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云南中缅树鼩(Tupaia belangeri)种群分化的初步研究

摘要第3-4页
Abstract第4-5页
术语及符号说明第6-10页
第1章 前言第10-14页
    1.1 遗传多样性概念第10页
    1.2 环境因子对遗传多样性的影响第10页
    1.3 分子生态学主要研究内容第10-11页
    1.4 微卫星的研究进展第11-12页
    1.5 线粒体DNA D-loop区的研究进展第12页
    1.6 形态表型差异及其影响因素第12-13页
    1.7 本研究的研究意义第13-14页
第2章 材料与方法第14-23页
    2.1 实验动物概况第14-15页
    2.2 动物处理第15页
    2.3 基因组DNA的提取第15页
    2.4 微卫星引物选取第15-16页
    2.5 微卫星荧光检测第16-20页
        2.5.1 样品检测及分装第16页
        2.5.2 PCR预实验第16-17页
        2.5.3 微卫星荧光PCR第17-20页
    2.6 D-loop基因的扩增第20-21页
        2.6.1 引物设计第20页
        2.6.2 序列扩增第20-21页
        2.6.3 序列数据分析第21页
    2.7 头骨形态获取第21-23页
        2.7.1 头骨样本制备第21页
        2.7.2 图像信息采集第21页
        2.7.3 标志点的选择第21-22页
        2.7.4 形态信息数字化第22页
        2.7.5 去除非形态的变异第22-23页
第3章 云南中缅树鼩微卫星遗传多样性及进化研究第23-36页
    3.1 微卫星结果第23-32页
        3.1.1 中缅树鼩等位基因数目第23页
        3.1.2 哈代-温伯格平衡检验第23-24页
        3.1.3 有效等位基因数第24-25页
        3.1.4 群体杂合度、多态信息含量第25-26页
        3.1.5 种群间的F-统计检验与基因流第26-28页
        3.1.6 遗传距离第28页
        3.1.7 聚类分析第28-31页
        3.1.8 瓶颈效应检测第31-32页
    3.2 讨论第32-36页
        3.2.1 引物的选择及标记第32-33页
        3.2.2 种群内遗传变异第33页
        3.2.3 种群间的遗传变异第33-34页
        3.2.4 中缅树鼩在云南的扩散第34-35页
        3.2.5 中缅树鼩的保种理论第35-36页
第4章 云南中缅树鼩线粒体基因遗传多样性及系统进化第36-50页
    4.1 线粒体基因结果第36-48页
        4.1.1 碱基组成第36页
        4.1.2 序列变异第36页
        4.1.3 单倍型分析及系统发育第36-37页
        4.1.4 8 个中缅树鼩地理种群D-loop基因序列核苷酸多样性第37-43页
        4.1.5 中缅树鼩8个地理种群遗传距离第43页
        4.1.6 中缅树鼩8个地理种群间的核苷酸多态性第43-44页
        4.1.7 分子方差分析第44-45页
        4.1.8 序列中性检验、Mismatch分析及群体扩张第45-48页
    4.2 讨论第48-50页
        4.2.1 中缅树鼩群群体内遗传多样性第48页
        4.2.2 中缅树鼩群体间的遗传多样性第48-49页
        4.2.3 地理距离和群体间线粒体DNA遗传距离的关系第49页
        4.2.4 中缅树鼩在云南的起源第49-50页
第5章 云南中缅树鼩头骨形态的初步研究第50-60页
    5.1 头骨形态特征结果第50-57页
        5.1.1 头骨上颌背面分析第50-51页
        5.1.2 头骨上颌侧面分析第51-52页
        5.1.3 头骨上颌腹面分析第52-54页
        5.1.4 头骨下颌侧面分析第54-55页
        5.1.5 多维尺度分析第55-57页
    5.2 讨论第57-60页
第6章 总结第60-61页
第7章 文献综述第61-73页
    7.1 树鼩的传统分类地位第61页
    7.2 基于分子证据界定树鼩的分类地位第61-67页
    7.3 树鼩的系统分类地位第67-68页
    7.4 树鼩的表型多样性第68-70页
    7.5 云南省地形地貌及生物多样性第70-71页
    7.6 DNA水平上的分子标记原理及方法第71-73页
参考文献第73-81页
攻读学位期间发表的学术论文和研究成果第81-82页
致谢第82-83页

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