| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 1 文献综述和立项依据 | 第12-23页 |
| 1.1 龙须菜研究概述 | 第12-17页 |
| 1.1.1 龙须菜的生物学特征 | 第12-14页 |
| 1.1.2. 龙须菜的经济价值与生态修复功能 | 第14-15页 |
| 1.1.3. 龙须菜的理论研究与大规模栽培 | 第15-17页 |
| 1.2 分子标记概述 | 第17-19页 |
| 1.2.1 分子标记的概念 | 第17页 |
| 1.2.2 代表性分子标记技术简介 | 第17-19页 |
| 1.3 SSR 分子标记的研究进展 | 第19-22页 |
| 1.3.1 SSR 的特点及技术原理 | 第19-20页 |
| 1.3.2 SSR 分子标记的开发方法 | 第20-22页 |
| 1.4 本研究的目的和意义 | 第22-23页 |
| 2. GENOME SURVEY 开发 SSR 标记 | 第23-32页 |
| 2.1 实验材料 | 第23页 |
| 2.2 实验仪器和试剂 | 第23-24页 |
| 2.2.1 实验仪器 | 第23页 |
| 2.2.2 实验试剂 | 第23-24页 |
| 2.3 实验方法 | 第24-26页 |
| 2.3.1 基因组 DNA 的提取 | 第24-25页 |
| 2.3.2 SURVEY 测序 | 第25-26页 |
| 2.3.3 SSR 鉴定和引物设计 | 第26页 |
| 2.3.4 SSR 信息统计 | 第26页 |
| 2.4 实验结果 | 第26-30页 |
| 2.4.1 基因组 DNA 提取结果 | 第26-27页 |
| 2.4.2 SURVEY 测序结果 | 第27-28页 |
| 2.4.3 SSR 鉴定和引物设计结果 | 第28页 |
| 2.4.4 SSR 信息统计结果 | 第28-30页 |
| 2.5 讨论 | 第30-32页 |
| 2.5.1 SURVEY 测序组装评估 | 第30-31页 |
| 2.5.2 SSR 序列信息统计与比较 | 第31-32页 |
| 3. 多态性 SSR 标记的筛选 | 第32-48页 |
| 3.1 实验材料 | 第32页 |
| 3.2 实验仪器与试剂 | 第32-33页 |
| 3.2.1 实验仪器 | 第32页 |
| 3.2.2 实验试剂 | 第32-33页 |
| 3.3 实验方法 | 第33-36页 |
| 3.3.1 基因组 DNA 的提取 | 第33页 |
| 3.3.2 基因组 DNA 的质量检测 | 第33页 |
| 3.3.3 SSR 引物合成 | 第33页 |
| 3.3.4 SSR 引物退火温度筛选 | 第33-34页 |
| 3.3.5 多态性 SSR 引物筛选 | 第34-35页 |
| 3.3.6 多态性引物信息统计 | 第35-36页 |
| 3.3.7 多态性引物的毛细管电泳与测序验证 | 第36页 |
| 3.4 实验结果 | 第36-45页 |
| 3.4.1 各样本基因组 DNA 的提取结果 | 第36-37页 |
| 3.4.2 SSR 引物退火温度筛选结果 | 第37-38页 |
| 3.4.3 10 %聚丙烯酰氨凝胶电泳结果 | 第38页 |
| 3.4.4 多态性引物信息统计结果 | 第38-39页 |
| 3.4.5 毛细管电泳及测序验证结果 | 第39-45页 |
| 3.5 讨论 | 第45-48页 |
| 3.5.1 引物纯化方法探讨 | 第45页 |
| 3.5.2 聚丙烯酰胺凝胶电泳中存在的问题及解决方法 | 第45-46页 |
| 3.5.3 聚丙烯酰胺凝胶电泳鉴别多态性引物的准确性 | 第46-48页 |
| 4. SSR 分子标记技术分析龙须菜不同野生地理群体的遗传多样性 | 第48-59页 |
| 4.1 实验材料 | 第48页 |
| 4.2 实验仪器与试剂 | 第48页 |
| 4.2.1 实验仪器 | 第48页 |
| 4.2.2 实验试剂 | 第48页 |
| 4.3 实验方法 | 第48-49页 |
| 4.3.1 基因组 DNA 的提取 | 第48页 |
| 4.3.2 基因组 DNA 的质量检测 | 第48页 |
| 4.3.3 利用 SSR 引物进行 PCR 扩增 | 第48页 |
| 4.3.4 10 %聚丙烯酰氨凝胶电泳检测扩增结果 | 第48-49页 |
| 4.3.5 数据统计与遗传多样性分析 | 第49页 |
| 4.4 实验结果 | 第49-57页 |
| 4.4.1 扩大样本量后的聚丙烯酰氨凝胶电泳结果 | 第49页 |
| 4.4.2 多态性引物信息统计汇总 | 第49-51页 |
| 4.4.3 多态性 SSR 位点在所有样本中反应出的遗传多样性 | 第51页 |
| 4.4.4 利用 NEI 基因多样性指数与 SHANNON 多样性指数评估各群体的遗传多样性与遗传分化 | 第51-54页 |
| 4.4.5 群体内的遗传多样性分析 | 第54页 |
| 4.4.6 群体间的遗传分化及基因交流情况 | 第54-55页 |
| 4.4.7 分子方差分析结果 | 第55页 |
| 4.4.8 所有样本的聚类分析 | 第55-57页 |
| 4.5 讨论 | 第57-59页 |
| 5. 总结及对后续研究的影响 | 第59-60页 |
| 参考文献 | 第60-67页 |
| 附录 | 第67-79页 |
| 致谢 | 第79-80页 |
| 个人简历 | 第80页 |
| 发表与完成的学术论文 | 第80-81页 |
