| 摘要 | 第1-5页 |
| ABSTRACT | 第5-9页 |
| 第一章 前言 | 第9-20页 |
| ·红树林生态系统 | 第9-11页 |
| ·红树林概况 | 第9页 |
| ·红树林生态系统中的微生物类群 | 第9-11页 |
| ·生物碱简介 | 第11-17页 |
| ·生物碱定义 | 第11页 |
| ·生物碱的分类 | 第11-16页 |
| ·海洋环境中的生物碱 | 第16-17页 |
| ·萘啶类化合物研究概况 | 第17-18页 |
| ·目的与意义 | 第18-20页 |
| 第二章 材料与方法 | 第20-35页 |
| ·实验材料 | 第20-27页 |
| ·菌株 | 第20-21页 |
| ·质粒 | 第21页 |
| ·工具酶 | 第21页 |
| ·主要试剂 | 第21-22页 |
| ·常用培养基、溶液 | 第22-23页 |
| ·主要仪器 | 第23-24页 |
| ·引物合成 | 第24-27页 |
| ·实验方法 | 第27-35页 |
| ·链霉菌培养及菌种保藏 | 第27页 |
| ·分子聚合酶链式反应（PCR） | 第27-28页 |
| ·酶切反应 | 第28页 |
| ·从琼脂糖凝胶中回收DNA 片段： | 第28页 |
| ·连接反应 | 第28-29页 |
| ·转化 | 第29页 |
| ·菌落PCR 初筛重组子 | 第29页 |
| ·Alkaline Phosphatase 的去磷酸反应 | 第29-30页 |
| ·孢子悬液的制备 | 第30页 |
| ·化转感受态细胞的制备 | 第30页 |
| ·电转感受态的制备及电转化 | 第30-31页 |
| ·链霉菌与大肠杆菌的接合转移 | 第31-32页 |
| ·放线菌总DNA 的少量快速分离 | 第32页 |
| ·质粒少量制备 | 第32-33页 |
| ·细菌总RNA 的提取及纯化 | 第33页 |
| ·反转录PCR（RT-PCR） | 第33-35页 |
| 第三章 结果与讨论 | 第35-82页 |
| ·基因组文库中生物合成相关基因簇的筛选 | 第35-40页 |
| ·萘啶类化合物生物合成相关基因的生物信息学分析 | 第35-39页 |
| ·萘啶类化合物生物合成相关基因簇的筛选及定位 | 第39-40页 |
| ·bnr 基因簇的转录分析 | 第40-41页 |
| ·bnr 基因簇的功能分析 | 第41-82页 |
| ·bnr 基因簇的大片段缺失 | 第41-49页 |
| ·白浅灰链霉菌MGR072 野生型菌株与大片段缺失突变株的发酵及产物检测 | 第49-53页 |
| ·基因簇中单个基因bnr1、bnr2、bnr3 的缺失 | 第53-63页 |
| ·白浅灰链霉菌MGR072 野生型菌株与基因簇中单个基因bnr1、bnr2、bnr3 缺失突变株LMO09B611、LMO09B612、LMO09B613 的发酵及产物检测 | 第63-72页 |
| ·基因bnr1、bnr2 的回补 | 第72-77页 |
| ·基因bnr1、bnr2 回补株LMO09B616、LMO09B617 的发酵及产物检测 | 第77-81页 |
| ·bnr 基因簇在化合物1 生物合成中作用推测 | 第81-82页 |
| 第四章 总结与展望 | 第82-84页 |
| ·主要工作与创新点 | 第82-83页 |
| ·展望 | 第83-84页 |
| 参考文献 | 第84-90页 |
| 附录 | 第90-94页 |
| 致谢 | 第94-95页 |
| 攻读硕士学位期间已发表或录用的论文 | 第95-97页 |
