鉴定第83页
            3.1.4 结果与讨论第83-85页
        3.2 小鼠骨髓间充质干细胞在天然与合成羟基磷灰石圆盘状试样表面的生长与增殖情况检测第85-90页
            3.2.1 实验材料与仪器第85-87页
            3.2.2 细胞在材料表面生长形态的荧光观察第87页
            3.2.3 天然与合成羟基磷灰石表面生长细胞的增殖测定第87-88页
            3.2.4 统计分析第88页
            3.2.5 实验结果与讨论第88-90页
        3.3 本章小结第90-91页
        3.4 参考文献第91-93页
    第四章 天然与合成羟基磷灰石表面生长细胞的蛋白质组学实验及Western blot验证第93-108页
        4.1 蛋白质组学预实验第93-99页
            4.1.1 实验材料与仪器第93-94页
            4.1.2 总蛋白提取及蛋白质组学预实验第94-97页
            4.1.3 蛋白质组学实验中外源高丰度蛋白质的去除实验第97-99页
        4.2 基于iTRAQ标记的二维液相色谱串联质谱联用技术的蛋白质组学实验第99-103页
            4.2.1 实验原理第99-100页
            4.2.2 天然与合成羟基磷灰石圆盘状试样表面的细胞培养与蛋白质收集第100-101页
            4.2.3 基于iTRAQ标记的二维液相色谱串联质谱联用技术的蛋白质组学实验方法第101页
            4.2.4 结果与讨论第101-103页
        4.3 蛋白质组学实验的Western blot验证试验第103-105页
            4.3.1 原理第103页
            4.3.2 Western blot验证试验蛋白质的选择第103-104页
            4.3.3 实验材料与仪器第104页
            4.3.4 实验方法第104页
            4.3.5 结果与讨论第104-105页
        4.4 本章小结第105-106页
        4.5 参考文献第106-108页
    第五章 蛋白质组学实验数据的生物信息学分析第108-162页
        5.1 蛋白质组学数据的聚类分析第108-110页
            5.1.1 聚类分析及其分析步骤第108页
            5.1.2 聚类分析结果与讨论第108-110页
        5.2 染色体定位分析第110-112页
            5.2.1 染色体定位分析及其分析方法第110页
            5.2.2 染色体定位分析的结果与讨论第110-112页
        5.3 蛋白质组学数据的Gene Ontology(GO)分析第112-131页
            5.3.1 GO分析及其分析方法第112-113页
            5.3.2 GOSurfer软件分析结果第113-122页
            5.3.3 DAVID分析结果第122-131页
        5.4 蛋白质组学数据的生物学通路分析第131-140页
            5.4.1 生物学通路分析及其分析方法第131-132页
            5.4.2 生物学通路分析结果第132-140页
        5.5 蛋白质组学试验数据的IPA网络分析第140-155页
            5.5.1 蛋白质相互作用网络分析方法第140-141页
            5.5.2 蛋白质相互作用网络分析结果与讨论第141-155页
        5.6 天然与合成羟基磷灰石理化性质与生物学性能的综合分析及验证第155-159页
            5.6.1 天然与合成羟基磷灰石理化性质与生物学性能的综合分析第155-156页
            5.6.2 天然与合成羟基磷灰石矿化性能的验证和比较第156-159页
        5.7 本章小结第159-160页
        5.8 参考文献第160-162页
第二部分 天然羟基磷灰石成骨诱导机理的转录组学、蛋白质组学和microRNA联合分析第162-224页
    第六章 天然羟基磷灰石对骨髓间充质干细胞作用的蛋白质组学和基因表达谱芯片数据的比较与联合分析第162-184页
        6.1 基因表达谱芯片和蛋白质组学数据介绍第162-164页
            6.1.1 本课题组前期基因表达谱芯片实验结果第162-164页
            6.1.2 天然羟基磷灰石对细胞影响的蛋白质组学实验结果介绍第164页
        6.2 蛋白质组学和基因表达谱芯片数据的比较研究第164-167页
            6.2.1 基因表达谱芯片与蛋白质组学整体数据比较第164-165页
            6.2.2 基因表达谱芯片与蛋白质组学数据的相关性分析第165-166页
            6.2.3 基因表达谱芯片与蛋白质组学数据的组蛋白表达情况比较第166-167页
        6.3 基因表达谱芯片与蛋白质组学数据的GO功能分析与比较第167-171页
            6.3.1 GO分析方法第167页
            6.3.2 GO分析结果与讨论第167-171页
        6.4 基因表达谱芯片与蛋白质组学数据中成骨相关功能节点的对比第171-175页
            6.4.1 成骨相关功能节点的分析方法第171页
            6.4.2 结果与讨论第171-175页
        6.5 蛋白质组学与基因表达谱芯片实验数据的生物学通路联合分析第175-181页
            6.5.1 蛋白质组学与基因表达谱芯片实验数据的生物学通路联合分析方法第175-176页
            6.5.2 结果与讨论第176-181页
        6.6 本章小结第181-182页
        6.7 参考文献第182-184页
    第七章 microRNA在天然羟基磷灰石成骨诱导中的调节作用分析第184-200页
        7.1 实验材料与仪器第184-186页
            7.1.1 实验材料第184-185页
            7.1.2 实验仪器第185-186页
            7.1.3 溶液配制第186页
        7.2 microRNA表达情况的qRT-PCR实验检测第186-190页
            7.2.1 microRNA引物的设计和合成第186-187页
            7.2.2 细胞培养与总RNA提取第187-188页
            7.2.3 反转录反应第188-189页
            7.2.4 实时PCR反应第189页
            7.2.5 基因相对表达比值计算第189-190页
        7.3 统计分析第190页
        7.4 结果与讨论第190-197页
            7.4.1 microRNA的扩增曲线、溶解曲线第190-191页
            7.4.2 microRNA的相对表达值第191页
            7.4.3 microRNA调控模式分析第191-196页
            7.4.4 天然羟基磷灰石诱导骨髓间充质干细胞成骨分化通路与机理分析第196-197页
        7.5 本章小结第197-198页
        7.6 参考文献第198-200页
    第八章 天然羟基磷灰石成骨诱导能力的实验验证第200-217页
        8.1 不同因素诱导骨髓间充质干细胞的成骨分化能力的碱性磷酸酶酶检测第200-204页
            8.1.1 实验原理第200-201页
            8.1.2 实验材料与仪器第201-202页
            8.1.3 试验方法第202-203页
            8.1.4 实验结果与讨论第203-204页
        8.2 天然羟基磷灰石成骨诱导通路的验证第204-215页
            8.2.1 实验原理第204-205页
            8.2.2 实验材料与仪器第205-206页
            8.2.3 特异性通路阻断剂适宜浓度的选择实验第206-208页
            8.2.4 通路阻断剂对成骨特异性标志物的影响分析第208-215页
        8.3 本章小结第215页
        8.4 参考文献第215-217页
    第九章 总结和展望第217-224页
        9.1 全文工作总结第217-222页
        9.2 展望第222-223页
        9.3 参考文献第223-224页
在校期间发表论文情况第224-225页
致谢第225-226页
附录第226-235页
    附录1 细胞蛋白质的二维凝胶电泳实验(上海中科新生命生物公司提供)第226页
    附录2 基于iTRAQ标记的蛋白质组学实验方法(上海博苑生物公司提供)第226-231页
    附录3 Western blot实验方法(南京颂悦生物公司提供)第231-235页

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