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甘蓝型油菜MAGIC群体的遗传结构分析及应用

摘要第6-8页
Abstract第8-9页
缩略词表第10-11页
1 前言第11-23页
    1.1 遗传作图群体第11-15页
        1.1.1 传统双亲作图群体第12-14页
        1.1.2 自然群体第14-15页
        1.1.3 下一代作图群体第15页
    1.2 MAGIC群体的提出及其研究进展第15-16页
    1.3 油菜QTL定位方法及研究进展第16-19页
        1.3.1 连锁分析在油菜QTL研究中的应用第16-18页
        1.3.2 关联分析在油菜QTL研究中的应用第18-19页
    1.4 MAGIC群体在QTL定位研究中的应用第19-20页
    1.5 SNP在芸薹属植物基因组研究中的应用进展第20-22页
    1.6 本研究的目的与意义第22-23页
2 材料与方法第23-30页
    2.1 实验材料第23-25页
    2.2 实验方法第25-27页
        2.2.1 DNA提取第25-26页
        2.2.2 群体基因型分析第26-27页
        2.2.3 种子品质性状测定第27页
    2.3 数据分析第27-30页
        2.3.1 MAGIC群体遗传多样性及遗传结构分析第27-28页
        2.3.2 60K芯片中SNP位点的BLAST比对第28页
        2.3.3 MAGIC群体连锁不平衡分析第28-29页
        2.3.4 MAGIC群体关联分析第29-30页
3 结果与分析第30-45页
    3.1 MAGIC群体遗传多样性分析第30-32页
    3.2 MAGIC群体遗传距离分析第32-35页
        3.2.1 全局遗传距离分析第32-33页
        3.2.2 系群间及系群内遗传距离第33-34页
        3.2.3 系群内遗传距离第34页
        3.2.4 系群中最具代表性株系的筛选第34-35页
    3.3 MAGIC群体结构分析第35-36页
    3.4 SNP筛选及其多态性分析第36-38页
    3.5 LD分析第38-39页
    3.6 含油量及各脂肪酸组分的表型分析第39-41页
        3.6.1 种子含油量及各脂肪酸组分的多样性分析第39-41页
        3.6.2 脂肪酸成分的相关性分析第41页
    3.7 关联分析第41-45页
        3.7.1 芥酸QTLs第42-43页
        3.7.2 硫甙QTLs第43-44页
        3.7.3 其它品质性状QTLs第44-45页
4 讨论第45-48页
    4.1 MAGIC群体的应用优势第45-46页
    4.2 MAGIC群体QTL定位方法的探讨第46-48页
    4.3 油菜SNP芯片数据筛选第48页
5 进一步工作设想第48-50页
参考文献第50-56页
附录1改良CTAB法提取程序第56-57页
附录 2 PAGE凝胶电泳检测程序第57-58页
致谢第58页

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