| 致谢 | 第6-7页 |
| 摘要 | 第7-9页 |
| Abstract | 第9-10页 |
| 第一章 文献综述 | 第13-24页 |
| 1.1 玉米的重要性 | 第13-14页 |
| 1.1.1 玉米是重要的粮食、饲料、经济作物 | 第13页 |
| 1.1.2 玉米是重要的模式生物 | 第13-14页 |
| 1.2 RNA-Seq技术在转录组研究中的应用 | 第14-18页 |
| 1.2.1 RNA-Seq技术的原理及平台 | 第14-16页 |
| 1.2.2 RNA-Seq测序数据分析流程 | 第16-17页 |
| 1.2.3 RNA-Seq在植物研究中的应用 | 第17-18页 |
| 1.3 氧甲基转移酶基因家族 | 第18-23页 |
| 1.3.1 氧甲基转移酶的分类 | 第19-20页 |
| 1.3.2 氧甲基转移酶的功能 | 第20-23页 |
| 1.3.3 玉米氧甲基转移酶的研究现状 | 第23页 |
| 1.4 研究目的和意义 | 第23-24页 |
| 第二章 玉米根和芽的转录组数据分析 | 第24-35页 |
| 2.1 前言 | 第24-25页 |
| 2.2 材料与方法 | 第25-26页 |
| 2.2.1 数据来源 | 第25页 |
| 2.2.2 转录组数据处理流程 | 第25-26页 |
| 2.2.3 差异表达基因的GO(Gene Ontology)注释 | 第26页 |
| 2.3 结果与分析 | 第26-33页 |
| 2.3.1 转录组序列比对 | 第26-27页 |
| 2.3.2 差异表达基因的筛选 | 第27页 |
| 2.3.3 差异表达基因的GO分析 | 第27-31页 |
| 2.3.4 差异表达基因相关的miRNA靶标分析 | 第31-33页 |
| 2.4 讨论与小结 | 第33-35页 |
| 第三章 氧甲基转移酶基因家族的研究 | 第35-53页 |
| 3.1 前言 | 第35-36页 |
| 3.2 材料与方法 | 第36-40页 |
| 3.2.1 材料 | 第36页 |
| 3.2.2 氧甲基转移酶基因的鉴定 | 第36页 |
| 3.2.3 氧甲基转移酶基因的共线性分析 | 第36-37页 |
| 3.2.4 氧甲基转移酶基因的进化 | 第37页 |
| 3.2.5 氧甲基转移酶蛋白家族的分类及保守模体(motif)预测 | 第37页 |
| 3.2.6 米氧甲基转移酶基因在NAM群体及不同组织中的表达 | 第37-38页 |
| 3.2.7 玉米氧甲基转移酶基因表达的验证 | 第38-40页 |
| 3.3 结果与分析 | 第40-50页 |
| 3.3.1 玉米新型氧甲基转移酶基因的鉴定 | 第40-42页 |
| 3.3.2 玉米新型氧甲基转移酶基因的进化和结构分析 | 第42-45页 |
| 3.3.3 新型氧甲基转移酶基因在禾本科中的进化 | 第45-47页 |
| 3.3.4 玉米氧甲基转移酶基因在不同品系和组织中的表达 | 第47-50页 |
| 3.4 讨论与小结 | 第50-53页 |
| 第4章 总结与展望 | 第53-55页 |
| 4.1 总结 | 第53-54页 |
| 4.2 展望 | 第54-55页 |
| 参考文献 | 第55-65页 |
| 附录 | 第65-69页 |
| 作者简历 | 第69页 |
