基于内存计算的基因型—表型关联技术研究
| 摘要 | 第4-5页 |
| ABSTRACT | 第5页 |
| 第1章 绪论 | 第8-13页 |
| 1.1 课题研究背景及意义 | 第8-9页 |
| 1.2 国内外研究现状 | 第9-12页 |
| 1.3 主要研究内容及组织结构 | 第12-13页 |
| 第2章 疾病-基因关联算法概述 | 第13-25页 |
| 2.1 疾病-基因关联算法定义 | 第13-18页 |
| 2.1.1 相关生物网络 | 第13-17页 |
| 2.1.2 疾病-基因关联过程 | 第17-18页 |
| 2.2 现有预测方法 | 第18-24页 |
| 2.2.1 基于统计调整算法 | 第18-19页 |
| 2.2.2 基于网络传播算法 | 第19-21页 |
| 2.2.3 基于本体的疾病-基因关联算法 | 第21-24页 |
| 2.3 本章小结 | 第24-25页 |
| 第3章 疾病-基因预测算法 | 第25-33页 |
| 3.1 构建异构网络 | 第25-27页 |
| 3.2 重启的随机游走算法 | 第27-28页 |
| 3.3 改进Trust Rank算法 | 第28-32页 |
| 3.3.1 Page Rank算法 | 第28-29页 |
| 3.3.2 Trust Rank算法 | 第29-31页 |
| 3.3.3 YSearch算法 | 第31-32页 |
| 3.4 本章总结 | 第32-33页 |
| 第4章 实验与结果分析 | 第33-40页 |
| 4.1 实验数据 | 第33-35页 |
| 4.2 实验验证 | 第35-38页 |
| 4.2.1 交叉验证 | 第35-37页 |
| 4.2.2 参数估计 | 第37-38页 |
| 4.3 实验结果分析 | 第38-39页 |
| 4.4 本章总结 | 第39-40页 |
| 第5章 YSearch系统实现 | 第40-48页 |
| 5.1 相关技术介绍 | 第40-42页 |
| 5.1.1 Spark介绍 | 第40-41页 |
| 5.1.2 HBase介绍 | 第41-42页 |
| 5.2 系统介绍 | 第42-47页 |
| 5.3 本章小结 | 第47-48页 |
| 结论 | 第48-50页 |
| 参考文献 | 第50-55页 |
| 攻读硕士学位期间发表的论文及其它成果 | 第55-57页 |
| 致谢 | 第57页 |