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水黄皮根瘤菌遗传多样性和nifH基因横向转移研究

摘要第1-7页
ABSTRACT第7-11页
1. 文献综述第11-17页
   ·前言第11-12页
   ·分类现状第12-14页
     ·土壤杆菌第12-14页
   ·根瘤菌分类及多样性研究方法第14-15页
     ·表型多样性研究方法第14-15页
     ·遗传多样性研究方法第15页
   ·共生基因横向转移研究现状第15-17页
2. 研究目的和意义第17-18页
   ·水黄皮概述第17-18页
     ·水黄皮药理作用第17页
     ·水黄皮生物燃料作用第17-18页
   ·前期研究基础第18页
   ·本研究目的第18页
3. 材料与方法第18-27页
   ·采样地概况第18-19页
   ·供试菌株第19页
   ·遗传多样性研究第19-22页
     ·DNA的提取第19-20页
     ·16SrDNA的PCR扩增第20页
     ·持家基因(atpD、recA和glnⅡ)序列测定第20-22页
   ·共生基因(nifH)序列分析第22-23页
   ·土壤杆菌分类地位的确定第23-27页
     ·DNA同源性分析第23-25页
     ·生理生化测定第25-26页
       ·唯一碳源利用第25页
       ·唯一氮源利用第25页
       ·耐盐性测定第25页
       ·耐酸碱测定第25页
       ·生长温度范围测定第25-26页
       ·肉汤生长试验第26页
       ·3-酮基乳糖反应第26页
       ·卡拉霉素抗性测定第26页
       ·脂肪酸组分分析第26-27页
4. 结果与分析第27-37页
   ·16S rDNA序列分析第27-28页
   ·持家基因(atpD、recA和glnⅡ)序列分析第28-32页
     ·atpD序列分析第28-30页
     ·glnⅡ序列分析第30-31页
     ·recA序列分析第31-32页
   ·共生固氮基因nifH的系统发育第32页
   ·土壤杆菌PIN 15和PIN 17分类地位的确定第32-37页
     ·表型性状测定第33页
     ·PIN15和PIN17的16S rDNA及相关持家基因系统发育第33-34页
     ·G+C mol%含量及DNA 同源性分析第34-35页
     ·PINI5,PINI7的细胞脂肪酸组成分析第35页
     ·电镜照片第35-36页
     ·新种Agrobacterium dafushanense sp.nov PIN15的描述第36-37页
5. 讨论与结论第37-40页
   ·讨论第37-38页
     ·水黄皮根瘤菌的遗传多样性第37页
     ·水黄皮根瘤菌nifH基因的横向转移第37-38页
     ·土壤杆菌新种分类地位的确定第38页
   ·结论第38-39页
   ·有待进一步探讨的问题第39-40页
参考文献第40-47页
致谢第47-48页
附录1:培养基及试剂配方第48-49页
附录2 菌株16S rDNA序列第49-56页
附录3 菌株atpD序列第56-60页
附录4 菌株glnⅡ序列第60-65页
附录5 菌株recA序列第65-68页
附录6 菌株nifH序列第68-70页

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