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基于lncRNA测序分析K型细胞质温敏雄性不育小麦KTM3315A的育性转换分子机理

摘要第6-8页
Abstract第8-9页
第一章 文献综述第13-21页
    1.1 杂种优势利用及植物雄性不育第13-15页
        1.1.1 杂种优势第13页
        1.1.2 植物细胞质雄性不育第13-15页
    1.2 温敏雄性不育小麦第15-16页
        1.2.1 温敏雄性不育第15页
        1.2.2 KTM3315A第15-16页
    1.3 转录组测序和lncRNA第16-17页
        1.3.1 转录组测序及其数据分析第16-17页
        1.3.2 长链非编码RNA第17页
    1.4 苯丙烷、茉莉酸与MYB转录因子第17-19页
        1.4.1 苯丙烷与MYB转录因子第17-18页
        1.4.2 茉莉酸与MYB转录因子第18页
        1.4.3 MYB、茉莉酸和苯丙烷生物合成途径在雄性不育过程中的作用机理第18-19页
    1.5 锌指蛋白第19-20页
    1.6 研究的目的意义第20-21页
第二章 KTM3315A的转录组测序分析第21-34页
    2.1 实验材料第21页
    2.2 实验方法第21-22页
        2.2.1 表型特征和细胞学观察第21-22页
        2.2.2 建库准备和长链非编码 RNA 测序第22页
        2.2.3 测序质量的控制第22页
        2.2.4 差异表达基因的分析第22页
    2.3 结果与分析第22-32页
        2.3.1 不同育性条件下KTM3315A的形态特征及细胞学观察第22-24页
        2.3.2 测序质量的评估第24-25页
        2.3.3 样品基因表达量第25-26页
        2.3.4 差异表达基因的功能分类第26-32页
    2.4 讨论第32-34页
        2.4.1 KTM3315A具有稳定育性第32页
        2.4.2 KTM3315A的育性转换候选基因的功能定位第32页
        2.4.3 KTM3315A的育性转换候选基因的表达趋势分析第32-34页
第三章 苯丙烷和茉莉酸生物合成途径及MYB转录因子在KTM3315A育性转换机制中的作用关系研究第34-42页
    3.1 实验材料第34页
    3.2 实验方法第34页
    3.3 结果与分析第34-40页
        3.3.1 转录因子统计第34-35页
        3.3.2 转录因子与差异表达基因的互作网络分析第35-37页
        3.3.3 参与苯丙烷与茉莉酸的生物合成通路的差异表达基因分析第37-38页
        3.3.4 三者调控育性方面的作用关系第38-39页
        3.3.5 MYB-related protein p-1第39-40页
    3.4 讨论第40-42页
        3.4.1 与热激转录因子互作的育性转换候选基因第40页
        3.4.2 苯丙烷和茉莉酸生物合成途径中的酶第40-42页
第四章 lncRNA调控其靶基因影响育性转换的研究第42-56页
    4.1 实验材料第42页
    4.2 实验方法第42-43页
    4.3 结果与分析第43-53页
        4.3.1 lncRNA分析第43-44页
        4.3.2 差异表达基因的相关性聚类分析第44-46页
        4.3.3 lncRNA-TaPCF的验证及其靶基因的功能富集分析第46-52页
        4.3.4 lncRNA与靶基因在育性转换调控中的作用关系第52-53页
    4.4 讨论第53-56页
        4.4.1 lncRNA第53-54页
        4.4.2 锌指蛋白第54页
        4.4.3 lncRNA-TaPCF的靶基因功能注释分析第54-56页
第五章 关键育性转换候选基因的荧光定量PCR测定第56-62页
    5.1 实验材料第56页
    5.2 实验方法第56页
    5.3 结果与分析第56-60页
        5.3.1 育性转换候选基因的qRT-PCR的结果第56-57页
        5.3.2 lncRNA靶基因的qRT-PCR的结果第57-60页
    5.4 讨论第60-62页
结论第62-63页
参考文献第63-72页
致谢第72-73页
作者简介第73页

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