| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 主要缩略词表 | 第10-11页 |
| 第1章 前言 | 第11-21页 |
| 1.1 蚱总科昆虫研究现状 | 第11-12页 |
| 1.1.1 蚱总科昆虫简介 | 第11页 |
| 1.1.2 蚱总科昆虫分类与系统学 | 第11-12页 |
| 1.2 昆虫线粒体基因组及其分子系统学应用 | 第12-15页 |
| 1.2.1 昆虫线粒体基因组 | 第13页 |
| 1.2.2 昆虫线粒体基因组组分及应用 | 第13-15页 |
| 1.3 昆虫核基因的分子系统学应用 | 第15页 |
| 1.4 线粒体基因组研究方法 | 第15-17页 |
| 1.4.1 高通量测序技术 | 第16页 |
| 1.4.2 线粒体基因组的拼接和注释 | 第16-17页 |
| 1.5 线粒体基因组数据的比较基因组学分析 | 第17-18页 |
| 1.6 线粒体基因组系统发育分析 | 第18-19页 |
| 1.6.1 数据集的划分 | 第18页 |
| 1.6.2 数据集特征及系统发生分析 | 第18-19页 |
| 1.7 研究物种简介 | 第19-20页 |
| 1.7.1 元宝山波蚱 | 第19页 |
| 1.7.2 尖翅狭顶蚱 | 第19页 |
| 1.7.3 锡金波蚱 | 第19-20页 |
| 1.8 本研究拟解决的问题 | 第20-21页 |
| 第2章 实验材料与方法 | 第21-33页 |
| 2.1 物种取样 | 第21页 |
| 2.2 实验材料 | 第21-23页 |
| 2.2.1 主要仪器与试剂 | 第21-23页 |
| 2.2.2 计算机和生物信息学软件 | 第23页 |
| 2.3 线粒体总DNA测序技术流程 | 第23-26页 |
| 2.3.1 总DNA提取及质量检测 | 第23-24页 |
| 2.3.2 L-PCR和sub-PCR引物的选择,产物检测,回收及纯化 | 第24-25页 |
| 2.3.3 T-载体克隆测序 | 第25-26页 |
| 2.4 二代测序技术流程 | 第26页 |
| 2.5 核基因组28S rRNA测序流程 | 第26-27页 |
| 2.6 序列的拼接和注释 | 第27-28页 |
| 2.6.1 线粒体基因组组装 | 第27页 |
| 2.6.2 线粒体基因组注释 | 第27-28页 |
| 2.7 比较基因组学分析和系统发生分析 | 第28-33页 |
| 2.7.1 数据来源 | 第28-30页 |
| 2.7.2 结构特征分析 | 第30页 |
| 2.7.3 系统发育树重建 | 第30-33页 |
| 第3章 三种蚱总科昆虫线粒体基因组 | 第33-51页 |
| 3.1 总DNA提取结果及序列拼接结果 | 第33页 |
| 3.2 基本组成特征 | 第33-38页 |
| 3.3 碱基组成及偏向性分析 | 第38-40页 |
| 3.4 氨基酸组成及密码子使用情况 | 第40-45页 |
| 3.5 tRNA二级结构及替换类型 | 第45-48页 |
| 3.6 rRNA二级结构及物种差异分析 | 第48-49页 |
| 3.7 控制区及重复序列 | 第49-51页 |
| 第4章 蝗亚目昆虫线粒体比较基因组学分析 | 第51-63页 |
| 4.1 蝗亚目全基因组各区域序列长度变化 | 第51-54页 |
| 4.2 蝗亚目线粒体基因组第三位点AT%和AT偏向性分析 | 第54-56页 |
| 4.3 蝗亚目蛋白编码基因相关分析 | 第56-58页 |
| 4.3.1 碱基组成分析 | 第56-58页 |
| 4.3.2 氨基酸组成分析 | 第58页 |
| 4.4 蝗亚目基因重叠区和间隔区比较分析 | 第58-59页 |
| 4.5 蝗亚目蚱总科tRNA保守序列比较 | 第59-63页 |
| 第5章 蝗亚目系统发育树的构建 | 第63-69页 |
| 5.1 数据集准备 | 第63页 |
| 5.2 基因间遗传距离及碱基替换饱和性分析 | 第63-65页 |
| 5.3 建树结果 | 第65-69页 |
| 5.3.1 似然法重建蝗亚目系统发育树 | 第65-66页 |
| 5.3.2 贝叶斯法构建蝗亚目系统发育树 | 第66-67页 |
| 5.3.3 蚱总科昆虫系统发育分析 | 第67-69页 |
| 第6章 总结 | 第69-73页 |
| 6.1 三种蚱总科昆虫线粒体基因组特征 | 第69页 |
| 6.2 蝗亚目比较基因组学分析 | 第69-71页 |
| 6.2.1 蝗亚目昆虫共性 | 第70页 |
| 6.2.2 蚱总科昆虫特性 | 第70-71页 |
| 6.2.3 三种蚱总科昆虫tRNA和rRNA结构比较 | 第71页 |
| 6.3 蝗亚目和蚱总科昆虫系统发育树的重建 | 第71-73页 |
| 参考文献 | 第73-85页 |
| 致谢 | 第85-87页 |
| 攻读硕士学位期间的研究成果 | 第87页 |
