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影响稻米理化品质微效基因的定位与效应解析

摘要第6-9页
Abstract第9-11页
符号说明第12-14页
第1章 文献综述第14-32页
    1.1 稻米品质性状评价概述第14-19页
        1.1.1 稻米品质性状评价要素第14-15页
        1.1.2 种子理化组成与稻米品质的关系第15-17页
        1.1.3 胚乳淀粉合成与稻米品质的关系第17-19页
    1.2 稻米理化品质QTL定位研究进展第19-27页
        1.2.1 直链淀粉含量的遗传及QTL第19-23页
        1.2.2 糊化温度的遗传及QTL第23-24页
        1.2.3 稻米粘滞性的遗传及QTL第24-25页
        1.2.4 稻米延展性的遗传及QTL第25-26页
        1.2.5 稻米胶稠度的遗传及QTL第26-27页
    1.3. 作物定位群体的类型与发展第27-30页
        1.3.1 作物定位群体的类型第28页
        1.3.2 CSSL在稻米品质性状QTL定位中的应用第28-30页
    1.4 本研究的目的与意义第30-32页
第2章 利用染色体片段代换系定位理化品质微效QTL第32-75页
    2.1 前言第32-33页
    2.2 材料与方法第33-39页
        2.2.1 水稻材料第33-34页
        2.2.2 全基因组重测序分析第34-35页
            2.2.2.1 DNA的提取第34-35页
            2.2.2.2 全基因组重测序及分析第35页
        2.2.3 Bin-map的绘制与定位分析第35-36页
        2.2.4 稻米理化品质的测定第36-38页
            2.2.4.1 成熟种子的前处理第36页
            2.2.4.2 直链淀粉含量测定第36页
            2.2.4.3 胶稠度测定第36-37页
            2.2.4.4 糊化温度测定第37页
            2.2.4.5 RVA谱测定第37-38页
            2.2.4.6 米粒延伸性测定第38页
            2.2.4.7 蛋白质含量测定第38页
        2.2.5 QTL定位第38-39页
    2.3 结果与分析第39-71页
        2.3.1 染色体片段代换系的基因型第39-42页
        2.3.2 CSSL稻米理化品质的表现第42-51页
            2.3.2.1 理化品质性状的次数分布第42页
            2.3.2.2 理化品质性状的变异分析第42-50页
            2.3.2.3 理化品质性状间的相关性分析第50-51页
        2.3.3 稻米理化品质性状的QTL定位第51-69页
            2.3.2.1 直链淀粉含量QTL的定位及效应分析第51-52页
            2.3.2.2 胶稠度QTL的定位及效应分析第52-55页
            2.3.2.3 糊化温度QTL的定位及效应分析第55-57页
            2.3.2.4 RVA谱特征值QTL定位及效应分析第57-63页
            2.3.2.5 稻米延伸性QTL定位及效应分析第63-64页
            2.3.2.6 蛋白质含量QTL定位及效应分析第64-69页
        2.3.4 理化品质定位QTL的整合分析第69-71页
    2.4 小结与讨论第71-75页
        2.4.1 小结第71页
        2.4.2 讨论第71-75页
            2.4.2.1 CSSL在复杂性状研究中的优势第72-73页
            2.4.2.2 重测序技术在QTL定位中的应用第73页
            2.4.2.3 与前人稻米品质QTL定位结果的比较第73-75页
第3章 含多个定位QTL染色体片段代换系稻米淀粉特性及结构分析第75-88页
    3.1 前沿第75-76页
    3.2 材料与方法第76-78页
        3.2.1 水稻材料第76页
        3.2.2 稻米样品前处理第76页
        3.2.3 淀粉的提取第76-77页
        3.2.4 淀粉热力学特性分析第77页
        3.2.5 淀粉晶体X-衍射分析第77页
        3.2.6 淀粉分子量分布分析第77-78页
    3.3 结果与分析第78-85页
        3.3.1 三个CSSL的理化品质表现第78-80页
        3.3.2 三个CSSL的基因型及定位的QTL第80-81页
        3.3.3 淀粉热力学特性第81-83页
        3.3.4 淀粉精细结构分析第83-85页
        3.3.5 稻米淀粉晶体结构分析第85页
    3.4 小结与讨论第85-88页
        3.4.1 小结第85-86页
        3.4.2 讨论第86-88页
            3.4.2.1 稻米理化品质与淀粉结构间的关系第86-87页
            3.4.2.2 等位基因变异对稻米理化品质的影响第87-88页
第4章 水稻SSI基因等位变异的遗传效应分析第88-109页
    4.1 前言第88-89页
    4.2 材料与方法第89-93页
        4.2.1 水稻材料第89-90页
            4.2.1.1 转基因材料第89-90页
            4.2.1.2 近等基因系第90页
        4.2.2 转基因水稻的鉴定第90-91页
        4.2.3 SSI基因的表达分析第91-92页
            4.2.3.1 水稻总RNA的提取第91页
            4.2.3.2 第一链cDNA的合成第91页
            4.2.3.3 荧光实时定量RT-PCR分析第91-92页
        4.2.4 稻米理化品质与淀粉结构分析第92页
        4.2.5 蒸煮食味值的测定第92-93页
    4.3 结果与分析第93-106页
        4.3.1 RNAi转基因系和近等基因系中SSI基因的表达第93-95页
            4.3.1.1 RNAi对SSI表达的影响第93页
            4.3.1.2 等位变异对SSI基因表达的影响第93-95页
        4.3.2 SSI等位变异对稻米品质的影响第95-99页
            4.3.2.1 RNAi抑制不同SSI等位基因对理化品质的影响第95-98页
            4.3.2.2 含不同SSI等位基因近等基因系理化品质的比较第98-99页
        4.3.3 SSI等位变异对稻米食味值的影响第99-101页
            4.3.3.1 不同背景下SSI-RNAi系米饭食味的比较第99页
            4.3.3.2 含不同SSI等位基因近等基因系米饭食味值的比较第99-101页
        4.3.4 SSI等位变异对淀粉晶型结构的影响第101-103页
            4.3.4.1 不同背景下SSI-RNAi稻米淀粉结晶度的比较第101-103页
            4.3.4.2 含不同SSI等位基因近等基囚系稻米淀粉结晶度的比较第103页
        4.3.5 SSI等位变异对稻米淀粉精细结构的影响第103-106页
            4.3.5.1 不同背景下SSI-RNAi淀粉精细结构的比较第103页
            4.3.5.2 含不同SSI等位基因近等基因系稻米淀粉精细结构的比较第103-106页
    4.4. 小结与讨论第106-109页
        4.4.1 研究小结第106-107页
            4.4.1.1 利用RNAi确定不同SSI等位基因的效应第106-107页
            4.4.1.2 基于近等基因系探寻SSI等位基因的效应第107页
        4.4.2 讨论第107-109页
            4.4.2.1 SSI的功能探究第107-108页
            4.4.2.2 SSI基因等位变异的效应第108页
            4.4.2.3 研究展望第108-109页
全文小结第109-111页
参考文献第111-121页
致谢第121-122页
攻读学位期间发表的学术论文第122-123页

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