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柑橘体细胞胞质遗传及叶绿体SSR引物开发研究

摘要第1-10页
Abstract第10-14页
缩略词表第14-15页
第一章 文献综述第15-33页
 1 植物细胞质基因组的研究进展第15-19页
   ·植物线粒体基因组第15-18页
     ·植物线粒体基因组的结构第15页
     ·植物线粒体的分子生物学研究概述第15-16页
     ·植物线粒体基因组近两年的研究热点第16-17页
     ·雄性不育分子机理第17页
     ·植物线粒体的功能第17-18页
   ·植物叶绿体基因组研究进展第18-19页
     ·叶绿体基因组的结构第18页
     ·叶绿体基因组的研究近况第18-19页
 2 植物细胞质基因组的研究方法第19-21页
   ·RFLP分析第20页
   ·基因组序列测定第20页
   ·CAPS分析第20-21页
   ·叶绿体SSR(cpSSR)分析第21页
 3 植物有性生殖过程中胞质基因组的遗传规律第21-22页
 4 胞质基因组与农作物遗传改良第22-24页
   ·线粒体与雄性不育第22-23页
   ·叶绿体与雄性不育第23页
   ·叶绿体在植物基因工程研究中的应用第23-24页
 5 原生质体融合与胞质基因组转移第24-29页
   ·融合过程中叶绿体的遗传第24-26页
     ·原生质体融合中叶绿体的传递机理第25-26页
   ·融合过程中线粒体的遗传第26-27页
   ·原生质体融合实现作物有益农艺性状的定向转移第27-29页
     ·原生质体融合实现CMS定向转移第27-29页
     ·原生质体融合实现叶绿体控制性状的转移第29页
 6 柑橘体细胞杂种胞质基因组研究进展第29-31页
 7 开展本研究的目的与意义第31-33页
第二章 柑橘体细胞杂种的胞质遗传研究第33-79页
 1 前言第33页
 2 材料与方法第33-40页
   ·实验材料第33-36页
     ·本研究所选用的柑橘体细胞杂种和胞质杂种第33页
     ·RFLP分析所使用的探针第33-36页
   ·方法第36-40页
     ·总DNA的提取第36页
     ·DNA酶切与电泳分离第36-37页
     ·Southern印迹第37页
     ·RFLP分析中探针的获得第37页
     ·Southern杂交第37-38页
       ·预杂交第37-38页
       ·探针标记第38页
       ·杂交#。24第38页
       ·洗膜第38页
     ·CAPS分析第38页
     ·数据处理与聚类分析第38-39页
     ·SSR分析第39页
     ·AFLP分析第39页
     ·细胞染色体的倍性分析第39页
     ·RNA的提取第39-40页
     ·RNA电泳和印迹第40页
     ·Northern杂交第40页
 3 结果与分析第40-74页
   ·高质量柑橘DNA提取方法的改进与完善第40-42页
   ·柑橘体细胞杂种及胞质杂种胞质遗传的CAPS分析第42-46页
     ·柑橘体细胞杂种及胞质杂种线粒体遗传的CAPS分析第42-44页
     ·柑橘体细胞杂种及胞质杂种叶绿体遗传的CAPS分析第44-46页
   ·柑橘体细胞杂种和胞质杂种细胞质遗传的RFLP分析第46-68页
     ·柑橘体细胞杂种及胞质杂种线粒体遗传的RFLP分析第46-56页
       ·属间体细胞杂种及胞质杂种的线粒体遗传第46-56页
       ·1 红橘+枳壳属间杂种线粒体的遗传组成特点第49-50页
       ·2 佩奇橘柚+枳壳属间体细胞杂种线粒体遗传分析第50-52页
       ·3 伏令夏橙+宁波金柑体细胞杂种mtDNA的RFLP分析第52-56页
       ·3.1 生长异常的柑橘属间体细胞杂种的线粒体稳定性研究第53-55页
       ·3.2 生长异常的属间体细胞杂种的核背景分析第55-56页
       ·柑橘属间体细胞杂种线粒体的遗传组成特点第56页
     ·柑橘种间体细胞杂种及胞质杂种线粒体的RFLP分析第56-68页
       ·纽荷尔脐橙+冰糖橘种间胞质杂种线粒体的遗传组成分析第60-62页
       ·朋娜脐橙+红玉葡萄柚胞质杂种线粒体遗传组成的RFLP分析第62-63页
       ·金诺橘+橙类体细胞杂种线粒体的遗传组成特征第63-64页
       ·哈姆林甜橙+粗柠檬(HR)、HR作叶肉亲本与其它柑橘类种间二次融合再生杂种植株线粒体的遗传组成分析第64-66页
       ·柑橘体细胞杂种实生苗线粒体遗传组成的RFLP分析第66页
       ·同一融合组合得到不同倍性杂种植株线粒体的遗传组成分析第66-68页
   ·柑橘原生质体融合过程中线粒体遗传重组的特点第68-70页
   ·柑橘体细胞杂种及胞质杂种线粒体基因的表达分析第70-71页
   ·柑橘体细胞杂种及胞质杂种叶绿体RFLP分析第71-74页
 4 讨论第74-79页
   ·柑橘等果树作物DNA提取方法的改进第74页
