| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-9页 |
| 缩略词表 | 第10-11页 |
| 1.前言 | 第11-20页 |
| 1.1 花青苷概述 | 第12-16页 |
| 1.1.1 花青苷的组成和分布 | 第12-13页 |
| 1.1.2 花青苷的生物合成及调控 | 第13-16页 |
| 1.2 图位克隆技术在基因定位中的应用 | 第16-18页 |
| 1.2.1 群体分离分析法（Bulked segregant analysis, BSA） | 第17页 |
| 1.2.2 分子标记技术 | 第17-18页 |
| 1.2.3 RNA-seq高通量测序技术在基因定位中的应用 | 第18页 |
| 1.3 紫色基因在芸薹属作物中的研究进展 | 第18-19页 |
| 1.4 选题背景与目的意义 | 第19-20页 |
| 2.材料与方法 | 第20-29页 |
| 2.1 材料 | 第20页 |
| 2.1.1 植物材料 | 第20页 |
| 2.1.2 菌种及载体 | 第20页 |
| 2.1.3 主要生化试剂 | 第20页 |
| 2.2 方法 | 第20-29页 |
| 2.2.1 植物学性状观察与花青苷的组织定位 | 第20-21页 |
| 2.2.2 群体再构建与性状调查 | 第21页 |
| 2.2.3 分子标记方法 | 第21-23页 |
| 2.2.4 BSA-RNA-seq测序分析 | 第23-26页 |
| 2.2.5 候选基因鉴定 | 第26页 |
| 2.2.6 候选基因gDNA及CDS全长克隆及测序 | 第26-28页 |
| 2.2.7 qRT-PCR表达量分析 | 第28-29页 |
| 3.结果与分析 | 第29-46页 |
| 3.1 性状观察和花青素组织定位 | 第29-30页 |
| 3.1.1 亲本材料植物学性状表现 | 第29-30页 |
| 3.1.2 紫叶芥花青苷的组织定位 | 第30页 |
| 3.2 分离群体叶色性状调查与遗传模式分析 | 第30-32页 |
| 3.3 与叶色基因连锁的标记筛选 | 第32-34页 |
| 3.3.1 SSR及InDel标记筛选 | 第32页 |
| 3.3.2 CAPS标记筛选及白菜花青素合成转录因子验证 | 第32-34页 |
| 3.4 极端池RNA-seq测序结果分析 | 第34-40页 |
| 3.4.1 参考白菜基因组分析结果 | 第34-35页 |
| 3.4.2 转录组数据质量评估 | 第35-36页 |
| 3.4.3 基因表达量分析 | 第36页 |
| 3.4.4 差异表达基因筛选与功能注释 | 第36-38页 |
| 3.4.5 关联分析 | 第38-40页 |
| 3.4.6 芥菜中与拟南芥花青素合成相关基因的同源基因筛选 | 第40页 |
| 3.5 鉴定候选基因 | 第40-42页 |
| 3.5.1 Bj.Pur基因初定位 | 第40页 |
| 3.5.2 候选区域内基因的筛选 | 第40-42页 |
| 3.6 Gglean060401基因gDNA及CDS全长克隆及比较测序 | 第42-44页 |
| 3.6.1 RNA质量检测 | 第42-43页 |
| 3.6.2 cDNA的合成 | 第43页 |
| 3.6.3 候选基因的克隆与测序分析 | 第43-44页 |
| 3.7 Gglean060401基因表达量分析 | 第44-45页 |
| 3.8 Bj-MYB90标记F_2群体验证 | 第45-46页 |
| 4.讨论与结论 | 第46-49页 |
| 4.1 拟南芥及白菜基因组信息在芥菜基因定位中的作用 | 第46-47页 |
| 4.2 芥菜紫叶基因定位及候选基因筛选与鉴定 | 第47-48页 |
| 4.2.1 芥菜紫叶基因定位 | 第47页 |
| 4.2.2 确定Gglean060401基因为候选基因 | 第47-48页 |
| 4.3 后续工作计划 | 第48-49页 |
| 参考文献 | 第49-58页 |
| 附录 1：CTAB小量法提取总DNA | 第58页 |
| 附录 2：与Pj.Pur基因紧密连锁的4个标记序列信息 | 第58-59页 |
| 附录 3：目的片段克隆 | 第59-60页 |
| 附录 4: Gglean060401基因及插入片段A的碱基序列信息 | 第60-61页 |
| 致谢 | 第61页 |
