| 摘要 | 第4-7页 |
| ABSTRACT | 第7-10页 |
| 缩略语对照表 | 第11-19页 |
| 第一章 绪论 | 第19-25页 |
| 1.1 糖组学简介 | 第19页 |
| 1.1.1 糖组与糖组学概念 | 第19页 |
| 1.2 蛋白质糖基化 | 第19-20页 |
| 1.2.1 蛋白质糖基化的概念及类型 | 第19-20页 |
| 1.3 糖结合蛋白简介 | 第20-23页 |
| 1.3.1 糖结合蛋白的概念及分类 | 第20页 |
| 1.3.2 糖结合蛋白的功能 | 第20-21页 |
| 1.3.3 凝集素的概述及分类 | 第21-22页 |
| 1.3.4 凝集素的研究意义 | 第22-23页 |
| 1.4 本论文研究的目的和意义 | 第23-25页 |
| 第二章 肝癌发生发展中膜糖蛋白糖链谱的研究 | 第25-52页 |
| 2.1 引言 | 第25-27页 |
| 2.2 试剂与仪器 | 第27-28页 |
| 2.2.1 实验试剂及耗材 | 第27-28页 |
| 2.2.2 实验仪器 | 第28页 |
| 2.3 实验方法 | 第28-31页 |
| 2.3.1 细胞培养及消化 | 第28-29页 |
| 2.3.2 膜蛋白提取 | 第29页 |
| 2.3.3 环氧化片基的制备 | 第29页 |
| 2.3.4 凝集素芯片的制备 | 第29-30页 |
| 2.3.5 膜蛋白的标记和孵育 | 第30页 |
| 2.3.6 芯片数据分析 | 第30-31页 |
| 2.3.7 凝集素组化 | 第31页 |
| 2.4 实验结果(一) | 第31-38页 |
| 2.4.1 静息态和激活态LX-2细胞膜糖蛋白糖链谱 | 第31-34页 |
| 2.4.2 激活态LX-2细胞膜糖蛋白糖链谱变化 | 第34-35页 |
| 2.4.3 凝集素组化验证差异膜糖蛋白糖链 | 第35-38页 |
| 2.5 实验结果(二) | 第38-48页 |
| 2.5.1 肝癌细胞系及正常细胞系膜糖蛋白糖链谱 | 第38-45页 |
| 2.5.2 肝癌细胞系膜糖蛋白糖链谱的变化 | 第45-47页 |
| 2.5.3 凝集素组化验证差异膜糖蛋白糖链谱 | 第47-48页 |
| 2.6 讨论 | 第48-52页 |
| 第三章 肝癌发生发展中糖链合成调控机制的研究 | 第52-83页 |
| 3.1 引言 | 第52-53页 |
| 3.2 材料与方法 | 第53-54页 |
| 3.2.1 试剂及耗材 | 第53-54页 |
| 3.2.2 主要仪器 | 第54页 |
| 3.3 实验方法 | 第54-61页 |
| 3.3.1 细胞培养及消化 | 第54-55页 |
| 3.3.2 氨基化片基的制备 | 第55页 |
| 3.3.3 醛基化片基的制备 | 第55页 |
| 3.3.4 糖基因芯片的制备 | 第55页 |
| 3.3.5 总RNA提取 | 第55-56页 |
| 3.3.6 琼脂糖凝胶电泳 | 第56页 |
| 3.3.7 芯片靶标制备 | 第56-57页 |
| 3.3.8 cRNA的荧光标记及杂交 | 第57页 |
| 3.3.9 芯片数据分析 | 第57页 |
| 3.3.10 实时荧光定量PCR验证 | 第57-58页 |
| 3.3.11 石蜡包埋组织切片的制备 | 第58-59页 |
| 3.3.12 石蜡切片脱蜡及水化 | 第59页 |
| 3.3.13 苏木精-伊红染色 | 第59-60页 |
| 3.3.14 抗原修复 | 第60页 |
| 3.3.15 凝集素组化 | 第60页 |
| 3.3.16 免疫荧光组化 | 第60-61页 |
| 3.4 实验结果(一) | 第61-70页 |
