摘要 | 第10-12页 |
ABSTRACT | 第12-13页 |
缩略词语表 | 第14-16页 |
前言 | 第16-17页 |
第一章 文献综述 | 第17-29页 |
1.1 植物雄性不育的遗传 | 第17-19页 |
1.2 植物雄性不育的生理生化研究 | 第19-22页 |
1.2.1 植物激素与雄蕊育性 | 第19-20页 |
1.2.2 物质代谢与植物雄性不育 | 第20-21页 |
1.2.3 能量代谢与植物雄性不育 | 第21-22页 |
1.3 植物雄性不育的细胞学研究 | 第22-23页 |
1.4 植物雄性不育相关基因及microRNA研究 | 第23-26页 |
1.4.1 花粉和花药发育相关基因 | 第23-25页 |
1.4.2 花粉发育相关microRNA | 第25-26页 |
1.5 DNA测序技术在植物雄性不育研究中的应用 | 第26-27页 |
1.6 本研究目的及意义 | 第27-29页 |
第二章 大白菜雄性不育基因Ms定位区间BAC克隆筛选与测序 | 第29-46页 |
2.1 材料与方法 | 第29-36页 |
2.1.1 试材 | 第29页 |
2.1.2 DNA提取与检测 | 第29-30页 |
2.1.3 BAC克隆筛选引物与基因克隆引物的设计 | 第30页 |
2.1.4 BAC克隆筛选 | 第30-31页 |
2.1.5 质粒提取 | 第31-33页 |
2.1.6 BAC克隆测序 | 第33-35页 |
2.1.7 基因克隆与转化 | 第35-36页 |
2.2 结果与分析 | 第36-45页 |
2.2.1 BAC克隆筛选结果 | 第36-38页 |
2.2.2 BAC克隆质粒提取结果 | 第38页 |
2.2.3 BAC克隆测序结果 | 第38-40页 |
2.2.4 BAC克隆序列中的倒位与大片段插入 | 第40页 |
2.2.5 BAC克隆拼接序列基因预测 | 第40-43页 |
2.2.6 基因序列的比对 | 第43-45页 |
2.3 小结 | 第45-46页 |
第三章 大白菜核雄性不育相关基因的挖掘 | 第46-64页 |
3.1 材料与方法 | 第46-49页 |
3.1.1 植物材料 | 第46页 |
3.1.2 石蜡切片 | 第46-47页 |
3.1.3 RNA提取 | 第47页 |
3.1.4 RNA反转录 | 第47-48页 |
3.1.5 qRT-PCR检测 | 第48页 |
3.1.6 转录组测序分析方法 | 第48-49页 |
3.2 结果与分析 | 第49-63页 |
3.2.1 不育株花蕾形态特征 | 第49-50页 |
3.2.2 转录组测序质量分析 | 第50-51页 |
3.2.3 Unigene的组装与比对 | 第51-52页 |
3.2.4 测序数据与参考基因组比对结果 | 第52-53页 |
3.2.5 不育与可育花蕾的差异表达基因 | 第53-57页 |
3.2.6 差异表达基因的GO和PATHWAY功能富集分析 | 第57-58页 |
3.2.7 差异表达基因的表达模式验证 | 第58-63页 |
3.3 小结 | 第63-64页 |
第四章 大白菜核雄性不育相关microRNA的鉴定 | 第64-79页 |
4.1 材料与方法 | 第64-68页 |
4.1.1 植物材料 | 第64页 |
4.1.2 RNA提取 | 第64-65页 |
4.1.3 microRNA反转录 | 第65-66页 |
4.1.4 qRT-PCR检测 | 第66-67页 |
4.1.5 small RNA文库的构建与测序 | 第67页 |
4.1.6 生物信息学分析 | 第67-68页 |
4.2 结果与分析 | 第68-78页 |
4.2.1 small RNA文库测序质量分析 | 第68页 |
4.2.2 已知miRNA的鉴定 | 第68-69页 |
4.2.3 新miRNA的发现 | 第69-72页 |
4.2.4 不育与可育花蕾中差异表达miRNA | 第72页 |
4.2.5 miRNA靶基因预测 | 第72-76页 |
4.2.6 差异表达miRNA的表达模式验证 | 第76-78页 |
4.3 小结 | 第78-79页 |
讨论 | 第79-83页 |
结论 | 第83-84页 |
参考文献 | 第84-94页 |
附录 | 第94-106页 |
致谢 | 第106-107页 |
攻读学位期间发表的学术论文 | 第107页 |