基于混合遗传算法的蛋白质结构预测研究
| 第1章 绪论 | 第1-14页 |
| ·研究背景及现伏 | 第9-10页 |
| ·研究目的与技术路线 | 第10-11页 |
| ·研究目的 | 第10-11页 |
| ·技术路线 | 第11页 |
| ·本文的主要工作 | 第11-13页 |
| ·HP立方格点模型 | 第11-12页 |
| ·搜索自由能最小的天然蛋白质三维结构 | 第12页 |
| ·折叠过程的可视化 | 第12-13页 |
| ·论文的组织 | 第13-14页 |
| 第2章 蛋白质与蛋白质结构预测 | 第14-27页 |
| ·蛋白质简介 | 第14-17页 |
| ·氨基酸及其基本结构 | 第15页 |
| ·蛋白质的基本组成 | 第15-16页 |
| ·蛋白质的结构 | 第16页 |
| ·蛋白质的功能 | 第16-17页 |
| ·蛋白质三维结构预测 | 第17-18页 |
| ·蛋白质三维结构预测的研究背景 | 第17-18页 |
| ·蛋白质三维结构预测的意义 | 第18页 |
| ·获得蛋白质三维结构的两种方法 | 第18-22页 |
| ·蛋白质序列分析方法 | 第19页 |
| ·蛋白质折叠 | 第19-21页 |
| ·蛋白质折叠与蛋白质序列分析方法的区别 | 第21-22页 |
| ·蛋白质三维结构模型 | 第22-27页 |
| ·HP格子模型简介 | 第22页 |
| ·二维整点模型 | 第22-23页 |
| ·立方格点模型 | 第23-25页 |
| ·三角格子模型 | 第25页 |
| ·蛋白质折叠中的其它几种模型 | 第25-27页 |
| 第3章 能量函数优化模型 | 第27-35页 |
| ·经验势能函数 | 第27-28页 |
| ·平均势能函数 | 第28-32页 |
| ·平均势函数 | 第28-29页 |
| ·简化平均势函数 | 第29-32页 |
| ·基于简化能量函数的HP立方格点模型的能量计算 | 第32-35页 |
| 第4章 基于混合遗传算法的蛋白质结构预测 | 第35-63页 |
| ·模拟退火法 | 第35-41页 |
| ·模拟退火算法及其基本思想 | 第36-38页 |
| ·模拟退火算法的优缺点 | 第38-40页 |
| ·基于模拟退火算法的蛋白质三维结构的预测 | 第40-41页 |
| ·遗传算法 | 第41-45页 |
| ·遗传算法及其基本思想 | 第41-43页 |
| ·遗传算法的优缺点 | 第43-44页 |
| ·基于遗传算法的蛋白质三维结构的预测 | 第44-45页 |
| ·基于混合遗传算法的蛋白质结构预测 | 第45-63页 |
| ·混合遗传算法及其基本思想 | 第45-46页 |
| ·生成初始种群的算法描述 | 第46-53页 |
| ·蛋白质折叠模拟退火和遗传算法实现描述 | 第53-59页 |
| ·实验结果 | 第59-63页 |
| 第5章 基于JAVA3D的蛋白质结构仿真 | 第63-73页 |
| ·Java3D技术 | 第63-68页 |
| ·Java3D概述 | 第63-64页 |
| ·Java3D与其他三维技术的比较 | 第64-65页 |
| ·Java3D的场景图 | 第65-67页 |
| ·Java3D的坐标系统 | 第67-68页 |
| ·基于Java3D的蛋白质结构仿真 | 第68-73页 |
| ·Java3D模拟蛋白质三维结构程序实现 | 第68-72页 |
| ·试验结果 | 第72-73页 |
| 第6章 结论与展望 | 第73-76页 |
| ·主要成果与创新点 | 第73-74页 |
| ·有待进一步研究的工作 | 第74-76页 |
| 参考文献 | 第76-80页 |
| 致谢 | 第80-81页 |
| 附录: 攻读期间发表的论文和参加的项目 | 第81页 |
