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男子生精功能发生过程中piRNA功能的初步研究及miR-96促进乳腺癌发生机制的研究

摘要第7-9页
Abstract第9-11页
第一章 研究背景综述第12-39页
    第一节 小分子非编码RNA的研究进展第13-31页
        一、piRNA的研究进展第13-22页
            1. piRNA的发现第13-14页
            2. piRNA的分类第14页
            3. piRNA的结构特点第14-16页
            4. piRNA的生物合成第16-20页
            5. piRNA的生物功能第20-21页
                5.1 保护基因组的稳定性第20-21页
                5.2 piRNA调控mRNA的表达第21页
            6. piRNA与男性不孕不育第21-22页
        二、microRNA的研究进展第22-28页
            1. microRNA的发现第22页
            2. microRNA结构特点第22页
            3. microRNA生物合成第22-24页
            4. microRNA作用机制第24-26页
                4.1 miRNA介导mRNA特异性切割第25页
                4.2 miRNA抑制mRNA转录后翻译第25-26页
            5. microRNA与癌症第26-27页
            6. microRNA与乳腺癌第27-28页
        三、研究小分子非编码RNA的意义及前景展望第28-31页
            1. 小分子非编码RNA的生物学意义第28-29页
            2. 小分子非编码RNA的前景与展望第29-31页
    参考文献第31-39页
第二章 实验研究部分第39-147页
    第一节 男子生精功能发生过程中piRNA功能的初步研究第40-99页
        第一部分 piRNA在男性不育精浆中的差异表达第40-79页
            一、引言第40-42页
            二、实验材料和方法第42-54页
                1. 研究对象和样品收集第42-44页
                    1.1 样本收集第42页
                    1.2 样本处理第42-44页
                2. 主要仪器设备和试剂第44-45页
                    2.1 实验仪器设备第44页
                    2.2 实验所用试剂第44-45页
                3. 实验方法第45-47页
                    3.1 RNA提取第45-46页
                    3.2 反应体系的配制第46-47页
                4. Solexa测序第47-49页
                5. qRT-PCR检测piRNA的表达第49-51页
                    5.1 piRNA表达量的检测第49-50页
                    5.2 精浆中piRNA的稳定性检测第50页
                    5.3 精浆中piRNA可检测性第50-51页
                    5.4 piRNA引物探针扩增的特异性第51页
                6. Northern blotting方法检测精浆中piRNA第51-53页
                7. 数据分析第53-54页
            三、实验结果第54-74页
                1. 三组混合精浆测序结果第54-62页
                    1.1 三组混合精浆中小分子RNA第54-58页
                    1.2 精浆中小RNA的长度分布第58-59页
                    1.3 三组精浆中piRNA的分布第59-60页
                    1.4 不育患者精浆piRNA表达谱与正常对照的差异第60-62页
                2. 验证qRT-PCR方法的可靠性与可行性第62-64页
                    2.1 扩增检测piRNA的探针及引物的水背景第62-63页
                    2.2 精浆中piRNA可检测性第63页
                    2.3 qRT-PCR扩增的特异性第63-64页
                    2.4 精浆中piRNA的稳定性第64页
                3. Northern blotting法检测精浆中piRNA第64-65页
                4. qRT-PCR法检测精浆中piRNA含量第65-71页
                    4.1 piRNA标准曲线第65-66页
                    4.2 qRT-PCR对Solexa初筛的piRNA进行复筛第66-67页
                    4.3 qRT-PCR对复筛的结果的验证第67-69页
                    4.4 5种piRNA在不育患者与正常对照精浆中的表达量第69-71页
                5. 不育男性患者特异降低的精浆piRNA的ROC曲线分析第71-72页
                6. Risk score分析第72-74页
            四、结论第74-75页
            五、讨论第75-77页
            参考文献第77-79页
        第二部分 piRNA在男性不育精子中的差异表达及机制的初步研究第79-99页
            一、引言第79-81页
            二、实验材料和方法第81-88页
                1. 样本收集及处理第81-82页
                    1.1 样本收集第81页
                    1.2 样本处理第81-82页
                2. 主要仪器设备和试剂第82-83页
                    2.1 实验仪器设备第82页
                    2.2 实验所用试剂第82-83页
                3. 实验方法第83-87页
                    3.1 精子的分离及RNA的提取第83页
                    3.2 精子中蛋白的提取第83-84页
                    3.3 Western blot检测精子中的蛋白表达第84-86页
                    3.4 精浆中外泌体的提取第86页
                    3.5 精浆外泌体鉴定第86-87页
                    3.6 外泌体中RNA的提取、逆转和qRT-PCR第87页
                4. 数据分析第87-88页
            三、实验结果第88-94页
                1. 精子中Solexa结果第88-90页
                    1.1 精子中piRNA种类及含量第88页
                    1.2 精子中piRNA表达谱第88-89页
                    1.3 精浆中表达差异显著的piRNA在精子中的变化第89-90页
                    1.4 qRT-PCR对Solexa初筛的4个piRNA进行验证第90页
                2. MitoPLD蛋白在弱精症精子中表达量下降第90-91页
                3. 精浆中外泌体的分布第91-92页
                4. 精浆中piRNA的存在形式第92-93页
                5. 精浆Exosome中piRNA的差异表达第93-94页
            四、结论第94-95页
            五、讨论第95-97页
            参考文献第97-99页
    第二节 miR-96在乳腺癌中通过靶向PTPN9蛋白促进癌细胞的增殖、迁移和侵袭第99-147页
        一、引言第99-103页
        二、实验材料与方法第103-125页
            1. 实验样本与材料第103-106页
            2. 实验方法第106-125页
                2.1 细胞培养第106页
                2.2 miRNA的过表达和干扰第106页
                2.3 构建含PTPN9 3'-UTR的荧光素酶报告质粒第106-111页
                2.4 除内毒素质粒的抽提(用于转染细胞)第111-112页
                2.5 荧光素酶实验第112-113页
                2.6 miRNA及mRNA的qRT-PCR定量检测第113-117页
                2.7 PTPN9蛋白的过表达和下调表达第117页
                2.8 Western blot检测蛋白表达水平第117-120页
                2.9 EdU实验-荧光显微镜检测方法第120-122页
                2.10 细胞周期实验第122-123页
                2.11 细胞迁移实验第123页
                2.12 细胞侵袭实验第123-124页
                2.13 数值的统计分析第124-125页
        三、实验结果第125-141页
            1. miR-96在人乳腺癌样本中表达成上升趋势第125页
            2. 动物实验显示miR-96促进肿瘤生成第125-127页
            3. 体外细胞实验显示miR-96促进细胞增殖与侵袭第127-132页
                3.1 miR-96促进细胞的增殖第127-129页
                3.2 miR-96促进细胞迁移第129页
                3.3 miR-96促进细胞的侵袭第129-130页
                3.4 miR-96促进细胞周期进程第130-132页
            4. PTPN9是miR-96潜在的靶点第132-134页
            5. PTPN9蛋白在乳腺癌中表达量下降第134-135页
            6. 细胞实验验证miR-96靶向PTPN9第135-137页
            7. PTPN9蛋白在乳腺癌细胞系中的生物学功能第137-140页
            8. 验证miR-96和PTPN9对乳腺癌细胞的生物学功能成负调控模式第140-141页
        四、结论第141页
        五、讨论第141-144页
        参考文献第144-147页
攻读博士学位期间发表论文第147-148页
致谢第148-150页

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