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基于转录组学的紫花苜蓿抗寒分子机制研究

摘要第6-7页
Abstract第7-8页
第1章 绪论第9-16页
    1.1 引言第9页
    1.2 植物抗寒性的研究进展第9-11页
        1.2.1 低温胁迫对植物的影响第9-10页
        1.2.2 植物抗寒性应答机制第10-11页
    1.3 CBF转录因子的研究进展第11页
    1.4 紫花苜蓿的抗寒性第11-12页
    1.5 第二代测序第12-14页
        1.5.1 转录组研究在植物中的应用第12-13页
        1.5.2 miRNA研究在植物中的应用第13页
        1.5.3 miRNA靶基因研究在植物中的应用第13-14页
    1.6 本研究的目的和意义第14-15页
    1.7 技术路线第15-16页
第2章 紫花苜蓿寒冷胁迫的转录组分析第16-33页
    2.1 引言第16页
    2.2 材料与方法第16-21页
        2.2.1 实验材料第16页
        2.2.2 生物信息学软件和数据库第16页
        2.2.3 实验仪器第16-17页
        2.2.4 实验试剂第17-18页
        2.2.5 实验方法第18-21页
    2.3 结果与分析第21-31页
        2.3.1 紫花苜蓿的转录组序列拼接第21-25页
        2.3.2 低温和寒冷胁迫UniGene的鉴定和功能注释分析第25-27页
        2.3.3 转录因子参与寒冷胁迫应答第27-30页
        2.3.4 紫花苜蓿AP2/ERF转录因子在寒冷胁迫下表达模式分析第30-31页
    2.4 本章小结第31-33页
第3章 紫花苜蓿寒冷胁迫的小RNA测序分析第33-51页
    3.1 引言第33页
    3.2 实验材料和方法第33-36页
        3.2.1 生物信息学软件和数据库第33-34页
        3.2.2 实验仪器第34页
        3.2.3 实验方法第34-36页
    3.3 结果与分析第36-50页
        3.3.1 小RNA文库的高通量测序第36-42页
        3.3.2 茎环qRT-PCR验证miRNA基因的表达第42-45页
        3.3.3 紫花苜蓿miRNA的靶基因预测第45-47页
        3.3.4 靶基因的GO鉴定及表达分析第47-50页
    3.4 本章小结第50-51页
第4章 紫花苜蓿抗寒分子调控机制研究第51-60页
    4.1 引言第51页
    4.2 实验材料与方法第51-52页
        4.2.1 生物信息学软件和数据库第51页
        4.2.2 实验仪器第51-52页
        4.2.3 实验方法第52页
    4.3 结果与分析第52-59页
        4.3.1 紫花苜蓿基因调控网络的构建第52-56页
        4.3.2 蒺藜苜蓿基因调控网络模块分析第56-59页
    4.4 本章小结第59-60页
第5章 讨论第60-65页
    5.1 紫花苜蓿寒冷胁迫下转录组分析第60-62页
    5.2 紫花苜蓿寒冷胁迫下miRNA基因的表达第62-63页
    5.3 紫花苜蓿抗寒分子调控网络调控机制第63-65页
结论第65-66页
参考文献第66-78页
附录第78-98页
攻读硕士期间发表的学术论文第98-100页
致谢第100页

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