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肌肉中calsarcin基因的差异表达和转录调控研究

中文摘要第1-11页
ABSTRACT第11-13页
1 文献综述第13-28页
   ·猪骨骼肌发育相关基因的研究现状第13-19页
     ·猪基因组的研究进展第13-14页
     ·筛选肌肉发育相关基因第14-15页
     ·猪骨骼肌生长发育的研究现状第15-19页
       ·骨骼肌生长发育的基本过程第15-16页
       ·骨骼肌生长发育的分子基础第16-18页
       ·猪肌肉品质特征及其形成原理第18页
       ·骨骼肌纤维类型对猪肉品质的影响第18-19页
   ·肌纤维的决定与分化的分子基础第19-25页
     ·慢肌纤维与快肌纤维第19-21页
     ·钙调神经磷酸酶在肌纤维分化中的作用第21-25页
   ·Calsarcin基因家族的研究现状第25-28页
2 本研究的目的和意义第28-30页
3 材料与方法第30-43页
   ·材料第30-33页
     ·样品第30-31页
       ·DNA样品第30页
       ·组织样品第30页
       ·细胞样品第30-31页
     ·载体和菌株第31页
     ·试剂盒和酶第31页
     ·主要试剂及配制第31-33页
       ·主要试剂第31页
       ·试剂的配制第31-33页
     ·主要仪器设备第33页
     ·主要分子生物学软件第33页
     ·主要数据库第33页
   ·方法第33-42页
     ·候选基因cDNA全长序列的分离方法第33-34页
     ·候选基因基因组全长序列的分离方法第34-35页
       ·引物设计第34页
       ·PCR扩增的条件第34页
       ·PCR产物的纯化回收和克隆测序第34-35页
       ·DNA序列同源性检索鉴定第35页
     ·基因染色体定位RH法第35-36页
       ·基因定位的引物设计第35页
       ·PCR分型方法第35页
       ·数据分析方法第35-36页
     ·目的基因表达谱分析第36-37页
       ·总RNA的提取第36页
       ·cDNA的合成第36页
       ·Real-time PCR引物和TaqMan探针的设计第36页
       ·目的基因的组织表达谱分析第36页
       ·目的基因在骨骼肌发育不同时期的表达谱分析第36-37页
       ·目的基因在C2C12细胞分化不同时期的表达谱分析第37页
       ·表达谱的数据分析第37页
     ·细胞培养和转染第37-40页
       ·载体的构建第37-38页
       ·细胞培养和转染第38-39页
       ·转染后的细胞染色和融合蛋白的观察第39页
       ·转染后的荧光素酶活性测定第39-40页
     ·猪基因的多态性检测第40页
       ·用PCR-RFLP方法检测基因多态第40页
       ·用DHPLC方法检测基因多态第40页
     ·猪基因与性状的关联分析第40-41页
     ·凝胶阻滞电泳第41-42页
       ·探针标记和蛋白提取第41页
       ·电泳和显影第41-42页
   ·本研究的实验总体方案第42-43页
4 结果与分析第43-61页
   ·猪CS-1,CS-2和CS-3基因的分离第43-48页
     ·猪CS-1,CS-2和CS-3基因的序列分析第43页
     ·猪CS-1,CS-2和CS-3的预测蛋白特征第43-44页
     ·calsarcins蛋白的进化关系第44-46页
     ·猪calsarcins基因的核苷酸序列第46页
     ·猪calsarcins基因的核苷酸多态检测第46-48页
     ·猪CS-1,CS-2和CS-3基因的定位第48页
   ·猪CS-1和CS-2基因的时空表达规律第48-51页
     ·猪CS-1和CS-2基因的组织表达分析第48-49页
     ·猪CS-1和CS-2基因在骨骼肌发育不同时期表达的差异第49-51页
   ·猪CS-1和CS-2基因的真核表达第51页
   ·CS-1和CS-2基因在C2C12细胞中的表达第51-52页
   ·CS-1和CS-2基因的转录起始位点第52-53页
   ·CS-1和CS-2基因启动子活性检测第53-56页
   ·CS-1和CS-2基因启动子内NF-κB结合位点的确定第56-58页
   ·抑制NF-κB对CS-1和CS-2基因启动子的影响第58-59页
   ·过表达NF-κB,NFAT和MEF2转录因子对CS-1和CS-2基因启动子的影响第59-61页
5 讨论第61-68页
   ·猪CS-1,CS-2和CS-3基因定位第61页
   ·猪CS-1和CS-2基因的时空表达规律第61页
   ·骨骼肌生成过程及主要调控因子第61-62页
   ·钙调神经磷酸酶信号通路在肌纤维中的作用第62-63页
   ·NFκB转录因子在不同肌纤维中的作用第63-65页
   ·钙调神经磷酸酶相关的转录因子对calsarcin基因启动子的调控第65-67页
   ·Calsarcins家族在肌纤维类型形成中的作用的推测第67-68页
6 小结第68-71页
 主要结论第68-69页
 本研究的创新点与特色第69页
 值得进一步研究的问题第69-71页
7 研究生期间完成的其它工作第71-76页
   ·猪JAK2,JAK3和TYK2基因的染色体定位研究第71-72页
   ·猪SFRS1基因的克隆,定位以及多态性研究第72-73页
   ·猪13号染色体上三个新基因的克隆和定位研究第73-74页
   ·猪ELPIN基因的克隆,定位以及其不同剪接体表达规律研究第74-75页
   ·猪EIF412基因的克隆,表达规律以及性状关联分析第75-76页
参考文献第76-82页
附录第82-94页
 附表1 用于研究猪calsarcin基因的引物和探针第82-84页
 附表2 用于研究小鼠calsarcin基因启动子的引物和探针第84-86页
 附表3 缩略词表第86-88页
 附图1 猪CS-1基因的mRNA序列和推测的氨基酸序列第88-89页
 附图2 猪CS-2基因的mRNA序列和推测的氨基酸序列第89-90页
 附图3 猪CS-3基因的mRNA序列和推测的氨基酸序列第90-91页
 附图4 猪CS-1基因的染色体定位第91-92页
 附图5 猪CS-1基因的染色体定位第92-93页
 附图6 猪CS-1基因的染色体定位第93-94页
在读期间发表的论文第94-95页
致谢第95页

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