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CO2驱动下能源微藻代谢调控机制的多组学分析

摘要第5-7页
Abstract第7-9页
第一章 绪论第15-32页
    1.1 引言第15-16页
    1.2 微藻生物固碳技术第16-17页
        1.2.1 固碳技术的发展前景第16页
        1.2.2 微藻固碳的研究现状第16-17页
    1.3 能源微藻第17-22页
        1.3.1 传统能源微藻 —— 小球藻第18-19页
        1.3.2 新型能源微藻 —— 胶球藻第19-20页
        1.3.3 微藻油脂合成第20-22页
            1.3.3.1 微藻脂肪酸合成第20-21页
            1.3.3.2 微藻TAG合成途径第21-22页
            1.3.3.3 利用基因工程手段提高微藻油脂的相关研究第22页
    1.4 微藻多组学研究平台第22-29页
        1.4.1 细胞组学第22-24页
            1.4.1.1 荧光分子探针第23页
            1.4.1.2 流式细胞分析技术第23-24页
            1.4.1.3 激光共聚焦扫描显微术第24页
        1.4.2 代谢组学第24-25页
        1.4.3 转录组学第25-27页
        1.4.4 组学相关分析工具第27-29页
            1.4.4.1 多元变量统计分析第27-28页
            1.4.4.2 代谢通路分析第28-29页
    1.5 本论文的研究目的意义和内容第29-32页
        1.5.1 研究目的意义第29-30页
        1.5.2 研究内容第30-32页
第二章 CO_2驱动下普通小球藻的生理生化调节机制第32-47页
    2.1 引言第32页
    2.2 材料与方法第32-34页
        2.2.1 实验藻株和培养基第32-33页
        2.2.2 主要试剂第33页
        2.2.3 仪器与设备第33-34页
    2.3 实验方法第34-38页
        2.3.1 藻株培养第34-36页
            2.3.1.1 藻种保存第34-35页
            2.3.1.2 光生物反应器中自养培养和样品收集第35-36页
        2.3.2 分析方法第36-38页
            2.3.2.1 藻细胞的生长参数第36页
            2.3.2.2 CO_2固定速率第36页
            2.3.2.3 脂肪酸的组成和含量第36-37页
            2.3.2.4 其他生化成分的测定第37页
            2.3.2.5 基于细胞荧光特性的细胞组学分析第37-38页
            2.3.2.6 显著检验第38页
    2.4 结果与讨论第38-44页
        2.4.1 细胞生长曲线及培养基pH变化第38-39页
        2.4.2 总碳含量及CO_2固定速率第39-40页
        2.4.3 CO_2驱动下细胞内中性脂的积累第40-42页
        2.4.4 不同浓度CO_2下普通小球藻的生化组成分析第42-44页
        2.4.5 与同类研究的结果对比第44页
    2.5 小结第44-47页
第三章 CO_2驱动下的普通小球藻代谢组学研究第47-62页
    3.1 引言第47页
    3.2 材料与方法第47页
        3.2.1 实验藻株及培养基第47页
        3.2.2 主要试剂第47页
        3.2.3 仪器与设备第47页
    3.3 实验方法第47-49页
        3.3.1 样品的获得与选取第47页
        3.3.2 细胞全代谢物的提取和衍生化第47-48页
        3.3.3 全细胞代谢物的GC/TOF-MS分析第48页
        3.3.4 数据预处理第48页
        3.3.5 多元变量统计分析第48-49页
        3.3.6 数据深度分析第49页
            3.3.6.1 通路富集分析第49页
            3.3.6.2 聚类分析第49页
            3.3.6.3 通路分析第49页
    3.4 结果与讨论第49-61页
        3.4.1 全代谢物谱物质鉴定及分类第49-50页
        3.4.2 利用PCA分析全代谢物谱物的整体差异第50-51页
        3.4.3 利用OPLS-DA模型鉴定代谢标志物第51-56页
        3.4.4 代谢标志物的通路富集分析第56-57页
        3.4.5 普通小球藻CS-42 响应CO_2补充的代谢网络调控规律第57-61页
    3.5 小结第61-62页
第四章 亚椭圆胶球藻C-169 响应CO_2补充的代谢生理研究第62-71页
