| 摘要 | 第6-8页 |
| ABSTRACT | 第8-10页 |
| 第一章 文献综述 | 第15-32页 |
| 1.1 奶牛乳脂的合成 | 第16-19页 |
| 1.1.1 脂肪酸的命名及分类 | 第16-18页 |
| 1.1.2 牛奶中乳脂的合成 | 第18-19页 |
| 1.2 乳脂合成的调控 | 第19-24页 |
| 1.2.1 遗传因素 | 第19-20页 |
| 1.2.2 生理因素 | 第20页 |
| 1.2.3 营养因素 | 第20-21页 |
| 1.2.4 乳脂降低综合症 | 第21-24页 |
| 1.3 乳腺MIRNA表达特征 | 第24-26页 |
| 1.3.1 miRNA在乳腺表达的物种及组织特异性 | 第24-25页 |
| 1.3.2 miRNA在乳腺表达的时空特异性 | 第25页 |
| 1.3.3 miRNA在泌乳中的调节作用 | 第25页 |
| 1.3.4 乳腺miRNA表达的营养调控 | 第25-26页 |
| 1.4 乳汁中MIRNA的表达特征 | 第26-27页 |
| 1.4.1 乳汁中miRNA的存在形式 | 第26页 |
| 1.4.2 乳汁中miRNA的表达情况 | 第26-27页 |
| 1.4.3 乳汁中miRNA的作用 | 第27页 |
| 1.5 长链非编码RNA的生物学功能 | 第27-28页 |
| 1.5.1 lncRNA的概念 | 第27页 |
| 1.5.2 lncRNA的功能 | 第27-28页 |
| 1.5.3 lncRNA的分类 | 第28页 |
| 1.5.4 牛lncRNA的研究进展 | 第28页 |
| 1.6 高通量转录组学测序技术 | 第28-31页 |
| 1.6.1 转录组与转录组学 | 第28-29页 |
| 1.6.2 主要的高通量测序平台 | 第29页 |
| 1.6.3 转录组测序分析的常用软件 | 第29-30页 |
| 1.6.4 转录组测序miRNA的预测工具 | 第30页 |
| 1.6.5 长链非编码RNA的预测工具 | 第30-31页 |
| 1.7 本研究的目的和意义 | 第31-32页 |
| 第二章 日粮中添加 5%亚麻籽油或 5%红花油对奶牛乳脂合成的影响 | 第32-45页 |
| 2.1 前言 | 第32页 |
| 2.2 材料与方法 | 第32-36页 |
| 2.2.1 试验动物 | 第32-33页 |
| 2.2.2 试验设计 | 第33页 |
| 2.2.3 试验日粮 | 第33-34页 |
| 2.2.4 样品采集 | 第34页 |
| 2.2.5 乳脂率测定 | 第34页 |
| 2.2.6 乳脂分离和脂肪酸甲酯的制备 | 第34-35页 |
| 2.2.7 气相色谱检测条件 | 第35页 |
| 2.2.8 数据分析 | 第35-36页 |
| 2.3 结果与分析 | 第36-42页 |
| 2.3.1 日粮中添加的亚麻籽油和红花油脂肪酸成分测定 | 第36-37页 |
| 2.3.2 牛奶日产量的变化 | 第37-38页 |
| 2.3.3 乳脂率的变化 | 第38页 |
| 2.3.4 乳脂肪酸含量的变化 | 第38-42页 |
| 2.4 讨论 | 第42-44页 |
| 2.4.1 添加 5%亚麻籽油或 5%红花油对牛奶日产量的影响 | 第42页 |
| 2.4.2 添加 5%亚麻籽油或 5%红花油对乳脂率的影响 | 第42-43页 |
| 2.4.3 添加 5%亚麻籽油或 5%红花油对乳脂成分的影响 | 第43页 |
| 2.4.4 提高乳脂中不饱和脂肪酸的生物学意义 | 第43-44页 |
| 2.5 结论 | 第44-45页 |
| 第三章 日粮添加 5%亚麻籽油或 5%红花油对乳腺MIRNA表达谱的影响 | 第45-76页 |
| 3.1 材料与方法 | 第45-51页 |
| 3.1.1 试验动物 | 第45页 |
| 3.1.2 试验设计 | 第45-46页 |
| 3.1.3 试验日粮 | 第46页 |
| 3.1.4 乳腺采集 | 第46页 |
| 3.1.5 总RNA的提取 | 第46页 |
| 3.1.6 小RNA测序文库的制备 | 第46-49页 |
| 3.1.7 小RNA测序的生物信息学分析 | 第49-50页 |
| 3.1.8 miRNA 表达的 qPCR 验证 | 第50-51页 |
| 3.2 结果与分析 | 第51-73页 |
| 3.2.1 总RNA提取质量 | 第51-52页 |
| 3.2.2 构建的小RNA测序文库质量检测 | 第52-53页 |
| 3.2.3 小RNA测序数据的质量检测 | 第53-54页 |
