基因组中最大唯一匹配的查找算法研究
| 摘要 | 第1-4页 |
| Abstract | 第4-7页 |
| 第一章 绪论 | 第7-15页 |
| ·背景介绍 | 第7-11页 |
| ·研究现状 | 第11-13页 |
| ·论文工作 | 第13-15页 |
| 第二章 后缀树 | 第15-21页 |
| ·后缀树简介 | 第15-17页 |
| ·后缀树的构造算法 | 第17-19页 |
| ·构造后缀树的朴素算法 | 第17页 |
| ·构造后缀树的Ukkonen算法 | 第17-19页 |
| ·后缀树中的字符串匹配问题 | 第19-20页 |
| ·本章小结 | 第20-21页 |
| 第三章 后缀数组 | 第21-31页 |
| ·后缀数组简介 | 第21页 |
| ·后缀数组构造算法 | 第21-30页 |
| ·后缀数组的构造 | 第24-27页 |
| ·查找LCP | 第27-30页 |
| ·本章小结 | 第30-31页 |
| 第四章 全基因序列比对 | 第31-41页 |
| ·相关介绍 | 第31-32页 |
| ·后缀树和后缀数组的联系 | 第32页 |
| ·查找MUM | 第32-35页 |
| ·利用后缀树查找MUM | 第33-34页 |
| ·利用后缀数组查找MUM | 第34-35页 |
| ·MUM的排序 | 第35-38页 |
| ·LIS问题描述 | 第35页 |
| ·LIS算法的动态规划求解 | 第35-36页 |
| ·改进的LIS算法 | 第36-38页 |
| ·实验结果分析 | 第38-39页 |
| ·实验环境 | 第38页 |
| ·实验数据 | 第38页 |
| ·实验结果 | 第38-39页 |
| ·结论 | 第39页 |
| ·本章小结 | 第39-41页 |
| 第五章 总结与展望 | 第41-43页 |
| 致谢 | 第43-45页 |
| 参考文献 | 第45-49页 |
| 研究成果 | 第49页 |
