| 摘要 | 第4-7页 |
| ABSTRACT | 第7-10页 |
| 引言 | 第14-15页 |
| 第一章 综述 | 第15-21页 |
| 第一节 转录组学相关研究 | 第15-16页 |
| 1.转录组学研究现状 | 第15页 |
| 2.鱼类的转录组学研究 | 第15-16页 |
| 第二节 耐寒基因相关研究进展 | 第16-19页 |
| 1.鱼类低温胁迫的相关研究进展 | 第16-17页 |
| 2.低温胁迫对鱼类生长的影响 | 第17-18页 |
| 3.耐寒基因相关研究进展 | 第18-19页 |
| 第三节 系谱认证相关研究进展 | 第19-21页 |
| 1.选择育种和杂交育种相关研究进展 | 第19页 |
| 2.分子标记辅助育种相关研究进展 | 第19-20页 |
| 3.系谱认证在人工选育中的作用 | 第20-21页 |
| 第二章 基于红鳍东方鲀(Takifugu rubripes)低温转录组的调控机制的研究 | 第21-33页 |
| 1.前言 | 第21页 |
| 2.实验材料和方法 | 第21-23页 |
| 2.1 实验材料 | 第21-22页 |
| 2.2 实验方法 | 第22-23页 |
| 3.数据处理 | 第23-25页 |
| 3.1 数据预处理以及质量控制 | 第24页 |
| 3.2 基因定量、差异基因筛选、功能富集及聚类分析 | 第24页 |
| 3.3 基因结构优化及新转录本预测 | 第24页 |
| 3.4 可变剪切分析以及SNP、INDEL分析 | 第24-25页 |
| 4 结果 | 第25-31页 |
| 4.1 基因表达水平分析 | 第25-28页 |
| 4.2 差异表达基因分析 | 第28-31页 |
| 5 讨论 | 第31-33页 |
| 第三章 红鳍东方鲀(Takifugu rubripes)AFP、CIRP、Y-box和HMGB1基因的表达分析 | 第33-42页 |
| 1.前言 | 第33-34页 |
| 2.实验材料和方法 | 第34-35页 |
| 2.1 实验材料 | 第34页 |
| 2.2 总RNA的提取及CDNA文库的构建 | 第34页 |
| 2.3 实时荧光定量表达 | 第34-35页 |
| 3.数据处理 | 第35页 |
| 4.结果 | 第35-38页 |
| 4.1 低温胁迫情况下AFP基因在红鳍东方鲀各组织中的表达 | 第35-36页 |
| 4.2 低温胁迫情况下CIRP基因在红鳍东方鲀各组织中的表达 | 第36-37页 |
| 4.3 低温胁迫情况下HMGB1基因在红鳍东方鲀各组织中的表达 | 第37页 |
| 4.4 低温胁迫情况下Y-BOX基因在红鳍东方鲀各组织中的表达 | 第37-38页 |
| 5.讨论 | 第38-41页 |
| 5.1 低温胁迫下红鳍东方鲀各组织中AFP基因表达的情况 | 第38-39页 |
| 5.2 低温胁迫下红鳍东方鲀各组织中CIRP基因表达的情况 | 第39页 |
| 5.3 低温胁迫下红鳍东方鲀各组织中HMGB1基因表达的情况 | 第39-40页 |
| 5.4 低温胁迫下红鳍东方鲀各组织中Y-BOX基因表达的情况 | 第40-41页 |
| 小结 | 第41-42页 |
| 第四章 红鳍东方鲀和暗纹东方鲀的系谱认证 | 第42-60页 |
| 第一节 红鳍东方鲀（Takifugu rubripes）的系谱认证研究 | 第42-52页 |
| 1.前言 | 第42页 |
| 2.材料与方法 | 第42-45页 |
| 2.1 样品选取 | 第42-43页 |
| 2.2 引物与试剂 | 第43-44页 |
| 2.3 基因组DNA的提取 | 第44-45页 |
| 2.4 PCR反应及电泳 | 第45页 |
| 2.5 数据分析 | 第45页 |
| 3.结果 | 第45-50页 |
| 3.1 遗传多样性分析 | 第45-47页 |
| 3.2 家系特异性鉴别 | 第47-48页 |
| 3.3 推断缺失亲本基因型 | 第48-50页 |
| 4.讨论 | 第50-52页 |
| 第二节 暗纹东方鲀(Takifugu obscurus)的系谱认证研究 | 第52-59页 |
| 1.前言 | 第52页 |
| 2.材料和方法 | 第52-53页 |
| 2.1 样品选取 | 第52页 |
| 2.2 引物与试剂 | 第52页 |
| 2.3 基因组DNA的提取 | 第52页 |
| 2.4 PCR反应及电泳 | 第52-53页 |
| 2.5 数据分析 | 第53页 |
| 3.结果 | 第53-57页 |
| 3.1 遗传多样性分析 | 第53-54页 |
| 3.2 家系鉴别 | 第54-55页 |
| 3.3 推断缺失亲本基因型 | 第55-57页 |
| 4.讨论 | 第57-59页 |
| 小结 | 第59-60页 |
| 参考文献 | 第60-69页 |
| 硕士期间科研产出情况 | 第69-70页 |
| 致谢 | 第70页 |
