| 摘要 | 第1-11页 |
| Abstract | 第11-14页 |
| 缩略词表 | 第14-15页 |
| 1 文献综述 | 第15-47页 |
| ·前言 | 第15页 |
| ·植物体内氮的营养特征 | 第15-17页 |
| ·植物体内氮的含量与分布 | 第15-16页 |
| ·植物体内氮的存在形式及其生理功能 | 第16-17页 |
| ·植物体对氮素的吸收、运转、同化和再分配 | 第17-19页 |
| ·氮素的吸收和运转 | 第17-18页 |
| ·氮素的同化 | 第18页 |
| ·氮素的再分配 | 第18-19页 |
| ·植物氮代谢中的重要基因 | 第19-24页 |
| ·铵转运子(AMT) | 第19-20页 |
| ·肖酸根转运子(NRT) | 第20页 |
| ·肖酸还原酶(NR) | 第20-21页 |
| ·谷氨酰胺合成酶(GS) | 第21-22页 |
| ·谷氨酸合成酶(GOGAT) | 第22-23页 |
| ·谷氨酸脱氢酶(GDH) | 第23-24页 |
| ·天冬酰胺合成酶(AS) | 第24页 |
| ·植物氮营养高效基因型的选择指标 | 第24-28页 |
| ·产量指标 | 第24-25页 |
| ·氮代谢关键酶的酶活 | 第25-26页 |
| ·叶绿素SPAD值 | 第26页 |
| ·植物根系相关指标 | 第26-27页 |
| ·其他指标 | 第27-28页 |
| ·水稻种质资源研究进展 | 第28-30页 |
| ·核心种质概念的提出 | 第28页 |
| ·核心种质的特点 | 第28-29页 |
| ·水稻核心种质研究进展 | 第29-30页 |
| ·单核苷酸多样性与选择、进化 | 第30-42页 |
| ·单核苷酸多样性概述 | 第30-31页 |
| ·DNA测序技术的发展 | 第31-37页 |
| ·Sanger法测序 | 第31-32页 |
| ·Roche公司454测序技术 | 第32-33页 |
| ·Illumina公司Solexa测序技术 | 第33-34页 |
| ·ABI公司SOLiD测序技术 | 第34-35页 |
| ·Helicos公司单分子测序技术 | 第35-36页 |
| ·Pacific Biosciences公司单分子实时测序技术 | 第36页 |
| ·Oxford Nanopore公司纳米孔单分子测序技术 | 第36-37页 |
| ·检测选择作用的一般方法 | 第37-40页 |
| ·基于种内多态性的中性检测 | 第37-38页 |
| ·Tajima's D检验 | 第37-38页 |
| ·Fu和Li的D和F检验 | 第38页 |
| ·Fay和Wu的H检验 | 第38页 |
| ·基于种间多态性的中性检验 | 第38-39页 |
| ·McDonald和Kreitman(MK)检验 | 第38-39页 |
| ·Hudson-Kreitman-Aquade(HKA)检验 | 第39页 |
| ·Ka/Ks检验 | 第39页 |
| ·基于单倍型比较的检验方法 | 第39-40页 |
| ·Long Range Haplotypes(LRH)检验 | 第40页 |
| ·iHH Score(iHS)检验 | 第40页 |
| ·Linkage Disequilibrium Decay(LDD)检验 | 第40页 |
| ·一些受到选择作用的基因 | 第40-42页 |
| ·植物关联分析研究进展 | 第42-45页 |
| ·连锁不平衡(LD)的度量及其影响因素 | 第42-43页 |
| ·关联分析的基本方法及其影响因素 | 第43-44页 |
| ·关联分析的应用 | 第44-45页 |
| ·本研究的目的与意义 | 第45-47页 |
| 2 氮代谢基因核苷酸多样及其与产量性状的关联分析 | 第47-96页 |
| ·材料与方法 | 第47-64页 |
| ·研究材料 | 第47-53页 |
| ·田间种植与表型调查 | 第53-56页 |
| ·测序基因的选择 | 第56页 |
| ·DNA的抽提 | 第56-57页 |
| ·PCR扩增与测序 | 第57-61页 |
| ·SSR标记与群体结构 | 第61-63页 |
| ·标记来源 | 第61页 |
| ·PCR扩增与显色反应 | 第61-63页 |
| ·群体结构 | 第63页 |
| ·数据分析 | 第63-64页 |
| ·结果与分析 | 第64-91页 |
| ·关联群体各表型性状的变异 | 第64-68页 |
| ·核苷酸多样性分析 | 第68-75页 |
| ·中性检测 | 第75页 |
| ·群体结构 | 第75-76页 |
| ·连锁不平衡(LD)分析 | 第76-78页 |
| ·单倍型分析 | 第78-83页 |
| ·多态性位点-表型的关联分析 | 第83-87页 |
| ·单倍型-表型的关联分析 | 第87-89页 |
| ·等位基因效应的验证 | 第89-91页 |
| ·讨论 | 第91-96页 |
| ·核苷酸多样性水平 | 第91-92页 |
| ·氮代谢基因的籼-粳分化 | 第92-93页 |
| ·连锁不平衡与关联分析 | 第93-94页 |
| ·对水稻育种的意义 | 第94-96页 |
| 3 OsAMT1;1基因多样性与选择性扫荡 | 第96-122页 |
| ·材料与方法 | 第96-100页 |
| ·研究材料 | 第96页 |
| ·DNA的抽提 | 第96页 |
| ·PCR扩增与测序 | 第96页 |
| ·数据分析 | 第96-100页 |
| ·结果与分析 | 第100-112页 |
| ·OsAMT1;1核苷酸多样性分析 | 第100-107页 |
| ·OsAMT1;1单倍型分析 | 第107页 |
| ·OsAMT1;1周围的选择性扫荡 | 第107-112页 |
| ·讨论 | 第112-122页 |
| ·OsAMT1;1核苷酸多样性与选择 | 第112-116页 |
| ·OsAMT1;1受到选择作用的原因 | 第116-120页 |
| ·OsAMT1;1的进化过程 | 第120-122页 |
| 参考文献 | 第122-140页 |
| 附录 | 第140-141页 |
| 致谢 | 第141页 |