| 3.4.1 静息态和激活态LX-2细胞总RNA提取定量 | 第61页 |
| 3.4.2 激活态LX-2糖相关基因表达谱分析 | 第61-65页 |
| 3.4.3 实时荧光定量PCR验证 | 第65-66页 |
| 3.4.4 KEGG信号通路分析 | 第66-67页 |
| 3.4.5 糖链合成调控分析 | 第67-70页 |
| 3.5 实验结果(二) | 第70-82页 |
| 3.5.1 肝癌细胞系糖相关基因表达谱分析 | 第70-74页 |
| 3.5.2 实时荧光定量PCR验证 | 第74-75页 |
| 3.5.3 Western blot验证 | 第75-76页 |
| 3.5.4 KEGG信号通路分析 | 第76-78页 |
| 3.5.5 肝癌发生过程中糖链合成调控分析 | 第78-79页 |
| 3.5.6 凝集素组化及免疫荧光组化验证 | 第79-82页 |
| 3.6 讨论 | 第82-83页 |
| 第四章 肝癌发生发展中糖结合蛋白的研究 | 第83-115页 |
| 4.1 引言 | 第83-85页 |
| 4.2 试剂与仪器 | 第85-87页 |
| 4.2.1 实验试剂及耗材 | 第85-86页 |
| 4.2.2 实验器材 | 第86-87页 |
| 4.3 实验方法 | 第87-90页 |
| 4.3.1 细胞培养及消化 | 第87页 |
| 4.3.2 组织样本收集 | 第87-88页 |
| 4.3.3 总蛋白提取 | 第88页 |
| 4.3.4 羟基化片基的制备 | 第88页 |
| 4.3.5 糖芯片的制备 | 第88-89页 |
| 4.3.6 总蛋白标记和孵育 | 第89页 |
| 4.3.7 数据分析 | 第89页 |
| 4.3.8 糖链的荧光标记 | 第89页 |
| 4.3.9 石蜡包埋组织切片的制备 | 第89页 |
| 4.3.10 石蜡切片脱蜡及水化 | 第89页 |
| 4.3.11 苏木精-伊红染色 | 第89页 |
| 4.3.12 抗原修复 | 第89-90页 |
| 4.3.13 糖细胞化学 | 第90页 |
| 4.4 实验结果(一) | 第90-104页 |
| 4.4.1 糖芯片结合特异性 | 第90-91页 |
| 4.4.2 激活态和静息态LX-2细胞中GBPs的表达水平 | 第91-95页 |
| 4.4.3 激活态LX-2细胞中差异性表达的GBPs | 第95-98页 |
| 4.4.4 肝星状细胞中差异性表达GBPs的验证 | 第98-104页 |
| 4.5 实验结果(二) | 第104-112页 |
| 4.5.1 肝癌细胞系HepG2和正常细胞系L02的GBPs | 第104-108页 |
| 4.5.2 肝癌细胞系HepG2中差异性表达的GBPs | 第108-109页 |
| 4.5.3 糖细胞化学对差异表达GBPs的验证 | 第109-112页 |
| 4.6 讨论 | 第112-115页 |
| 第五章 糖结合蛋白相关潜在肿瘤标志物的研究 | 第115-172页 |
| 5.1 引言 | 第115-116页 |
| 5.2 试剂与仪器 | 第116-118页 |
| 5.2.1 实验试剂及耗材 | 第116-118页 |
| 5.2.2 实验仪器 | 第118页 |
| 5.3 实验方法 | 第118-123页 |
| 5.3.1 细胞培养及消化 | 第118页 |
| 5.3.2 血清样本采集 | 第118页 |
| 5.3.3 总蛋白提取 | 第118-119页 |
| 5.3.4 羟基化磁性微粒的制备 | 第119页 |
| 5.3.5 糖-磁性复合微粒的制备 | 第119页 |
| 5.3.6 糖结合蛋白的分离 | 第119页 |
| 5.3.7 糖结合蛋白的酶解及除盐 | 第119-120页 |
