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糖丁基梭菌产丁醇途径在大肠杆菌中的构建及其发酵优化

摘要第3-4页
Abstract第4页
第一章 绪论第8-17页
    1.1 丁醇概述第8-13页
        1.1.1 丁醇的特征及应用第8页
        1.1.2 丁醇的生产方式第8-9页
        1.1.3 梭菌发酵生产丁醇的国内外研究第9页
        1.1.4 微生物发酵生产丁醇的代谢途径第9-11页
        1.1.5 代谢工程菌的构建及其发酵生产丁醇的研究进展第11-13页
    1.2 本研究采用的重组大肠杆菌的改造方法第13-14页
        1.2.1 Red同源重组法第13-14页
        1.2.2 CRISPR-Cas基因编辑法第14页
    1.3 本课题的研究意义和目标第14-17页
        1.3.1 基金来源第14页
        1.3.2 研究意义第14-15页
        1.3.3 研究目标及主要研究内容第15-17页
第二章 实验材料与方法第17-25页
    2.1 实验材料第17-19页
        2.1.1 菌种与质粒第17-18页
        2.1.2 实验仪器设备和试剂第18-19页
        2.1.3 实验所用引物第19页
        2.1.4 培养基及缓冲液第19页
    2.2 实验方法第19-25页
        2.2.1 丁醇生产途径关键基因thl A的替代第19-21页
        2.2.2 产代谢副产物的支路途径相关基因的敲除第21-22页
        2.2.3 辅酶NADH及乙酰辅酶A再生相关基因的过表达第22页
        2.2.4 基因组整合第22-24页
        2.2.5 发酵过程优化第24-25页
第三章 实验结果与讨论第25-44页
    3.1 丁醇合成途径关键基因thl A的替代第25-28页
        3.1.1 E. coli. JM109 (DE3)的基因组提取第25-26页
        3.1.2 ato B,ato DAEB和ato BDA基因片段的扩增第26页
        3.1.3 线性化载体的制备第26页
        3.1.4 连接及验证第26-27页
        3.1.5 基因替换后的重组菌发酵产物分析第27-28页
    3.2 产代谢副产物的支路途径相关基因的敲除第28-32页
        3.2.1 打靶片段的扩增第29页
        3.2.2 pKD46质粒的导入第29页
        3.2.3 电转化及验证第29-30页
        3.2.4 抗性消除第30-31页
        3.2.5 敲除菌的发酵产物分析第31-32页
    3.3 辅酶NADH及乙酰辅酶A再生相关基因的表达第32-34页
        3.3.1 目的片段扩增及载体制备第32-33页
        3.3.2 一步克隆连接并验证第33页
        3.3.3 发酵产物分析第33-34页
    3.4 基因组整合第34-38页
        3.4.1 pTargetF-sgRNA的构建第34-35页
        3.4.2 带同源臂的片段构建第35页
        3.4.3 电转及验证第35-36页
        3.4.4 基因组整合后的重组菌的发酵验证第36页
        3.4.5 基因组整合菌株发酵产丁醇的研究第36-38页
    3.5 发酵过程的优化第38-44页
        3.5.1 接种策略的优化第38-39页
        3.5.2 发酵温度的优化第39-40页
        3.5.3 诱导剂浓度的优化第40页
        3.5.4 发酵起始菌浓的优化第40-41页
        3.5.5 丁酸补加第41-42页
        3.5.6 利用优化的发酵条件进行丁醇生产第42-44页
主要结论与展望第44-46页
致谢第46-47页
参考文献第47-53页
附录第53-57页
    附录 1:本研究所用的引物第53-55页
    附录 2:糖浓度标准曲线第55-56页
    附录 3:溶剂标准曲线第56-57页
    附录 4:作者在硕士学位期间发表的论文第57页

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