| 摘要 | 第1-9页 |
| Abstract | 第9-11页 |
| 縮略词表 | 第11-12页 |
| 1 前言 | 第12-30页 |
| ·表观遗传学概述 | 第12页 |
| ·组蛋白乙酰化修饰研究进展 | 第12-19页 |
| ·乙酰化与基因转录的关系 | 第14页 |
| ·组蛋白乙酰化位点 | 第14-15页 |
| ·组蛋白乙酰转移酶基因 | 第15-16页 |
| ·组蛋白去乙酰化酶基因 | 第16-19页 |
| ·植物开花期的调控机理 | 第19-22页 |
| ·植物开花诱导机理 | 第19-21页 |
| ·植物花期的表观调控 | 第21-22页 |
| ·杂种优势的形成机理 | 第22-25页 |
| ·杂种优势的遗传学机理 | 第23页 |
| ·杂种优势的分子生物学机理 | 第23-24页 |
| ·杂种优势的表观遗传学机理 | 第24-25页 |
| ·利用高通量技术研究表观基因组学 | 第25-30页 |
| ·单个修饰信号的宏观特点 | 第26-27页 |
| ·多个修饰信号的相互关系及对基因转录的影响 | 第27-29页 |
| ·表观遗传的品种多态性及杂种优势 | 第29-30页 |
| 2 本研究的目的和意义 | 第30-31页 |
| 3 材料方法 | 第31-44页 |
| ·实验材料 | 第31页 |
| ·水稻材料来源及生长条件 | 第31页 |
| ·菌株 | 第31页 |
| ·基因序列的获取 | 第31-33页 |
| ·利用芯片数据库分析基因全生育期表达谱 | 第33页 |
| ·蛋白家族进化树分析 | 第33-34页 |
| ·OsHDT1基因的克降及载体的构建 | 第34页 |
| ·农杆菌介导的遗传转化 | 第34页 |
| ·基因枪介导的瞬时表达与GFP观察 | 第34-35页 |
| ·核酸操作方法 | 第35-36页 |
| ·DNA抽提与Southern杂交 | 第35-36页 |
| ·RNA抽提和Northern杂交分析 | 第36页 |
| ·RT-PCR和实时定量(Real-time)PCR分析 | 第36页 |
| ·蛋白质操作方法 | 第36-38页 |
| ·蛋白原核表达,纯化及抗体制备 | 第36-37页 |
| ·水稻组蛋白抽提 | 第37-38页 |
| ·水稻总蛋白抽提 | 第38页 |
| ·Western Blot杂交及所用抗体 | 第38页 |
| ·水稻染色质操作相关实验 | 第38-39页 |
| ·染色质免疫沉淀(Chromatin Immunoprecipitate,CHIP) | 第38-39页 |
| ·免疫染色(Immunostaining) | 第39页 |
| ·数字基因表达谱测序及差异基因筛选 | 第39-41页 |
| ·Pathway显著性富集分析 | 第41-44页 |
| 4 结果与分析 | 第44-103页 |
| ·MH63,ZS97,SY63三个品种的总体乙酰化修饰存在显著差异 | 第44-47页 |
| ·利用Western Blot检测MH63,ZS97和SY63的总体乙酰化修饰 | 第44页 |
| ·利用表达谱芯片分析水稻中HATs和HDACs基因的表达量 | 第44-46页 |
| ·Real-time PCR对部分芯片结果的验证 | 第46-47页 |
| ·HDT1基因的表达模式以及蛋白定位 | 第47-52页 |
| ·OsHDT1基因的表达模式 | 第48-50页 |
| ·OsHDT1蛋白定位 | 第50-52页 |
| ·超量表达HDT1可以导致SY63开花提早但对MH63没有影响 | 第52-58页 |
| ·HDT1超量和抑制材料的构建、检测、表型观察以及与ZS97的杂交 | 第52-54页 |
| ·自交后代与杂交后代的表达检测及田间性状考察 | 第54-58页 |
| ·HDT1的超量表达改变了某些开花基因的表达量 | 第58-61页 |
| ·HDT1对组蛋白乙酰化的影响 | 第61-63页 |
| ·利用高通量测序方法在全基因组水平上寻找差异表达基因 | 第63-101页 |
| ·在野生型杂交组合中寻找差异表达基因 | 第64-76页 |
| ·转基因杂种和野生型杂种的差异表达基因 | 第76-78页 |
| ·OsHDT1对非加性基因表达的影响 | 第78-89页 |
| ·OsHDT1对基因表达的影响在亲本和杂种中有所不同 | 第89-90页 |
| ·亲本MH63中表达量受OsHDT1转基因影响的基因 | 第90-94页 |
| ·在亲本和杂种中转基因后表达量表现出相反变化方向的基因 | 第94-101页 |
| ·差异表达基因在组蛋白修饰水平上的变化 | 第101-102页 |
| ·酵母双杂交筛选OsHDT1互作蛋白 | 第102-103页 |
| 5 讨论与展望 | 第103-107页 |
| ·OsHDT1对水稻生长发育和基因表达调控的功能 | 第103-105页 |
| ·OsHDT1的节律性与去乙酰化作用 | 第103页 |
| ·OsHDT1对基因表达的调控作用 | 第103-104页 |
| ·OsHDT1可能的互作蛋白 | 第104-105页 |
| ·OsHDT1在抗逆中的作用 | 第105页 |
| ·植物开花机理的深入研究 | 第105-107页 |
| ·光周期途径的表观调控 | 第105-106页 |
| ·开花与产量的辩证关系 | 第106-107页 |
| 参考文献 | 第107-123页 |
| 附录 | 第123-133页 |
| 附录A 部分实验的操作流程 | 第123-132页 |
| 附录B 作者简介 | 第132-133页 |
| 致谢 | 第133页 |