| 3.2.4 小RNA测序数据预处理 | 第54-56页 |
| 3.2.5 基因组回帖及ncRNA过滤信息 | 第56-58页 |
| 3.2.6 已知miRNA的鉴定 | 第58-60页 |
| 3.2.7 新miRNA的鉴定 | 第60-62页 |
| 3.2.8 5%亚麻籽油或 5%红花油对奶牛乳腺mi RNA表达谱的影响 | 第62-65页 |
| 3.2.9 miRNA靶基因预测及靶基因功能预测 | 第65-67页 |
| 3.2.10 核心差异表达miRNA在乳脂合成中的功能预测 | 第67-72页 |
| 3.2.11 差异表达miRNA的qPCR验证 | 第72-73页 |
| 3.3 讨论 | 第73-75页 |
| 3.3.1 乳腺miRNA表达谱 | 第73-74页 |
| 3.3.2 核心差异表达miRNA对乳脂生成的调控作用 | 第74-75页 |
| 3.3.3 日粮中添加亚麻籽油和红花油对乳腺miRNA表达影响的差异 | 第75页 |
| 3.4 小结 | 第75-76页 |
| 第四章 日粮中添加 5%亚麻籽油或 5%红花油对乳腺LNCRNA表达的影响 | 第76-97页 |
| 4.1 前言 | 第76-77页 |
| 4.2 材料与方法 | 第77-79页 |
| 4.2.1 试验动物 | 第77页 |
| 4.2.2 试验设计 | 第77页 |
| 4.2.3 试验日粮 | 第77页 |
| 4.2.4 乳腺组织采集 | 第77页 |
| 4.2.5 总RNA的提取 | 第77页 |
| 4.2.6 RNA测序文库的制备 | 第77页 |
| 4.2.7 构建lncRNA鉴定的的生物信息学分析流程 | 第77-79页 |
| 4.3 结果与分析 | 第79-95页 |
| 4.3.1 总RNA质量检测 | 第79-81页 |
| 4.3.2 测序文库构建和质量检测 | 第81-83页 |
| 4.3.3 基因组比对统计信息 | 第83-84页 |
| 4.3.4 乳腺组织lncRNA的生物信息学鉴定 | 第84-86页 |
| 4.3.5 乳腺高表达lncRNA | 第86-87页 |
| 4.3.6 乳腺组织lncRNA的特征 | 第87-89页 |
| 4.3.7 乳腺组织lncRNA的分类 | 第89-91页 |
| 4.3.8 lncRNA差异表达分析 | 第91-95页 |
| 4.4 讨论 | 第95-96页 |
| 4.4.1 lncRNA的鉴定流程 | 第95-96页 |
| 4.4.2 奶牛乳腺lncRNA的表达特征 | 第96页 |
| 4.4.3 日粮添加亚麻籽油和红花油对乳腺lncRNA表达谱的影响 | 第96页 |
| 4.5 小结 | 第96-97页 |
| 第五章 牛奶中MIRNA的转录组分析 | 第97-118页 |
| 5.1 材料与方法 | 第97-100页 |
| 5.1.1 试验动物 | 第97-98页 |
| 5.1.2 试验设计 | 第98页 |
| 5.1.3 样品采集 | 第98页 |
| 5.1.4 牛奶各组分总RNA的提取 | 第98-99页 |
| 5.1.5 小RNA测序文库的构建 | 第99页 |
| 5.1.6 生物信息学分析 | 第99页 |
| 5.1.7 miRNA表达的qPCR验证 | 第99-100页 |
| 5.2 结果与分析 | 第100-114页 |
| 5.2.1 牛奶三组分总RNA提取质量 | 第100-102页 |
| 5.2.2 牛奶三组分miRNA表达谱 | 第102-103页 |
| 5.2.3 牛奶三组分miRNA表达谱相似性 | 第103-105页 |
| 5.2.4 牛奶三组分miRNA表达谱与乳腺mi RNA表达谱相似性 | 第105-106页 |
| 5.2.5 牛奶和乳腺均高表达的miRNA功能预测 | 第106-110页 |
| 5.2.6 牛奶三种组分和乳腺分别富集的miRNA | 第110-113页 |
| 5.2.7 牛奶miRNA的qPCR验证 | 第113-114页 |
| 5.3 讨论 | 第114-117页 |
| 5.3.1 牛奶miRNA表达谱的特点 | 第114-115页 |
| 5.3.2 牛奶三种组分与乳腺miRNA表达谱的异同点 | 第115-116页 |
| 5.3.3 牛奶与乳腺高表达miRNA的生物学功能 | 第116-117页 |
| 5.4 小结 | 第117-118页 |
| 结论与创新点 | 第118-119页 |
| 参考文献 | 第119-131页 |
| 附录 | 第131-163页 |
| 致谢 | 第163-164页 |
| 作者简介 | 第164-165页 |
