| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 第一章 绪论 | 第13-23页 |
| 1.1 大刺鳅简介和研究概况 | 第13-15页 |
| 1.1.1 简介 | 第13-14页 |
| 1.1.2 研究概况 | 第14-15页 |
| 1.2 微卫星标记简介和应用 | 第15-20页 |
| 1.2.1 微卫星标记简介 | 第15-16页 |
| 1.2.2 微卫星标记的应用 | 第16-20页 |
| 1.3 微卫星标记的开发策略 | 第20-22页 |
| 1.4 微卫星标记的评价方法 | 第22页 |
| 1.5 研究目的与意义 | 第22-23页 |
| 第二章 大刺鳅微卫星位点开发及通用性验证 | 第23-44页 |
| 2.1 实验材料 | 第24页 |
| 2.2 实验方法 | 第24-29页 |
| 2.2.1 基因组DNA提取 | 第24-25页 |
| 2.2.2 PIMA法开发大刺鳅微卫星位点 | 第25-27页 |
| 2.2.2.1 RAPD片段获取 | 第25页 |
| 2.2.2.2 DNA片段回收 | 第25-26页 |
| 2.2.2.3 载体连接及转化大肠杆菌 | 第26-27页 |
| 2.2.2.4 引物设计及合成 | 第27页 |
| 2.2.3 RAD-seq法开发大刺鳅微卫星位点 | 第27页 |
| 2.2.4 大刺鳅微卫星位点的通用性研究 | 第27页 |
| 2.2.5 引物筛选 | 第27-28页 |
| 2.2.6 数据分析 | 第28-29页 |
| 2.3 实验结果 | 第29-39页 |
| 2.3.1 PIMA法开发大刺鳅微卫星位点 | 第29-31页 |
| 2.3.2 RAD-seq法开发大刺鳅微卫星位点 | 第31-39页 |
| 2.3.2.1 RAD-seq测序结果分析 | 第31页 |
| 2.3.2.2 微卫星引物的筛选结果 | 第31-39页 |
| 2.3.3 大刺鳅微卫星位点的通用性研究 | 第39页 |
| 2.4 讨论 | 第39-44页 |
| 2.4.1 引物筛选方法的比较分析 | 第39-40页 |
| 2.4.2 两种引物开发方法的比较 | 第40-42页 |
| 2.4.3 不同碱基重复类型微卫星DNA对筛选效率的影响 | 第42-43页 |
| 2.4.4 大刺鳅微卫星位点的通用性研究 | 第43-44页 |
| 第三章 基于微卫星标记分析大刺鳅野生群体遗传多样性 | 第44-57页 |
| 3.1 实验材料 | 第44-46页 |
| 3.2 实验方法 | 第46-47页 |
| 3.2.1 基因组DNA提取 | 第46页 |
| 3.2.2 PCR扩增和引物筛选 | 第46页 |
| 3.2.3 数据分析 | 第46-47页 |
| 3.3 实验结果 | 第47-54页 |
| 3.3.1 遗传多样性分析 | 第47-48页 |
| 3.3.2 遗传结构与聚类分析 | 第48-54页 |
| 3.4 讨论 | 第54-57页 |
| 3.4.1 样本量的选择 | 第54-55页 |
| 3.4.2 群体遗传多样性 | 第55-56页 |
| 3.4.3 群体遗传结构 | 第56-57页 |
| 第四章 基于EPIC分子标记的大刺鳅群体遗传多样性分析 | 第57-71页 |
| 4.1 实验材料 | 第57页 |
| 4.2 实验方法 | 第57-58页 |
| 4.2.1 基因组DNA提取 | 第57页 |
| 4.2.2 PCR扩增 | 第57-58页 |
| 4.2.3 TA克隆 | 第58页 |
| 4.2.4 数据分析 | 第58页 |
| 4.3 结果 | 第58-69页 |
| 4.3.1 EPIC扩增结果 | 第58-59页 |
| 4.3.2 EPIC基因片段序列特征和遗传多样性 | 第59-65页 |
| 4.3.3 中性检验与种群历史 | 第65-69页 |
| 4.4 讨论 | 第69-71页 |
| 第五章 总结与展望 | 第71-74页 |
| 5.1 全文总结 | 第71页 |
| 5.2 本研究的创新之处 | 第71-72页 |
| 5.3 本研究的不足之处 | 第72页 |
| 5.4 展望 | 第72-74页 |
| 参考文献 | 第74-86页 |
| 攻读硕士期间发表的论文 | 第86-87页 |
| 致谢 | 第87页 |
