| 致谢 | 第1-6页 |
| 摘要 | 第6-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 专业词汇中英文对照表 | 第9-13页 |
| 第1章 引言 | 第13-29页 |
| ·结核杆菌的研究概况 | 第13-14页 |
| ·DNA甲基化修饰 | 第14-17页 |
| ·原核生物中甲基化转移酶的概况 | 第17-18页 |
| ·细菌中的R-M系统 | 第18-23页 |
| ·结核甲基化研究进展 | 第23-24页 |
| ·DNA甲基化修饰的检测方法 | 第24-27页 |
| ·重亚硫酸盐测序法 | 第24页 |
| ·联合亚硫酸氢钠的限制性内切酶分析法 | 第24-25页 |
| ·焦磷酸测序 | 第25页 |
| ·芯片技术 | 第25页 |
| ·荧光定量法 | 第25页 |
| ·质谱检测技术 | 第25页 |
| ·三代单分子实时测序(SMRT)技术 | 第25-27页 |
| ·本课题的研究目的及意义 | 第27-29页 |
| 第2章 实验材料和方法 | 第29-47页 |
| ·实验材料 | 第29-32页 |
| ·实验菌株 | 第29页 |
| ·质粒 | 第29页 |
| ·工具酶 | 第29-30页 |
| ·试剂(盒)及配制 | 第30-31页 |
| ·溶菌酶溶液的配制 | 第31页 |
| ·LB培养基的配制 | 第31页 |
| ·结核菌培养基的配制 | 第31页 |
| ·SDS-PAGE凝胶配制 | 第31-32页 |
| ·引物序列 | 第32-33页 |
| ·仪器与耗材 | 第33-34页 |
| ·实验方法 | 第34-47页 |
| ·牛结核杆菌卡介苗BCG的培养 | 第34页 |
| ·BCG基因组DNA提取 | 第34页 |
| ·三代单分子实时测序(SMRT)技术 | 第34页 |
| ·三代测序数据分析 | 第34-35页 |
| ·大肠杆菌感受态细胞的制备 | 第35页 |
| ·重组质粒的转化 | 第35-36页 |
| ·DNA胶回收实验 | 第36页 |
| ·HsdM甲基化酶识别位点的鉴定 | 第36-39页 |
| ·通过HsdM敲除突变体鉴定甲基化酶亚基的活性 | 第39-41页 |
| ·MamB甲基化酶识别位点的鉴定 | 第41-43页 |
| ·MamB甲基化酶的内切酶功能鉴定 | 第43-47页 |
| 第3章 三代单分子实时测序(SMRT)技术检测卡介苗BCG甲基化组 | 第47-53页 |
| ·背景介绍 | 第47-48页 |
| ·实验结果和分析 | 第48-51页 |
| ·基因组拼接与注释 | 第48-49页 |
| ·DNA甲基化的分布 | 第49-50页 |
| ·DNA甲基化酶的预测 | 第50-51页 |
| ·小结及讨论 | 第51-53页 |
| 第4章 DNA甲基化酶HsdM的鉴定及性质研究 | 第53-65页 |
| ·背景介绍 | 第53页 |
| ·实验结果和分析 | 第53-61页 |
| ·实验设计思路 | 第54-55页 |
| ·Ⅰ型HsdM甲基化转移酶识别motif的鉴定 | 第55-57页 |
| ·敲除突变体S2MS1的DNA甲基化酶活性鉴定 | 第57-58页 |
| ·敲除突变体S2M的DNA甲基化酶活性鉴定 | 第58-60页 |
| ·敲除突变体MS1的DNA甲基化酶活性鉴定 | 第60-61页 |
| ·小结和讨论 | 第61-65页 |
| 第5章 DNA甲基化酶MamB的鉴定及性质研究 | 第65-71页 |
| ·背景介绍 | 第65页 |
| ·实验结果和分析 | 第65-70页 |
| ·MamB甲基化转移酶识别motif的鉴定 | 第65-68页 |
| ·MamB蛋白的表达与纯化 | 第68-70页 |
| ·小结和讨论 | 第70-71页 |
| 第6章 总结与展望 | 第71-73页 |
| 参考文献 | 第73-83页 |
| 附录 DNA甲基化酶核苷酸序列 | 第83-91页 |
| 个人简历 | 第91页 |