| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第一章 绪论 | 第8-15页 |
| 1.1 荧光分子与DNA分子微力学性质研究背景 | 第8-13页 |
| 1.1.1 DNA双螺旋结构及其与荧光分子相互作用简介 | 第8-9页 |
| 1.1.2 YOYO-1对DNA分子微力学性质影响研究进展 | 第9-13页 |
| 1.2 本文的研究目的与研究内容 | 第13-14页 |
| 1.2.1 研究目的 | 第13页 |
| 1.2.2 研究内容 | 第13-14页 |
| 1.3 本文创新点 | 第14-15页 |
| 第二章 理论模型、模拟方法及环状DNA拓扑结构 | 第15-24页 |
| 2.1 蠕虫链模型 | 第15-17页 |
| 2.2 蠕虫棒模型 | 第17-18页 |
| 2.3 蒙特卡洛模拟方法 | 第18-19页 |
| 2.4 环状DNA拓扑结构 | 第19-23页 |
| 2.4.1 连接数 | 第20-22页 |
| 2.4.2 扭转数 | 第22页 |
| 2.4.3 环绕数 | 第22-23页 |
| 2.5 本章小结 | 第23-24页 |
| 第三章 基于蠕虫链模型研究荧光分子对DNA拓扑结构的影响 | 第24-38页 |
| 3.1 引言 | 第24-25页 |
| 3.2 荧光分子与DNA相互作用模型 | 第25页 |
| 3.3 基于蠕虫链模型的模拟计算 | 第25-27页 |
| 3.4 扭转数分布的计算 | 第27-29页 |
| 3.5 连接数分布的计算 | 第29-30页 |
| 3.6 结果与讨论 | 第30-37页 |
| 3.6.1 YOYO-1嵌入对环状DNA环绕数分布的影响 | 第30-33页 |
| 3.6.2 嵌入YOYO-1对环状DNA连接数分布的影响 | 第33-35页 |
| 3.6.3 去扭转角对环状DNA连接数分布的影响 | 第35-36页 |
| 3.6.4 扭转刚度对环状DNA连接数分布的影响 | 第36-37页 |
| 3.7 本章小结 | 第37-38页 |
| 第四章 基于蠕虫棒模型研究荧光分子对DNA拓扑结构的影响 | 第38-60页 |
| 4.1 引言 | 第38-39页 |
| 4.2 荧光分子对环状DNA拓扑结构影响模型 | 第39-40页 |
| 4.3 基于蠕虫棒模型的模拟 | 第40-43页 |
| 4.4 局部扭转角的计算 | 第43-44页 |
| 4.5 回转半径 | 第44页 |
| 4.6 结果与讨论 | 第44-58页 |
| 4.6.1 初始扭转角对环状DNA拓扑结构的影响 | 第44-49页 |
| 4.6.2 YOYO-1嵌入对环状DNA拓扑结构的影响 | 第49-58页 |
| 4.7 蠕虫链与蠕虫棒两种模型荧光分子对环状DNA拓扑结构影响的比较 | 第58-59页 |
| 4.8 本章小结 | 第59-60页 |
| 第五章 总结及展望 | 第60-62页 |
| 5.1 总结 | 第60-61页 |
| 5.2 展望 | 第61-62页 |
| 致谢 | 第62-63页 |
| 参考文献 | 第63-69页 |
| 附录 | 第69页 |
