基于脑网络组图谱的转录组分析软件开发与应用研究
| 摘要 | 第5-6页 |
| abstract | 第6-7页 |
| 第一章 绪论 | 第10-16页 |
| 1.1 课题背景及研究意义 | 第10-11页 |
| 1.2 国内外研究现状 | 第11-12页 |
| 1.3 本论文的主要贡献与创新 | 第12页 |
| 1.4 本论文的研究内容 | 第12-14页 |
| 1.5 论文章节安排 | 第14-16页 |
| 第二章 数据查询模块详细设计与实现 | 第16-23页 |
| 2.1 软件涉及数据介绍 | 第16-17页 |
| 2.1.1 艾伦转录组数据 | 第16页 |
| 2.1.2 脑网络组图谱 | 第16-17页 |
| 2.2 数据查询模块软件设计与实现 | 第17-22页 |
| 2.2.1 转录组样本映射 | 第17-20页 |
| 2.2.2 基因探针查询 | 第20-21页 |
| 2.2.3 基因表达数据查询 | 第21-22页 |
| 2.3 本章小结 | 第22-23页 |
| 第三章 数据预处理模块详细设计与实现 | 第23-28页 |
| 3.1 数据预处理方法介绍与实现 | 第23-25页 |
| 3.1.1 数据归一化 | 第23-24页 |
| 3.1.2 回归协变量 | 第24页 |
| 3.1.3 维数约简 | 第24-25页 |
| 3.2 数据预处理模块软件设计与实现 | 第25-27页 |
| 3.3 本章小结 | 第27-28页 |
| 第四章 数据分析模块详细设计与实现 | 第28-51页 |
| 4.1 转录组数据分析方法介绍与实现 | 第28-41页 |
| 4.1.1 强度分数分析 | 第28-29页 |
| 4.1.2 相关分析 | 第29-30页 |
| 4.1.3 聚类分析 | 第30-32页 |
| 4.1.4 分类分析 | 第32-36页 |
| 4.1.5 关联分析 | 第36-41页 |
| 4.2 数据分析模块软件设计与实现 | 第41-50页 |
| 4.3 本章小结 | 第50-51页 |
| 第五章 基底神经节亚区转录特征分析的应用示例 | 第51-62页 |
| 5.1 分析方法 | 第51-53页 |
| 5.1.1 基底神经节亚区的转录组分类 | 第51-52页 |
| 5.1.2 基因本体论富集分析 | 第52页 |
| 5.1.3 艾伦转录组样本的个体差异 | 第52-53页 |
| 5.2 分析结果 | 第53-60页 |
| 5.2.1 基底神经节组织的转录组预测 | 第53-57页 |
| 5.2.2 基底神经节子区的转录特征 | 第57-60页 |
| 5.2.3 基底神经节组织的个体差异和转录组预测 | 第60页 |
| 5.3 结果讨论 | 第60-62页 |
| 第六章 总结与展望 | 第62-64页 |
| 6.1 工作总结 | 第62-63页 |
| 6.2 工作展望 | 第63-64页 |
| 致谢 | 第64-65页 |
| 参考文献 | 第65-67页 |
