| 摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 第1章 绪论 | 第10-19页 |
| 1.1 课题研究背景及研究的目的和意义 | 第10-13页 |
| 1.1.1 课题研究的背景 | 第10-12页 |
| 1.1.2 课题研究的目的和意义 | 第12-13页 |
| 1.2 国内外研究现状及分析 | 第13-17页 |
| 1.2.1 构建自动抽取蛋白质作用关系国内外研究现状 | 第13-16页 |
| 1.2.2 自动抽取蛋白质相互作用关系的分析 | 第16-17页 |
| 1.3 本文的主要研究内容 | 第17-19页 |
| 第2章 基本概念和核心技术介绍 | 第19-32页 |
| 2.1 条件随机场 | 第19-22页 |
| 2.1.1 简介 | 第19-21页 |
| 2.1.2 条件随机场算法 | 第21-22页 |
| 2.2 实体识别 | 第22-26页 |
| 2.2.1 实体识别简介 | 第22-23页 |
| 2.2.2 实体识别主要使用技术分类 | 第23-25页 |
| 2.2.3 IOBEW模型 | 第25-26页 |
| 2.3 蛋白质实体标准化 | 第26-31页 |
| 2.3.1 标准化简介 | 第26-27页 |
| 2.3.2 蛋白质实体标准化类别 | 第27-29页 |
| 2.3.3 距离编辑算法 | 第29-31页 |
| 2.4 本章小结 | 第31-32页 |
| 第3章 蛋白质相互作用对自动抽取的方法研究和系统实现 | 第32-56页 |
| 3.1 简介 | 第32-33页 |
| 3.2 构建自动抽取蛋白质相互作用关系系统 | 第33-50页 |
| 3.2.1 文献预处理和使用数据说明 | 第33-37页 |
| 3.2.2 基于条件随机场的蛋白质实体识别 | 第37-38页 |
| 3.2.3 蛋白质实体标准化 | 第38-43页 |
| 3.2.4 蛋白质相互作用关系词和否定词识别 | 第43-44页 |
| 3.2.5 PPI关系的抽取 | 第44-49页 |
| 3.2.6 蛋白质相互作用网络的构建 | 第49-50页 |
| 3.3 蛋白质相互作用网络系统的实现 | 第50-55页 |
| 3.3.1 系统功能概述 | 第50-51页 |
| 3.3.2 PPI网络系统界面设计 | 第51-55页 |
| 3.4 本章小结 | 第55-56页 |
| 第4章 系统评测及改进 | 第56-61页 |
| 4.1 系统评测方法简介 | 第56-57页 |
| 4.2 蛋白质相互作用对自动抽取系统评测 | 第57-60页 |
| 4.2.1 实体识别模块评测 | 第57页 |
| 4.2.2 蛋白质实体标准化模块算法评测 | 第57-59页 |
| 4.2.3 蛋白质相互作用对抽取模块评测 | 第59-60页 |
| 4.3 蛋白质相互作用网络在线系统评测以及改进 | 第60页 |
| 4.4 本章小结 | 第60-61页 |
| 结论 | 第61-63页 |
| 参考文献 | 第63-68页 |
| 攻读硕士学位期间发表的论文 | 第68-70页 |
| 致谢 | 第70-71页 |