| 摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-8页 |
| 1 文献综述 | 第12-21页 |
| 1.1 植物细胞质雄性不育 | 第12-15页 |
| 1.1.1 植物细胞质雄性不育的分子机制 | 第12-13页 |
| 1.1.2 玉米细胞质雄性不育研究进展 | 第13-15页 |
| 1.2 高等植物细胞器基因组研究 | 第15-17页 |
| 1.2.1 高等植物线粒体基因组结构及特点 | 第15-16页 |
| 1.2.2 高等植物叶绿体基因组结构及特点 | 第16-17页 |
| 1.3 高等植物线粒体基因组测序 | 第17-21页 |
| 1.3.1 DNA测序技术 | 第17-19页 |
| 1.3.2 高通量测序在植物线粒体基因组研究中的应用 | 第19-21页 |
| 2 本研究的目的意义 | 第21-22页 |
| 3 材料与方法 | 第22-29页 |
| 3.1 玉米材料与培养方法 | 第22页 |
| 3.2 实验材料 | 第22-23页 |
| 3.3 线粒体DNA提取与检测 | 第23-25页 |
| 3.3.1 玉米线粒体分离及线粒体DNA提取 | 第23-24页 |
| 3.3.2 线粒体DNA质量检测 | 第24-25页 |
| 3.4 线粒体DNA高通量测序 | 第25页 |
| 3.5 线粒体基因组序列分析 | 第25-27页 |
| 3.5.0 线粒体基因组组装 | 第25-26页 |
| 3.5.1 玉米线粒体和叶绿体基因预测及功能注释 | 第26页 |
| 3.5.2 重复序列及SSR分析 | 第26-27页 |
| 3.5.3 非编码RNA分析 | 第27页 |
| 3.6 玉米线粒体基因组比较分析 | 第27-29页 |
| 3.6.1 线粒体基因组同源性比较 | 第27页 |
| 3.6.2 线粒体基因组SNP检测及注释 | 第27-28页 |
| 3.6.3 线粒体基因组INDEL检测及注释 | 第28-29页 |
| 4 结果与分析 | 第29-62页 |
| 4.1 玉米线粒体分离及线粒体DNA提取 | 第29-31页 |
| 4.2 玉米线粒体DNA测序数据统计分析 | 第31-32页 |
| 4.3 玉米线粒体基因组组装 | 第32-34页 |
| 4.4 玉米线粒体基因组分析 | 第34-56页 |
| 4.4.1 线粒体基因预测与功能注释 | 第34-42页 |
| 4.4.2 线粒体基因组重复序列分析 | 第42-43页 |
| 4.4.3 线粒体基因组SSR分析 | 第43-45页 |
| 4.4.4 线粒体基因组同源序列与共线性分析 | 第45-49页 |
| 4.4.5 差异线粒体基因分析 | 第49-56页 |
| 4.5 玉米叶绿体基因组分析 | 第56-62页 |
| 4.5.1 玉米叶绿体基因组组装 | 第56-57页 |
| 4.5.2 叶绿体基因预测与注释 | 第57-58页 |
| 4.5.3 叶绿体基因组比较分析 | 第58-59页 |
| 4.5.4 叶绿体基因组变异位点分析 | 第59-62页 |
| 5 讨论 | 第62-65页 |
| 5.1 核背景对CMS-C线粒体基因组的影响分析 | 第62页 |
| 5.2 玉米CMS-C不育系与保持系线粒体基因组差异分析 | 第62-63页 |
| 5.3 两套玉米同核异质叶绿体基因组比较分析 | 第63-64页 |
| 5.4 玉米线粒体DNA测序与组装 | 第64-65页 |
| 参考文献 | 第65-69页 |
| 致谢 | 第69-70页 |
| 附件 | 第70-79页 |