中文摘要 | 第1-11页 |
ABSTRACT | 第11-13页 |
1 文献综述 | 第13-28页 |
·猪骨骼肌发育相关基因的研究现状 | 第13-19页 |
·猪基因组的研究进展 | 第13-14页 |
·筛选肌肉发育相关基因 | 第14-15页 |
·猪骨骼肌生长发育的研究现状 | 第15-19页 |
·骨骼肌生长发育的基本过程 | 第15-16页 |
·骨骼肌生长发育的分子基础 | 第16-18页 |
·猪肌肉品质特征及其形成原理 | 第18页 |
·骨骼肌纤维类型对猪肉品质的影响 | 第18-19页 |
·肌纤维的决定与分化的分子基础 | 第19-25页 |
·慢肌纤维与快肌纤维 | 第19-21页 |
·钙调神经磷酸酶在肌纤维分化中的作用 | 第21-25页 |
·Calsarcin基因家族的研究现状 | 第25-28页 |
2 本研究的目的和意义 | 第28-30页 |
3 材料与方法 | 第30-43页 |
·材料 | 第30-33页 |
·样品 | 第30-31页 |
·DNA样品 | 第30页 |
·组织样品 | 第30页 |
·细胞样品 | 第30-31页 |
·载体和菌株 | 第31页 |
·试剂盒和酶 | 第31页 |
·主要试剂及配制 | 第31-33页 |
·主要试剂 | 第31页 |
·试剂的配制 | 第31-33页 |
·主要仪器设备 | 第33页 |
·主要分子生物学软件 | 第33页 |
·主要数据库 | 第33页 |
·方法 | 第33-42页 |
·候选基因cDNA全长序列的分离方法 | 第33-34页 |
·候选基因基因组全长序列的分离方法 | 第34-35页 |
·引物设计 | 第34页 |
·PCR扩增的条件 | 第34页 |
·PCR产物的纯化回收和克隆测序 | 第34-35页 |
·DNA序列同源性检索鉴定 | 第35页 |
·基因染色体定位RH法 | 第35-36页 |
·基因定位的引物设计 | 第35页 |
·PCR分型方法 | 第35页 |
·数据分析方法 | 第35-36页 |
·目的基因表达谱分析 | 第36-37页 |
·总RNA的提取 | 第36页 |
·cDNA的合成 | 第36页 |
·Real-time PCR引物和TaqMan探针的设计 | 第36页 |
·目的基因的组织表达谱分析 | 第36页 |
·目的基因在骨骼肌发育不同时期的表达谱分析 | 第36-37页 |
·目的基因在C2C12细胞分化不同时期的表达谱分析 | 第37页 |
·表达谱的数据分析 | 第37页 |
·细胞培养和转染 | 第37-40页 |
·载体的构建 | 第37-38页 |
·细胞培养和转染 | 第38-39页 |
·转染后的细胞染色和融合蛋白的观察 | 第39页 |
·转染后的荧光素酶活性测定 | 第39-40页 |
·猪基因的多态性检测 | 第40页 |
·用PCR-RFLP方法检测基因多态 | 第40页 |
·用DHPLC方法检测基因多态 | 第40页 |
·猪基因与性状的关联分析 | 第40-41页 |
·凝胶阻滞电泳 | 第41-42页 |
·探针标记和蛋白提取 | 第41页 |
·电泳和显影 | 第41-42页 |
·本研究的实验总体方案 | 第42-43页 |
4 结果与分析 | 第43-61页 |
·猪CS-1,CS-2和CS-3基因的分离 | 第43-48页 |
·猪CS-1,CS-2和CS-3基因的序列分析 | 第43页 |
·猪CS-1,CS-2和CS-3的预测蛋白特征 | 第43-44页 |
·calsarcins蛋白的进化关系 | 第44-46页 |
·猪calsarcins基因的核苷酸序列 | 第46页 |
·猪calsarcins基因的核苷酸多态检测 | 第46-48页 |
·猪CS-1,CS-2和CS-3基因的定位 | 第48页 |
·猪CS-1和CS-2基因的时空表达规律 | 第48-51页 |
·猪CS-1和CS-2基因的组织表达分析 | 第48-49页 |
·猪CS-1和CS-2基因在骨骼肌发育不同时期表达的差异 | 第49-51页 |
·猪CS-1和CS-2基因的真核表达 | 第51页 |
·CS-1和CS-2基因在C2C12细胞中的表达 | 第51-52页 |
·CS-1和CS-2基因的转录起始位点 | 第52-53页 |
·CS-1和CS-2基因启动子活性检测 | 第53-56页 |
·CS-1和CS-2基因启动子内NF-κB结合位点的确定 | 第56-58页 |
·抑制NF-κB对CS-1和CS-2基因启动子的影响 | 第58-59页 |
·过表达NF-κB,NFAT和MEF2转录因子对CS-1和CS-2基因启动子的影响 | 第59-61页 |
5 讨论 | 第61-68页 |
·猪CS-1,CS-2和CS-3基因定位 | 第61页 |
·猪CS-1和CS-2基因的时空表达规律 | 第61页 |
·骨骼肌生成过程及主要调控因子 | 第61-62页 |
·钙调神经磷酸酶信号通路在肌纤维中的作用 | 第62-63页 |
·NFκB转录因子在不同肌纤维中的作用 | 第63-65页 |
·钙调神经磷酸酶相关的转录因子对calsarcin基因启动子的调控 | 第65-67页 |
·Calsarcins家族在肌纤维类型形成中的作用的推测 | 第67-68页 |
6 小结 | 第68-71页 |
主要结论 | 第68-69页 |
本研究的创新点与特色 | 第69页 |
值得进一步研究的问题 | 第69-71页 |
7 研究生期间完成的其它工作 | 第71-76页 |
·猪JAK2,JAK3和TYK2基因的染色体定位研究 | 第71-72页 |
·猪SFRS1基因的克隆,定位以及多态性研究 | 第72-73页 |
·猪13号染色体上三个新基因的克隆和定位研究 | 第73-74页 |
·猪ELPIN基因的克隆,定位以及其不同剪接体表达规律研究 | 第74-75页 |
·猪EIF412基因的克隆,表达规律以及性状关联分析 | 第75-76页 |
参考文献 | 第76-82页 |
附录 | 第82-94页 |
附表1 用于研究猪calsarcin基因的引物和探针 | 第82-84页 |
附表2 用于研究小鼠calsarcin基因启动子的引物和探针 | 第84-86页 |
附表3 缩略词表 | 第86-88页 |
附图1 猪CS-1基因的mRNA序列和推测的氨基酸序列 | 第88-89页 |
附图2 猪CS-2基因的mRNA序列和推测的氨基酸序列 | 第89-90页 |
附图3 猪CS-3基因的mRNA序列和推测的氨基酸序列 | 第90-91页 |
附图4 猪CS-1基因的染色体定位 | 第91-92页 |
附图5 猪CS-1基因的染色体定位 | 第92-93页 |
附图6 猪CS-1基因的染色体定位 | 第93-94页 |
在读期间发表的论文 | 第94-95页 |
致谢 | 第95页 |