| 摘要 | 第6-8页 |
| ABSTRACT | 第8-9页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-29页 |
| 1.1 APS的生物学活性及其作用机制 | 第12-15页 |
| 1.1.1 APS的生物学活性 | 第12-15页 |
| 1.1.2 APS的生物学调控机制 | 第15页 |
| 1.2 转录组测序 | 第15-24页 |
| 1.2.0 高通量测序的优势 | 第16-17页 |
| 1.2.1 高通量测序流程及质控要点 | 第17-18页 |
| 1.2.2 Reads与参考基因组的比对 | 第18页 |
| 1.2.3 数据归一化和差异基因筛选 | 第18-19页 |
| 1.2.4 GO功能显著性富集分析 | 第19-20页 |
| 1.2.5 KEGG信号通路显著性富集分析 | 第20页 |
| 1.2.6 RNA-seq与基因结构优化 | 第20-21页 |
| 1.2.7 RNA-seq与新转录本预测 | 第21页 |
| 1.2.8 RNA-seq与可变剪接分析 | 第21-22页 |
| 1.2.9 RNA-seq与SNP分析 | 第22-23页 |
| 1.2.10 RNA-seq与基因融合分析 | 第23-24页 |
| 1.3 MHC-I生物学功能 | 第24-27页 |
| 1.3.1 MHC-I功能特性 | 第24-25页 |
| 1.3.2 MHC-I抗原识别呈递机制 | 第25-26页 |
| 1.3.3 MHC-I抗原识别呈递的调控因子 | 第26-27页 |
| 1.4 研究问题的提出及研究内容 | 第27-29页 |
| 1.4.1 研究问题的提出 | 第27页 |
| 1.4.2 研究内容 | 第27-28页 |
| 1.4.3 技术路线 | 第28-29页 |
| 第二章 种公鸡日粮添加APS对父母代、商品代肉鸡生长性能的影响 | 第29-36页 |
| 2.1 材料与方法 | 第29-30页 |
| 2.1.1 试验动物及处理 | 第29-30页 |
| 2.1.2 样品采集和处理 | 第30页 |
| 2.1.3 检测指标及方法 | 第30页 |
| 2.1.4 数据统计分析 | 第30页 |
| 2.2 试验结果与分析 | 第30-33页 |
| 2.2.1 种公鸡饲养前期体重 | 第30-31页 |
| 2.2.2 种公鸡44周龄体重 | 第31-32页 |
| 2.2.3 种公鸡精液品质 | 第32页 |
| 2.2.4 商品代孵化状况 | 第32页 |
| 2.2.5 雏鸡生长曲线 | 第32-33页 |
| 2.3 讨论 | 第33-35页 |
| 2.4 小结 | 第35-36页 |
| 第三章 种公鸡日粮添加APS的父母代及商品代肉鸡传代转录信息分析 | 第36-61页 |
| 3.1 材料与方法 | 第36-39页 |
| 3.1.1 样品采集和处理 | 第36页 |
| 3.1.2 试验方法 | 第36-39页 |
| 3.1.3 数据统计分析 | 第39页 |
| 3.2 试验结果与分析 | 第39-58页 |
| 3.2.1 RNA质量检测 | 第39-40页 |
| 3.2.2 RNA-seq测序质量评估 | 第40-42页 |
| 3.2.3 RNA-seq Reads序列比对 | 第42页 |
| 3.2.4 Reads比对结果的归一化 | 第42-43页 |
| 3.2.5 差异表达基因筛选 | 第43-58页 |
| 3.3 讨论 | 第58-60页 |
| 3.4 小结 | 第60-61页 |
| 第四章 总体结论与建议 | 第61-62页 |
| 4.1 本研究的主要结论 | 第61页 |
| 4.2 有待进一步研究的问题 | 第61-62页 |
| 参考文献 | 第62-77页 |
| 附录 | 第77-89页 |
| 致谢 | 第89-90页 |
| 作者简介 | 第90页 |