摘要 | 第6-8页 |
Abstract | 第8-9页 |
缩略词表 | 第10-11页 |
1 前言 | 第11-23页 |
1.1 遗传作图群体 | 第11-15页 |
1.1.1 传统双亲作图群体 | 第12-14页 |
1.1.2 自然群体 | 第14-15页 |
1.1.3 下一代作图群体 | 第15页 |
1.2 MAGIC群体的提出及其研究进展 | 第15-16页 |
1.3 油菜QTL定位方法及研究进展 | 第16-19页 |
1.3.1 连锁分析在油菜QTL研究中的应用 | 第16-18页 |
1.3.2 关联分析在油菜QTL研究中的应用 | 第18-19页 |
1.4 MAGIC群体在QTL定位研究中的应用 | 第19-20页 |
1.5 SNP在芸薹属植物基因组研究中的应用进展 | 第20-22页 |
1.6 本研究的目的与意义 | 第22-23页 |
2 材料与方法 | 第23-30页 |
2.1 实验材料 | 第23-25页 |
2.2 实验方法 | 第25-27页 |
2.2.1 DNA提取 | 第25-26页 |
2.2.2 群体基因型分析 | 第26-27页 |
2.2.3 种子品质性状测定 | 第27页 |
2.3 数据分析 | 第27-30页 |
2.3.1 MAGIC群体遗传多样性及遗传结构分析 | 第27-28页 |
2.3.2 60K芯片中SNP位点的BLAST比对 | 第28页 |
2.3.3 MAGIC群体连锁不平衡分析 | 第28-29页 |
2.3.4 MAGIC群体关联分析 | 第29-30页 |
3 结果与分析 | 第30-45页 |
3.1 MAGIC群体遗传多样性分析 | 第30-32页 |
3.2 MAGIC群体遗传距离分析 | 第32-35页 |
3.2.1 全局遗传距离分析 | 第32-33页 |
3.2.2 系群间及系群内遗传距离 | 第33-34页 |
3.2.3 系群内遗传距离 | 第34页 |
3.2.4 系群中最具代表性株系的筛选 | 第34-35页 |
3.3 MAGIC群体结构分析 | 第35-36页 |
3.4 SNP筛选及其多态性分析 | 第36-38页 |
3.5 LD分析 | 第38-39页 |
3.6 含油量及各脂肪酸组分的表型分析 | 第39-41页 |
3.6.1 种子含油量及各脂肪酸组分的多样性分析 | 第39-41页 |
3.6.2 脂肪酸成分的相关性分析 | 第41页 |
3.7 关联分析 | 第41-45页 |
3.7.1 芥酸QTLs | 第42-43页 |
3.7.2 硫甙QTLs | 第43-44页 |
3.7.3 其它品质性状QTLs | 第44-45页 |
4 讨论 | 第45-48页 |
4.1 MAGIC群体的应用优势 | 第45-46页 |
4.2 MAGIC群体QTL定位方法的探讨 | 第46-48页 |
4.3 油菜SNP芯片数据筛选 | 第48页 |
5 进一步工作设想 | 第48-50页 |
参考文献 | 第50-56页 |
附录1改良CTAB法提取程序 | 第56-57页 |
附录 2 PAGE凝胶电泳检测程序 | 第57-58页 |
致谢 | 第58页 |