摘要 | 第3-4页 |
Abstract | 第4-5页 |
术语及符号说明 | 第6-10页 |
第1章 前言 | 第10-14页 |
1.1 遗传多样性概念 | 第10页 |
1.2 环境因子对遗传多样性的影响 | 第10页 |
1.3 分子生态学主要研究内容 | 第10-11页 |
1.4 微卫星的研究进展 | 第11-12页 |
1.5 线粒体DNA D-loop区的研究进展 | 第12页 |
1.6 形态表型差异及其影响因素 | 第12-13页 |
1.7 本研究的研究意义 | 第13-14页 |
第2章 材料与方法 | 第14-23页 |
2.1 实验动物概况 | 第14-15页 |
2.2 动物处理 | 第15页 |
2.3 基因组DNA的提取 | 第15页 |
2.4 微卫星引物选取 | 第15-16页 |
2.5 微卫星荧光检测 | 第16-20页 |
2.5.1 样品检测及分装 | 第16页 |
2.5.2 PCR预实验 | 第16-17页 |
2.5.3 微卫星荧光PCR | 第17-20页 |
2.6 D-loop基因的扩增 | 第20-21页 |
2.6.1 引物设计 | 第20页 |
2.6.2 序列扩增 | 第20-21页 |
2.6.3 序列数据分析 | 第21页 |
2.7 头骨形态获取 | 第21-23页 |
2.7.1 头骨样本制备 | 第21页 |
2.7.2 图像信息采集 | 第21页 |
2.7.3 标志点的选择 | 第21-22页 |
2.7.4 形态信息数字化 | 第22页 |
2.7.5 去除非形态的变异 | 第22-23页 |
第3章 云南中缅树鼩微卫星遗传多样性及进化研究 | 第23-36页 |
3.1 微卫星结果 | 第23-32页 |
3.1.1 中缅树鼩等位基因数目 | 第23页 |
3.1.2 哈代-温伯格平衡检验 | 第23-24页 |
3.1.3 有效等位基因数 | 第24-25页 |
3.1.4 群体杂合度、多态信息含量 | 第25-26页 |
3.1.5 种群间的F-统计检验与基因流 | 第26-28页 |
3.1.6 遗传距离 | 第28页 |
3.1.7 聚类分析 | 第28-31页 |
3.1.8 瓶颈效应检测 | 第31-32页 |
3.2 讨论 | 第32-36页 |
3.2.1 引物的选择及标记 | 第32-33页 |
3.2.2 种群内遗传变异 | 第33页 |
3.2.3 种群间的遗传变异 | 第33-34页 |
3.2.4 中缅树鼩在云南的扩散 | 第34-35页 |
3.2.5 中缅树鼩的保种理论 | 第35-36页 |
第4章 云南中缅树鼩线粒体基因遗传多样性及系统进化 | 第36-50页 |
4.1 线粒体基因结果 | 第36-48页 |
4.1.1 碱基组成 | 第36页 |
4.1.2 序列变异 | 第36页 |
4.1.3 单倍型分析及系统发育 | 第36-37页 |
4.1.4 8 个中缅树鼩地理种群D-loop基因序列核苷酸多样性 | 第37-43页 |
4.1.5 中缅树鼩8个地理种群遗传距离 | 第43页 |
4.1.6 中缅树鼩8个地理种群间的核苷酸多态性 | 第43-44页 |
4.1.7 分子方差分析 | 第44-45页 |
4.1.8 序列中性检验、Mismatch分析及群体扩张 | 第45-48页 |
4.2 讨论 | 第48-50页 |
4.2.1 中缅树鼩群群体内遗传多样性 | 第48页 |
4.2.2 中缅树鼩群体间的遗传多样性 | 第48-49页 |
4.2.3 地理距离和群体间线粒体DNA遗传距离的关系 | 第49页 |
4.2.4 中缅树鼩在云南的起源 | 第49-50页 |
第5章 云南中缅树鼩头骨形态的初步研究 | 第50-60页 |
5.1 头骨形态特征结果 | 第50-57页 |
5.1.1 头骨上颌背面分析 | 第50-51页 |
5.1.2 头骨上颌侧面分析 | 第51-52页 |
5.1.3 头骨上颌腹面分析 | 第52-54页 |
5.1.4 头骨下颌侧面分析 | 第54-55页 |
5.1.5 多维尺度分析 | 第55-57页 |
5.2 讨论 | 第57-60页 |
第6章 总结 | 第60-61页 |
第7章 文献综述 | 第61-73页 |
7.1 树鼩的传统分类地位 | 第61页 |
7.2 基于分子证据界定树鼩的分类地位 | 第61-67页 |
7.3 树鼩的系统分类地位 | 第67-68页 |
7.4 树鼩的表型多样性 | 第68-70页 |
7.5 云南省地形地貌及生物多样性 | 第70-71页 |
7.6 DNA水平上的分子标记原理及方法 | 第71-73页 |
参考文献 | 第73-81页 |
攻读学位期间发表的学术论文和研究成果 | 第81-82页 |
致谢 | 第82-83页 |