   ·CAPS标记在柑橘体细胞杂种胞质基因组分析中的应用第74-75页
   ·RFLP标记对两种细胞质基因组分析效率的比较第75-76页
   ·线粒体遗传不稳定性与柑橘体细胞杂种植株生长异常的关系第76-77页
   ·不同组织形态线粒体传递能力的影响第77页
   ·不同基因型线粒体传递能力的差异第77-79页
第三章 柑橘叶绿体SSR引物的开发第79-103页
 1 前言第79-80页
 2 材料与方法第80-84页
   ·用于cpSSR引物开发的材料第80-82页
   ·总DNA的提取第82页
   ·柑橘cpSSR引物的开发第82页
   ·PCR扩增、电泳及染色第82-83页
   ·cpSSR特异片段的克隆与测序第83页
     ·特异性片段的回收第83页
     ·特异性片段的克隆第83页
       ·片段与载体连接第83页
       ·转化第83页
       ·转化子鉴定第83页
     ·克隆片段测序第83页
   ·数据处理与聚类分析第83-84页
     ·DNA序列比对分析第83页
     ·cpSSR数据处理第83-84页
 3 结果与分析第84-98页
   ·cpSSR引物的获得第84-87页
   ·柑橘cpSSR位点多态性水平的检测第87-88页
   ·聚类分析第88-90页
   ·多态性位点的序列分析第90-93页
   ·cpSSR在柑橘体细胞杂种叶绿体遗传分析中的应用第93-94页
   ·cpSSR引物在果树作物中的通用性验证第94-98页
 4 讨论第98-103页
   ·柑橘cpSSR(cpSSR)引物的开发第98-99页
   ·cpSSR与CAPS引物的比较第99页
   ·cpSSR与核基因组SSR的比较第99-100页
   ·柑橘叶绿体CAPS与SSR两种标记方法的比较第100页
   ·运用cpSSR标记研究几个起源有争议的柑橘类型在分类学中的地位第100-101页
   ·cpSSR标记与柑橘体细胞杂种叶绿体基因组遗传分析第101-102页
   ·cpSSR标记的局限性第102页
   ·cpSSR引物可能的应用潜力第102-103页
第四章 柑橘愈伤组织继代保存过程中胞质遗传稳定性研究第103-121页
 1 前言第103-104页
 2 实验材料与方法第104-107页
   ·实验材料第104-105页
   ·实验方法第105-107页
     ·RFLP及cpSSR分析同前两章。第105页
     ·组织切片、细胞器DNA的荧光染色及显微观察第105-106页
       ·材料处理与样品制备第105-106页
       ·材料的染色与观察第106页
     ·细胞核DNA的提取第106-107页
       ·完整细胞核的分离第106页
       ·细胞核完整性的观察第106页
       ·细胞核裂解与核DNA的提取第106-107页
     ·细胞核DNA的斑点杂交第107页
 3 结果与分析第107-119页
   ·柑橘愈伤组织继代保存过程中线粒体基因组的变异第107页
   ·柑橘愈伤组织继代保存过程中mtDNA含量的变化第107-109页
   ·柑橘愈伤组织保存过程中质体基因组稳定性分析第109-112页
     ·柑橘愈伤组织保存过程中质体基因组稳定性的RFLP分析第109-110页
     ·柑橘愈伤组织保存过程中质体基因组稳定性的SSR分析第110-112页
   ·柑橘愈伤组织及田间材料中线粒体的切片与荧光染色观察第112-117页
     ·愈伤组织与田间材料在细胞形态、结构上的差异第112页
     ·mtDNA含量的变化第112-115页
     ·柑橘愈伤组织与田间材料质体(叶绿体)含量的比较第115页
     ·柑橘体细胞杂种和胞质杂种细胞器的组织切片观察第115-117页
   ·细胞核的分离及线粒体向细胞核转移的初步分析第117-118页
   ·柑橘体细胞杂种线粒体偏亲来源的一种可能机制第118-119页
 4 讨论第119-121页
   ·柑橘愈伤组织继代保存过程中mtDNA和cpDNA的遗传变异比较第119-120页
   ·影响柑橘愈伤组织胞质基因组遗传变异的可能因素第120-121页
第五章 总讨论第121-128页
 1 柑橘体细胞杂交中胞质基因组遗传的可能机理第121-126页
   ·基于本研究结果的推理与假设第121页
   ·体细胞杂种叶绿体遗传的可能机制第121-122页
   ·体细胞杂种线粒体遗传的可能机制第122-123页
   ·核基因型之间的竞争第123-126页
 2 柑橘体细胞杂种“返祖”的可能机制第126-128页
   ·mtDNA的丢失第126页
   ·愈伤组织中mtDNA向核基因组转移给原生质体融合可能带来的影响第126-128页
参考文献第128-140页
附录Ⅰ 柑橘DNA提取Protocol第140-142页
附录Ⅱ 34份柑橘及其近缘属材料cpSSR标记的遗传距离第142-143页
附录Ⅲ 攻读博士学位期间发表论文目录第143-145页
致谢第145页

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