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短乳杆菌酪氨酸脱羧酶的晶体结构及其活性中心关键位点的研究

摘要第3-4页
Abstract第4-5页
第一章 绪论第8-17页
    1.1 酪氨酸脱羧酶研究背景第8-11页
        1.1.1 酪氨酸脱羧酶简介第8页
        1.1.2 酪氨酸脱羧酶研究概况第8-11页
    1.2 酪胺概述第11-13页
        1.2.1 酪胺的功能与应用第11-12页
        1.2.2 酪胺的制备第12-13页
    1.3 蛋白质的结晶方法与结构测定第13-15页
        1.3.1 蛋白质结晶方法第13-14页
        1.3.2 蛋白质结构解析方法简介第14-15页
    1.4 本论文的研究意义与主要研究内容第15-17页
        1.4.1 课题来源第15页
        1.4.2 本论文的研究背景与研究意义第15-16页
        1.4.3 本论文的主要研究内容第16-17页
第二章 材料与方法第17-24页
    2.1 实验材料第17-19页
        2.1.1 主要试剂及仪器第17-18页
        2.1.2 实验菌株第18页
        2.1.3 实验所用引物第18页
        2.1.4 主要培养基第18-19页
    2.2 实验方法第19-24页
        2.2.1 重组硒代酪氨酸脱羧酶的制备与纯化第19-20页
        2.2.2 Se-TDC晶体的生长第20页
        2.2.3 Se-TDC晶体衍射与数据收集第20页
        2.2.4 Se-TDC衍射数据处理与TDC的结构解析第20-21页
        2.2.5 TDC与复合物的共结晶与结构解析第21页
        2.2.6 TDC的定点突变研究第21-23页
        2.2.7 TDC与酪氨酸的分子对接第23-24页
第三章 结果与讨论第24-48页
    3.1 重组酪氨酸脱羧酶的结构解析第24-29页
        3.1.1 Se-TDC在大肠杆菌中的表达第24页
        3.1.2 Se-TDC纯化第24-25页
        3.1.3 Se-TDC晶体的生长第25-27页
        3.1.4 Se-TDC衍射数据的收集第27-28页
        3.1.5 TDC母体晶体结构的解析第28-29页
    3.2 TDC复合物的共结晶与结构解析第29-35页
        3.2.1 TDC与PLP的共结晶与结构解析第29-31页
        3.2.2 TDC与底物类似物的共结晶第31-35页
    3.3 TDC的晶体结构分析第35-37页
        3.3.1 TDC的整体结构第35-36页
        3.3.2 TDC与其他Group II脱羧酶的蛋白结构比较第36页
        3.3.3 PLP结合位点第36-37页
    3.4 K240、H241的结构功能分析第37-41页
        3.4.1 K240A、H241半饱和突变体的构建第37-38页
        3.4.2 K240、H241突变体表达、纯化第38-39页
        3.4.3 K240、H241突变体的活力测定与动力学表征第39-41页
    3.5 TDC活性位点分析第41-48页
        3.5.1 TDC活性位点突变体库的构建第41页
        3.5.2 TDC突变体活性分析第41-42页
        3.5.3 E102、Y395的半饱和突变第42-43页
        3.5.4 Y398突变体分析第43-45页
        3.5.5 S586A活力提高原因分析第45-48页
主要结论与展望第48-50页
    主要结论第48-49页
    展望第49-50页
致谢第50-51页
参考文献第51-56页
附录第56-58页
    附录1:本论文所用引物第56-58页
    附录2:作者在硕士学位期间发表的论文第58页

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