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鸡MMP-13基因的表达特征及遗传学效应研究

英文缩略词第4-8页
中文摘要第8-9页
Abstract第9-10页
1 前言第11-21页
    1.1 家禽卵巢卵泡发育第11-16页
        1.1.1 鸡卵泡发育特征及过程第11-12页
        1.1.2 卵泡膜细胞和颗粒细胞第12-13页
        1.1.3 卵泡血管化及神经支配第13-14页
        1.1.4 鸡卵泡发育过程中的影响因素第14-16页
            1.1.4.1 影响卵泡发育的激素第14-15页
            1.1.4.2 影响卵泡发育的生长因子第15-16页
    1.2 MMP-13基因的生物学特征及在卵巢发育中的功能第16-20页
        1.2.1 MMP-13基因的生物学特征第16-18页
            1.2.1.1 MMPs家族的结构特点第17-18页
            1.2.1.2 MMPs基因的表达调节第18页
        1.2.2 MMP-13在卵巢发育中的功能第18-20页
            1.2.2.1 MMPs在卵泡发育周期中的作用第19页
            1.2.2.2 MMPs家族与卵泡发育中的血管发生第19-20页
    1.3 本研究的目的意义第20-21页
2 材料与方法第21-42页
    2.1 试验材料第21-23页
        2.1.1 实验动物及样本采集第21页
        2.1.2 主要仪器及厂商第21-22页
        2.1.3 主要试剂及来源第22页
        2.1.4 所用试剂的配制第22-23页
        2.1.5 主要分子生物学数据库及软件第23页
    2.2 方法第23-41页
        2.2.1 核酸的提取、回收及检测第23-27页
            2.2.1.1 鸡血液基因组提取第23-24页
            2.2.1.2 DNA产物回收第24-25页
            2.2.1.3 鸡卵巢RNA提取第25-26页
            2.2.1.4 膜细胞和颗粒细胞RNA提取第26页
            2.2.1.5 RNA浓度和质量检测第26-27页
        2.2.2 实时荧光定量PCR检测第27-29页
            2.2.2.1 反转录获得cDNA第27页
            2.2.2.2 实时荧光定量PCR第27-29页
        2.2.3 Western Blotting检测第29-32页
            2.2.3.1 组织蛋白质提取第29页
            2.2.3.2 蛋白质浓度检测第29-30页
            2.2.3.3 蛋白质变性第30页
            2.2.3.4 蛋白电泳步骤第30-32页
        2.2.4 免疫组织化学方法检测第32-34页
            2.2.4.1 制作石蜡切片第32页
            2.2.4.2 免疫组化实验第32-34页
        2.2.5 删除载体的构建第34-39页
            2.2.5.1 删除载体的克隆转化及测序第34-36页
                2.2.5.1.1 基因启动子区的PCR扩增和回收第34页
                2.2.5.1.2 MMP-13基因启动子片段与pGL3-Basic Vector的连接第34-35页
                2.2.5.1.3 将连接产物转化感受态细胞第35页
                2.2.5.1.4 质粒DNA的制备与提取第35-36页
            2.2.5.2 不同删除片段的荧光素酶载体的构建第36-38页
            2.2.5.3 不同缺失片段去内毒素处理第38-39页
                2.2.5.3.1 去内毒素质粒的提取第38-39页
                2.2.5.3.2 提取质粒浓度及质量检测第39页
        2.2.6 鸡卵泡颗粒细胞和膜细胞的分离培养第39-40页
        2.2.7 瞬时转染及双荧光素酶活性检测第40-41页
            2.2.7.1 Nanofection瞬时转染操作第40页
            2.2.7.2 双荧光素酶活性检测第40-41页
    2.3 统计与分析第41-42页
3 结果与分析第42-55页
    3.1 MMP-13基因mRNA和蛋白在鸡卵巢和卵泡发育过程中的表达第42-46页
        3.1.1 总RNA的提取第42页
        3.1.2 MMP-13 mRNA和蛋白在鸡卵巢开产前后的表达变化第42-44页
        3.1.3 MMP-13 mRNA和蛋白在鸡开产后不同卵泡中的表达变化第44页
        3.1.4 MMP-13蛋白在卵巢和卵泡中的免疫定位第44-46页
    3.2 MMP-13基因启动子区分析第46-48页
        3.2.1 鸡卵巢组织DNA提取第46页
        3.2.2 MMP-13基因 5′调控区片段扩增第46-47页
        3.2.3 pGL-MMP133340载体序列比对第47页
        3.2.4 MMP-13启动子区删除载体的构建第47-48页
        3.2.5 双荧光素酶分析MMP-13基因启动子区不同片段活性第48页
    3.3 MMP-13关键启动子区SNPs的鉴定及群体多态性检测第48-52页
        3.3.1 测序检测到MMP-13关键启动子区存在6个SNPs第48-50页
        3.3.2 MMP-13基因启动子区在不同鸡种中的等位基因和基因型频率第50-51页
        3.3.3 MMP-13启动子区突变位点的单倍型频率分析第51-52页
    3.4 隐性白洛克群体中MMP-13启动子区SNPs位点与产蛋性能的关联分析第52-55页
        3.4.1 隐性白洛克群体中MMP-13启动子区SNPs位点连锁不平衡分析第52页
        3.4.2 隐性白洛克群体中MMP-13启动子区SNPs位点与产蛋性状关联分析第52-53页
        3.4.3 MMP-13启动子区多态位点对基因表达的影响第53-54页
        3.4.4 相关转录因子结合位点预测第54-55页
4 讨论第55-58页
    4.1 MMP-13基因在鸡卵巢卵泡中的表达特征第55-56页
    4.2 MMP-13基因启动子区SNPs与产蛋性能的遗传学效应第56-58页
5 结论第58-59页
参考文献第59-66页
硕士期间发表的论文及专利申请情况第66-67页
致谢第67页

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