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利用PCR-DGGE研究膜生物反应器中微生物的群落结构

中文摘要第1-4页
ABSTRACT第4-10页
第一章 绪论第10-30页
   ·课题研究的背景及意义第10-11页
   ·国内外研究现状与发展动态第11-18页
     ·用于环境微生物的分子生物学技术第11-13页
     ·微生物学研究进展第13-16页
     ·国内外PCR-DGGE 技术在环境微生物领域的应用第16-18页
   ·研究中用到的主要分子生物学技术第18-25页
     ·活性污泥样品中基因组DNA 的提取与纯化第18-19页
     ·PCR(聚合酶链式)反应第19-23页
     ·变性梯度凝胶电泳技术(DGGE)原理及应用第23-25页
   ·生物多样性、DNA 克隆测序及微生物分类鉴定第25-28页
     ·生物多样性第25-26页
     ·DNA 片段克隆测序第26页
     ·系统发育分析第26-28页
   ·主要研究内容和目的第28-30页
第二章 研究的技术路线、方法和材料第30-39页
   ·研究中采用的技术路线第30页
   ·常规实验项目分析和测定方法第30-31页
   ·污泥样品的预处理与总DNA 的提取纯化第31-32页
     ·样品预处理第31页
     ·基因组DNA 的提取第31页
     ·DNA 的纯化第31-32页
     ·DNA 提取试剂第32页
   ·基因组DNA 的PCR 扩增第32-34页
     ·总细菌的降落式PCR 扩增第32页
     ·亚硝酸菌的巢式PCR(Nested PCR)扩增第32-33页
     ·硝酸菌的巢式PCR(Nested PCR)扩增第33-34页
     ·反硝化细菌的巢式PCR(Nested PCR)扩增第34页
     ·PCR 扩增所用试剂第34页
   ·基因组DNA 及PCR 扩增结果检测第34-35页
     ·基因组DNA 提取结果检测第35页
     ·PCR 扩增结果检测第35页
     ·琼脂糖电泳所用试剂第35页
   ·PCR 产物的纯化浓缩第35页
   ·PCR 产物的变性梯度凝胶电泳分析(DGGE)第35-37页
     ·操作步骤第35-36页
     ·DGGE 试剂和配制第36-37页
   ·DGGE 凝胶片段的回收及克隆测序第37页
   ·多样性的信息度量Shannon-Wiener 指数第37-38页
   ·DGGE 图谱中的相似性分析和聚类分析第38页
   ·主要实验仪器第38-39页
第三章MBR反应器培养驯化阶段微生物群落结构的演替第39-63页
   ·工艺描述与取样条件第39-41页
     ·工艺概述第39-40页
     ·MBR 反应器污泥接种培养驯化第40页
     ·正常运行工况第40页
     ·取样条件及样品编号第40-41页
   ·MBR 反应器培养驯化期间污泥浓度和沉降比的变化第41-43页
     ·MBR 反应器污泥浓度(MLSS)的变化情况第41-42页
     ·MBR 反应器的污泥沉降比(SV_(30))的变化情况第42-43页
   ·活性污泥样品基因组DNA 提取结果第43页
   ·总细菌种群结构分析第43-51页
     ·总细菌DNA 的PCR 扩增第43-44页
     ·PCR 产物的变性梯度凝胶电泳分析第44-47页
     ·总细菌Shannon-Wiener 多样性指数分析第47-48页
     ·污泥样品DGGE 图谱中的相似性分析和聚类分析第48-51页
   ·亚硝酸菌种群结构分析第51-58页
     ·亚硝酸菌的巢式PCR 扩增第51-52页
     ·亚硝酸菌PCR 产物的变性梯度凝胶电泳分析第52-55页
     ·亚硝酸菌Shannon-Wiener 多样性指数分析第55页
     ·亚硝酸菌DGGE 图谱的相似性分析第55-58页
   ·部分优势总细菌的片段克隆测序分析和菌种鉴定第58-61页
     ·切胶回收DNA 的PCR 扩增第58页
     ·切胶回收克隆测序和细菌系统发育树分析第58-61页
   ·本章小结第61-63页
第四章 正常工况下不同MBR反应器微生物群落结构的研究第63-84页
   ·工艺状况描述与取样条件第63-65页
     ·空港物流加工区中水厂MBR 反应器第63页
     ·空港物流加工区MBR 小试反应器实验装置第63-64页
     ·某处理雨污水的MBR 实验装置第64页
     ·某医院污水MBR 反应器处理系统第64页
     ·学生公寓污水MBR 处理系统第64-65页
     ·游泳馆洗浴污水MBR 处理系统第65页
   ·活性污泥样品基因组DNA 提取结果第65-66页
   ·总细菌种群结构分析第66-71页
     ·总细菌DNA 的PCR 扩增第66页
     ·PCR 产物的变性梯度凝胶电泳分析第66-69页
     ·总细菌Shannon-Wiener 多样性指数分析第69-70页
     ·总细菌的DGGE 图谱相似性分析第70-71页
   ·硝酸菌种群结构分析第71-74页
     ·硝酸菌的巢式PCR 扩增第71页
     ·硝酸菌第二轮PCR 产物的变性梯度凝胶电泳分析第71-73页
     ·硝酸菌Shannon-Wiener 多样性指数分析第73-74页
     ·硝酸菌的DGGE 图谱相似性分析第74页
   ·反硝化细菌种群结构分析第74-78页
     ·反硝化细菌的巢式PCR 扩增第75页
     ·反硝酸菌第二轮PCR 产物的变性梯度凝胶电泳分析第75-77页
     ·反硝酸菌Shannon-Wiener 多样性指数分析第77-78页
     ·反硝化细菌的DGGE 图谱相似性分析第78页
   ·部分优势菌种的片段测序分析和菌种鉴定第78-82页
     ·切胶回收DNA 的PCR 扩增第78-79页
     ·切胶回收克隆测序和细菌系统发育树分析第79-82页
   ·本章小结第82-84页
第五章 结论和建议第84-87页
   ·结论第84-85页
   ·建议第85-87页
参考文献第87-94页
发表论文和科研情况说明第94-95页
致谢第95页

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