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依赖FMN的硝基还原酶Rv3368c的晶体结构学和功能学研究

摘要第10-11页
ABSREACT第11页
缩略符号说明第12-13页
第一章 前言第13-28页
    1.1 引言第13页
    1.2 结核分枝杆菌的生物学特性第13-14页
        1.2.1 结核分枝杆菌的形态与染色第13-14页
        1.2.2 结核分枝杆菌的生化反应第14页
    1.3 结核分枝杆菌进化、复合群分类以及分类依据第14-15页
        1.3.1 结核分枝杆菌进化第14页
        1.3.2 复合群分类以及分类依据第14-15页
    1.4 结核分枝杆菌基因组介绍(对结核分枝杆菌中的国际标准菌株H37Rv的介绍)第15页
    1.5 结核分枝杆菌致病性第15-16页
    1.6 结核病的现状第16页
    1.7 结核病特点第16-17页
    1.8 结合现状研究结核分枝杆菌的意义第17页
    1.9 新型药物的发现第17-18页
    1.10 结核分枝杆菌中的硝基还原酶第18页
    1.11 硝基还原酶第18-23页
        1.11.1 硝基还原酶的分类以及催化机制第18-19页
        1.11.2 硝基还原酶的生理功能第19-20页
        1.11.3 硝基还原酶在环境污染和人体健康方面的作用第20-22页
            1.11.3.1 硝基还原酶在生物方面的应用技术第20-21页
            1.11.3.2 硝基还原酶在癌症治疗方面的应用第21-22页
        1.11.4 硝基还原酶在抗药性中的作用第22-23页
    1.12 结核分枝杆菌中的硝基还原酶Rv3368c第23-25页
    1.13 晶体的生长原理第25-26页
    1.14 本文研究的内容与意义第26-28页
第二章 实验材料与方法第28-43页
    2.1 引言第28页
    2.2 实验材料第28-29页
        2.2.1 实验载体质粒第28-29页
        2.2.2 实验菌株第29页
    2.3 实验仪器和耗材第29-32页
        2.3.1 实验仪器第29-30页
        2.3.2 实验试剂第30-31页
        2.3.3 培养基和缓冲液第31-32页
    2.4 实验方法第32-43页
        2.4.1 原核表达载体的体外构建第32-34页
        2.4.2 重组质粒的转化第34-36页
            2.4.2.1 感受态细胞的制备与转化第34-35页
            2.4.2.2 重组质粒提取与鉴定第35-36页
        2.4.3 目的蛋白的表达纯化第36-38页
            2.4.3.1 目的蛋白的原核表达第36页
            2.4.3.2 硒代蛋白表达(代谢途径抑制)第36-37页
            2.4.3.3 目的蛋白常用的纯化方法第37-38页
        2.4.4 重组蛋白的限制性酶切第38页
        2.4.5 晶体生长及结构解析第38-40页
        2.4.6 晶体衍射数据的收集与处理第40-41页
        2.4.7 等温量热滴定实验(Isothermal titration Calorimetry, ITC)第41-42页
        2.4.8 荧光热稳定性实验(Thermal Shift Assay,TSA)第42页
        2.4.9 分析超速离心第42-43页
第三章 依赖FMN的硝基还原酶Rv3368c的蛋白纯化、结晶和结构解析第43-54页
    3.1 引言第43页
    3.2 Rv3368c蛋白的表达纯化第43-48页
        3.2.1 Rv3368c蛋白的表达纯化第43-45页
        3.2.2 Rv3368c蛋白的结晶第45-48页
    3.3 硒代蛋白Rv3368c的表达纯化和结晶第48-51页
        3.3.1 硒代蛋白Rv3368c的表达纯化第48-49页
        3.3.2 硒代蛋白Rv3368c的结晶第49-51页
        3.3.3 硒代蛋白Rv3368c的数据收集与处理第51页
    3.4 Rv3368c蛋白结构第51-53页
    3.5 本章小结和讨论第53-54页
第四章 Rv3368c-FMN二元复合物结构解析、Rv3368c突变体和FMN结合验证、Rv3368c底物识别第54-65页
    4.1 引言第54页
    4.2 Rv3368c与大肠杆菌中的硝基还原酶(NTR)结构比较第54-55页
    4.3 Rv3368c蛋白与小分子FMN的结合实验第55-56页
    4.4 Rv3368c蛋白和小分子FMN生长第56-61页
        4.4.1 Rv3368c蛋白和小分子FMN共结晶第56-57页
        4.4.2 Rv3368c蛋白和小分子FMN共孵育的数据收集和处理第57-61页
    4.5 Rv3368c底物识别第61-63页
    4.6 Rv3368c、FMN、NADPH三复合物共晶生长和Rv3368c、FMN、NADPH、BT2043四复合物共晶生长第63页
    4.7 本章小结与讨论第63-65页
第五章 工作总结与展望第65-67页
    5.1 工作总结第65-66页
    5.2 展望第66-67页
参考文献第67-72页
致谢第72-73页
学位论文评阅及答辩情况表第73页

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