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大肠杆菌二肽转运蛋白YbgH结构与功能研究

摘要第1-6页
Abstract第6-12页
第1章 引言第12-26页
   ·膜蛋白概述第12-13页
   ·膜转运蛋白第13-15页
     ·被动运输第13-14页
     ·主动运输第14-15页
   ·MFS家族研究现状第15-19页
     ·MFS超家族蛋白分类第15-16页
     ·MFS超家族结构生物学研究第16-18页
     ·MFS超家族转运机制第18-19页
   ·POT家族研究背景第19-26页
     ·POTs家族保守motif第19-20页
     ·人源POTs家族转运蛋白,PepT1和PepT2第20-21页
     ·POTs家族结构生物学研究第21-22页
     ·大肠杆菌YbgH(EcYbgH)研究背景第22-26页
第2章 膜蛋白的结构生物学研究第26-42页
   ·膜蛋白表达第26-27页
   ·去污剂第27-30页
     ·去污剂的分类第27-28页
     ·去污剂在溶液中的性质第28-29页
     ·去污剂在结构生物学中的应用第29-30页
   ·晶体生长第30-33页
     ·膜蛋白晶体堆积方式第30-31页
     ·结晶方法第31-32页
     ·提高膜蛋白稳定性第32-33页
   ·重原子浸泡第33-35页
   ·数据收集以及结构修正第35-39页
     ·同步辐射设施发展第35-36页
     ·数据收集、处理第36-38页
     ·模型搭建以及结构修正策略第38-39页
   ·展望第39-42页
第3章 实验原理与方法第42-50页
   ·克隆构建第42-43页
     ·双酶切构建第42页
     ·不依赖于连接酶的构建第42页
     ·点突变构建第42-43页
   ·大肠杆菌系统膜蛋白表达第43-44页
   ·破菌、蛋白纯化第44-46页
   ·硒代晶体制备第46-47页
   ·细胞水平的转运试验第47页
   ·Western Blot检测膜蛋白表达水平第47-50页
第4章 大肠杆菌YbgH的克隆、表达和结晶第50-58页
   ·EcYbgH基本信息第50页
   ·EcYbgH的克隆,表达以及纯化条件摸索第50-52页
     ·EcYbgH克隆、表达第50-51页
     ·EcYbgH不同去污剂第51-52页
   ·EcYbgH晶体筛选和优化第52-58页
     ·晶体初步筛选第52-54页
     ·晶体优化和重复第54-55页
     ·重原子衍生物制备第55-58页
第5章 数据收集、结构解析以及修正第58-66页
   ·晶体数据收集第58页
   ·相位解析第58-61页
   ·模型搭建以及修正第61-63页
   ·EcYbgH晶体结构分析第63-66页
第6章 EcYbgH基于结构的功能研究第66-76页
   ·质子化位点第66-69页
     ·膜电位与转运蛋白第66页
     ·质子化如何成为驱动力第66-67页
     ·EcYbgH质子化位点第67-69页
   ·Motif A第69-73页
     ·Motif A的工作机制第69-71页
     ·EcYbgH中的motif A第71-73页
   ·V形插入螺旋第73-75页
     ·motif A调控模型第73-74页
     ·HAB的功能第74-75页
   ·结论与展望第75-76页
第7章 CsgG结构与功能研究第76-86页
   ·细菌与Curli第76-77页
   ·大肠杆菌Curli的研究第77-78页
   ·CsgG的克隆、表达、纯化以及长晶体第78-79页
   ·CsgG结构解析及修正第79-83页
   ·CsgG结构分析第83-85页
   ·CsgG的功能研究第85-86页
第8章 参与的其它工作第86-91页
   ·EcYajR的结构解析第86-88页
     ·EcYajR研究背景第86页
     ·EcYaJR结构解析、修正以及分析第86-87页
     ·YAM结构域第87-88页
   ·EcPgpB的结构解析第88-90页
     ·EcPgpB研究背景第88-89页
     ·EcPgpB晶体结构解析第89-90页
   ·脂多糖合成相关复合物LptD/E第90-91页
参考文献第91-100页
附录1 实验仪器和材料第100-102页
附录2 E.coli MFS超家族转运蛋白motif A预测第102-106页
致谢第106-108页
在读期间发表的学术论文第108页

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