| 5.3.8 糖结合蛋白的质谱鉴定 | 第120页 |
| 5.3.9 质谱数据分析 | 第120页 |
| 5.3.10 糖结合蛋白的GO注释及Motif分析 | 第120-121页 |
| 5.3.11 SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳及银染 | 第121-122页 |
| 5.3.12 糖结合蛋白的Western blot验证 | 第122页 |
| 5.3.13 实时荧光定量PCR验证 | 第122页 |
| 5.3.14 糖细胞化学/免疫荧光组化 | 第122页 |
| 5.3.15 血清芯片及数据处理 | 第122-123页 |
| 5.4 实验结果(一) | 第123-154页 |
| 5.4.1 磁性复合微粒的表征 | 第123-124页 |
| 5.4.2 磁性复合微粒的特异性 | 第124-125页 |
| 5.4.3 半乳糖胺糖结合蛋白的分离与鉴定 | 第125-149页 |
| 5.4.4 实时荧光定量PCR和Western blot验证 | 第149-151页 |
| 5.4.5 GNBPs蛋白种类及KEGG分析 | 第151页 |
| 5.4.6 GNBPs的基序分析 | 第151-154页 |
| 5.5 实验结果(二) | 第154-169页 |
| 5.5.1 木糖结合蛋白的表达与定位 | 第154-156页 |
| 5.5.2 XBPs的鉴定及GO注释 | 第156-163页 |
| 5.5.3 XBPs的KEGG通路和网络分析 | 第163-165页 |
| 5.5.4 XBPs特征序列子分析 | 第165页 |
| 5.5.5 XBPs在肝星状细胞和HBV诱发的肝纤维化/肝硬化患者血清中的表达 | 第165-166页 |
| 5.5.6 PDIA6和APOA1在肝星状细胞和肝纤维化/肝硬化患者组织中的分布与定位 | 第166-167页 |
| 5.5.7 PDIA6和APOA1作为肿瘤潜在标志物的评估 | 第167-169页 |
| 5.6 讨论 | 第169-172页 |
| 第六章 肝病患者与易感流感病毒关系的研究 | 第172-187页 |
| 6.1 引言 | 第172-173页 |
| 6.2 试剂及仪器 | 第173-174页 |
| 6.2.1 实验试剂及耗材 | 第173-174页 |
| 6.2.2 实验器材 | 第174页 |
| 6.3 实验方法 | 第174-175页 |
| 6.3.1 研究人群 | 第174页 |
| 6.3.2 唾液采集及处理 | 第174-175页 |
| 6.3.3 唾液蛋白荧光标记 | 第175页 |
| 6.3.4 凝集素芯片和数据分析 | 第175页 |
| 6.3.5 唾液芯片的制备和数据分析 | 第175页 |
| 6.3.6 SDS-PAGE凝胶电泳及转膜 | 第175页 |
| 6.3.7 凝集素印迹 | 第175页 |
| 6.3.8 流感病毒印记 | 第175页 |
| 6.4 实验结果 | 第175-185页 |
| 6.4.1 唾液中α2-3/6连接末端SA糖链结构的表达水平 | 第175-179页 |
| 6.4.2 唾液中α2-3/6连接末端SA糖链结构表达水平的验证 | 第179-180页 |
| 6.4.3 凝集素印记分析 | 第180-183页 |
| 6.4.4 流感病毒印记分析 | 第183-185页 |
| 6.5 讨论 | 第185-187页 |
| 全文总结 | 第187-191页 |
| 参考文献 | 第191-202页 |
| 致谢 | 第202-203页 |
| 攻读博士学位期间取得的科研成果 | 第203-208页 |
| 作者简介 | 第208页 |
