| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 一、综述 | 第11-18页 |
| 1.1 水稻在我国的重要性及转基因水稻的作用 | 第11-12页 |
| 1.2 转基因作物对根际微生态的影响 | 第12-13页 |
| 1.3 微生物群落结构研究方法 | 第13-18页 |
| 1.3.1 变性梯度凝胶电泳(DGGE) | 第13-15页 |
| 1.3.2 末端限制性片段长度多态性(T-RFLP) | 第15-16页 |
| 1.3.4 扩增rDNA限制酶分析(ARDRA) | 第16-17页 |
| 1.3.5 第二代测序(NGS) | 第17-18页 |
| 1.4 研究目的、意义及研究方案 | 第18页 |
| 二、材料与方法 | 第18-30页 |
| 2.1 试验材料 | 第18-20页 |
| 2.1.1 水稻试验品种与种植地点 | 第18-19页 |
| 2.1.2 试验试剂 | 第19页 |
| 2.1.3 仪器设备 | 第19-20页 |
| 2.2 试验方法 | 第20-30页 |
| 2.2.1 水稻DNA提取 | 第20-21页 |
| 2.2.2 无选择标记Cry30Fa1基因PCR检测 | 第21-22页 |
| 2.2.3 根际土壤总DNA提取 | 第22-26页 |
| 2.2.4 16S rDNA扩增 | 第26-27页 |
| 2.2.5 焦磷酸测序分析 | 第27-30页 |
| 三、结果与分析 | 第30-47页 |
| 3.0 无选择标记转Cry30Fa1基因水稻的PCR检测 | 第30-31页 |
| 3.1 根际土壤总DNA的提取 | 第31页 |
| 3.2 根际土壤总DNA的16S rDNA PCR检测 | 第31-32页 |
| 3.3 焦磷酸测序 | 第32-36页 |
| 3.3.1 测序数据统计 | 第32-33页 |
| 3.3.2 raw data质量分析 | 第33页 |
| 3.3.3 raw data质量控制 | 第33-34页 |
| 3.3.4 raw data的GC含量分析 | 第34-35页 |
| 3.3.5 不同品种水稻根际微生物的OTU数据 | 第35-36页 |
| 3.4 不同水稻品种根际微生物的OTU分布 | 第36-38页 |
| 3.5 样本微生物群落α多样性及采样平台期曲线绘制 | 第38-40页 |
| 3.5.1 样品The observed species指数及稀释度曲线 | 第38页 |
| 3.5.2 样品ChaoI指数及稀释度曲线多样性指数 | 第38-39页 |
| 3.5.3 样品Shannon指数及稀释度曲线 | 第39-40页 |
| 3.6 样品OTU分布及微生物群落物种组成 | 第40-45页 |
| 3.6.1 门分类水平下各样品OTU分布及微生物群落物种组成 | 第40页 |
| 3.6.2 纲分类水平下各样品OTU分布及微生物群落物种组成 | 第40页 |
| 3.6.3 口分类水平下各样品OTU分布及微生物群落物种组成 | 第40-45页 |
| 3.7 样本间微生物群落B多样性及微生物群落比较 | 第45-47页 |
| 3.7.1 各水稻品种间PCoA聚类图 | 第45-46页 |
| 3.7.2 各水稻品种微生物群落距离 | 第46-47页 |
| 四、讨论 | 第47-48页 |
| 参考文献 | 第48-57页 |
| 致谢 | 第57页 |
