| 摘要 | 第3-5页 |
| ABSTRACT | 第5-7页 |
| 第一章 前言 | 第10-23页 |
| 1.1 植物抗菌肽概述 | 第10-16页 |
| 1.2 转录组测序技术研究进展 | 第16-18页 |
| 1.3 转录组组装研究进展 | 第18-20页 |
| 1.4 莲子草研究进展 | 第20-21页 |
| 1.5 本研究的工作及意义 | 第21-23页 |
| 第二章 莲子草转录组测序及组装 | 第23-33页 |
| 2.1 材料和方法 | 第23-30页 |
| 2.1.1 植物材料 | 第23页 |
| 2.1.2 RNA提取 | 第23页 |
| 2.1.3 高通量测序 | 第23-24页 |
| 2.1.4 原始数据质量控制 | 第24-26页 |
| 2.1.5 转录组De novo组装 | 第26-29页 |
| 2.1.6 转录本表达定量分析 | 第29-30页 |
| 2.2 结果 | 第30-31页 |
| 2.2.1 莲子草转录组组装结果 | 第30-31页 |
| 2.2.2 莲子草转录本表达定量分析结果 | 第31页 |
| 2.3 讨论 | 第31-33页 |
| 第三章 莲子草转录本功能注释 | 第33-42页 |
| 3.1 材料和方法 | 第33-36页 |
| 3.1.1 材料 | 第33页 |
| 3.1.2 方法 | 第33-36页 |
| 3.2 结果 | 第36-41页 |
| 3.2.1 莲子草转录本功能注释结果概述 | 第36页 |
| 3.2.2 unigene在NR数据库的注释结果 | 第36-37页 |
| 3.2.3 unigene在KOG数据库的注释结果 | 第37-39页 |
| 3.2.4 unigene在KEGG数据库中的注释结果 | 第39-41页 |
| 3.2.5 unigene在GO数据库中的注释结果 | 第41页 |
| 3.3 讨论 | 第41-42页 |
| 第四章 识别莲子草抗菌肽序列 | 第42-53页 |
| 4.1 材料和方法 | 第42-45页 |
| 4.1.1 材料 | 第42页 |
| 4.1.2 AMPs预测方法 | 第42-45页 |
| 4.2 结果 | 第45-51页 |
| 4.2.1 莲子草AMPs预测结果 | 第45-46页 |
| 4.2.2 AMPs注释结果 | 第46-48页 |
| 4.2.3 AMPs类别 | 第48-51页 |
| 4.3 讨论 | 第51-53页 |
| 第五章 总结 | 第53-55页 |
| 参考文献 | 第55-67页 |
| 附录 | 第67-73页 |
| 攻读学位期间成果 | 第73-74页 |
| 致谢 | 第74-75页 |
