| 中文摘要 | 第7-9页 |
| ABSTRACT | 第9-10页 |
| 缩略词表 | 第11-12页 |
| 1 前言 | 第12-32页 |
| 1.1 代谢组学研究的概述 | 第12-18页 |
| 1.1.1 代谢组学的概念 | 第12-13页 |
| 1.1.2 代谢组学研究的技术手段 | 第13-16页 |
| 1.1.3 植物代谢组学 | 第16-18页 |
| 1.2 代谢物的检测和鉴定 | 第18-22页 |
| 1.2.1 代谢物的检测 | 第19-20页 |
| 1.2.2 代谢物的鉴定 | 第20-22页 |
| 1.3 代谢谱及代谢组的遗传连锁分析 | 第22-25页 |
| 1.3.1 代谢谱研究 | 第22-23页 |
| 1.3.2 代谢组的遗传连锁分析 | 第23-25页 |
| 1.4 代谢组的自然变异和全基因组关联分析 | 第25-30页 |
| 1.4.1 代谢组的自然变异 | 第26-27页 |
| 1.4.2 代谢组的全基因组关联分析 | 第27-30页 |
| 1.5 代谢组学与功能基因组学研究 | 第30-31页 |
| 1.6 本研究的目的和意义 | 第31-32页 |
| 2 材料与方法 | 第32-39页 |
| 2.1 水稻材料来源和取样 | 第32-33页 |
| 2.1.1 水稻材料来源 | 第32页 |
| 2.1.2 旱胁迫处理和取样 | 第32页 |
| 2.1.3 不同组织样品取样 | 第32-33页 |
| 2.2 化学试剂 | 第33页 |
| 2.3 样品准备与提取 | 第33-34页 |
| 2.4 仪器条件和参数 | 第34-35页 |
| 2.4.1 HPLC条件和参数 | 第34页 |
| 2.4.2 ESI-QTRAP-MS/MS条件和参数 | 第34页 |
| 2.4.3 离子阱条件和参数 | 第34-35页 |
| 2.4.4 三重四极杆条件和参数 | 第35页 |
| 2.4.5 ESI-QTOF-MS/MS条件和参数 | 第35页 |
| 2.5 统计分析 | 第35-36页 |
| 2.6 mQTL定位 | 第36页 |
| 2.7 双位点互作分析 | 第36页 |
| 2.8 全基因组关联分析 | 第36-37页 |
| 2.9 mQTL和m GWAS热点分析 | 第37页 |
| 2.10载体构建与转化 | 第37页 |
| 2.11体外表达及体外反应实验 | 第37-38页 |
| 2.12基因表达量分析 | 第38-39页 |
| 3 结果与分析 | 第39-86页 |
| 3.1 水稻代谢组学研究方法的建立 | 第39-48页 |
| 3.1.1 MS2T数据库的构建 | 第39-42页 |
| 3.1.2 代谢物的鉴定和注释 | 第42-47页 |
| 3.1.3 高通量定量代谢物 | 第47-48页 |
| 3.2 水稻代谢谱研究 | 第48-57页 |
| 3.2.1 旱胁迫下水稻叶片代谢谱的研究 | 第49-52页 |
| 3.2.2 水稻不同组织代谢谱的研究 | 第52-55页 |
| 3.2.3 水稻核心种质代谢谱的研究 | 第55-57页 |
| 3.3 水稻代谢相关基因的定位及功能验证 | 第57-70页 |
| 3.3.1 定位m QTL并利用导入系进行m QTL验证 | 第57-60页 |
| 3.3.2 利用m QTL确定代谢相关基因并进行功能验证 | 第60-62页 |
| 3.3.3 利用m GWAS定位水稻代谢相关基因 | 第62-67页 |
| 3.3.4 对m GWAS定位的代谢相关基因进行功能验证 | 第67-70页 |
| 3.4 利用代谢组学解析功能基因组学 | 第70-86页 |
| 3.4.1 利用代谢组学找到具有生物学意义的标志物质 | 第70-75页 |
| 3.4.2 利用m GWAS的结果注释未知代谢物 | 第75-79页 |
| 3.4.3 利用代谢组学解析新的遗传机理 | 第79-81页 |
| 3.4.4 利用代谢组学解析新的代谢途径 | 第81-86页 |
| 4 讨论 | 第86-95页 |
| 4.1 发展和建立一种更系统的代谢组学研究方法 | 第86-88页 |
| 4.2 生物信息学对代谢组学研究至关重要 | 第88-91页 |
| 4.2.1 代谢谱数据库的建立及共享 | 第89-90页 |
| 4.2.2 利用生物信息学快速鉴定代谢物 | 第90-91页 |
| 4.3 进一步利用代谢组解析功能基因组 | 第91-95页 |
| 4.3.1 找到更多具有生理功能的代谢产物 | 第91-92页 |
| 4.3.2 将代谢组学结合多组学应用于作物育种 | 第92-94页 |
| 4.3.3 代谢组学与代谢工程 | 第94-95页 |
| 5 参考文献 | 第95-116页 |
| 附录 | 第116-121页 |
| 附录Ⅰ：部分实验的详细操作程序 | 第116-117页 |
| 附录Ⅱ：本研究所用的引物列表 | 第117-119页 |
| 附录Ⅲ：作者简介 | 第119-121页 |
| 个人简历 | 第119页 |
| 在读期间发表论文 | 第119-120页 |
| 申请专利 | 第120-121页 |
| 致谢 | 第121-123页 |