    4.1 引言第62页
    4.2 材料与仪器第62-63页
        4.2.1 实验藻株与培养基第62-63页
        4.2.2 主要试剂第63页
        4.2.3 实验仪器设备第63页
    4.3 实验方法第63-65页
        4.3.1 藻株培养第63-64页
            4.3.1.1 藻种保存第63页
            4.3.1.2 藻种活化及传代第63页
            4.3.1.3 藻种培养及样品收集第63-64页
        4.3.2 分析测试第64-65页
            4.3.2.1 细胞生长参数测定第64页
            4.3.2.2 CO_2固定速率第64页
            4.3.2.3 中性脂及叶绿素a的相对含量测定第64页
            4.3.2.4 激光共聚焦扫描显微镜观察藻细胞荧光特性第64页
            4.3.2.5 脂肪酸的组成及含量测定第64-65页
    4.4 结果与讨论第65-70页
        4.4.1 不同CO_2浓度对亚椭圆胶球藻C-169 的生长影响第65-66页
        4.4.2 不同CO_2浓度对亚椭圆胶球藻C-169 叶绿素及脂类含量的影响第66-68页
        4.4.3 不同CO_2浓度对亚椭圆胶球藻C-169 脂肪酸含量及组成的影响第68-69页
        4.4.4 CO_2补充下亚椭圆胶球藻C-169 固碳速率第69-70页
    4.5 小结第70-71页
第五章 CO_2驱动下亚椭圆胶球藻C-169 的转录组分析第71-93页
    5.1 引言第71页
    5.2 材料与方法第71-77页
        5.2.1 实验材料第71-72页
            5.2.1.1 实验藻株及培养基第71页
            5.2.1.2 实验试剂第71-72页
            5.2.1.3 仪器设备第72页
        5.2.2 实验方法第72-77页
            5.2.2.1 藻株培养及收集第72页
            5.2.2.2 总RNA提取和质量评估第72-73页
            5.2.2.3 转录组测序第73-74页
            5.2.2.4 测序数据质控差异基因筛选第74页
            5.2.2.5 富集分析第74-75页
            5.2.2.6 荧光定量PCR分析第75-77页
    5.3 结果与讨论第77-92页
        5.3.1 测序样品的准备及质量评估第77-78页
        5.3.2 cDNA测序文库第78-80页
        5.3.3 DGE数据相关性分析及qRT-PCR验证第80-81页
        5.3.4 差异表达基因的鉴定、功能注释及富集分析第81-92页
    5.4 小结第92-93页
第六章 CO_2驱动下亚椭圆胶球藻C-169 的代谢通路分析第93-109页
    6.1 引言第93页
    6.2 材料与方法第93-94页
        6.2.1 藻种与培养基第93页
        6.2.2 分析方法第93-94页
            6.2.2.1 代谢通路分析第93页
            6.2.2.2 荧光定量PCR第93-94页
            6.2.2.3 羧化酶酶活测定第94页
    6.3 结果与讨论第94-108页
        6.3 1 亚椭圆胶球藻 C-169 中心代谢通路的调控规律第94-103页
            6.3.1.1 碳固定第94-96页
            6.3.1.2 戊糖磷酸途径第96页
            6.3.1.3 光合磷酸化第96-97页
            6.3.1.4 糖酵解及糖异生途径第97-98页
            6.3.1.5 三羧酸循环及氧化磷酸化第98-100页
            6.3.1.6 氮获取及氮同化第100-102页
            6.3.1.7 油脂代谢第102-103页
        6.3.2 其它受显著调控的基因家族第103-104页
        6.3.3 特定基因的时序性调控规律第104-105页
        6.3.4 羧化酶的催化活性变化情况第105-106页
        6.3.5 亚椭圆胶球藻C-169 响应CO_2补充的特殊调控策略第106-107页
        6.3.6 潜在代谢工程改造靶点第107-108页
    6.4 小结第108-109页
结论、创新点及展望第109-113页
    1. 结论第109-111页
    2. 创新点第111页
    3. 展望第111-113页
参考文献第113-126页
附录第126-151页
攻读博士学位期间取得的研究成果第151-152页
致谢第152-153页
附表第153页

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