| 摘要 | 第1-7页 |
| ABSTRACT | 第7-11页 |
| 1 文献综述 | 第11-25页 |
| ·动物驯化 | 第11页 |
| ·家猪和野猪 | 第11-12页 |
| ·脂肪组织 | 第12-15页 |
| ·脂肪组织的结构和功能 | 第12-13页 |
| ·脂肪组织的生长发育 | 第13-15页 |
| ·肌肉组织 | 第15-17页 |
| ·肌肉组织的结构与功能 | 第15-16页 |
| ·肌肉组织的生长发育和动物生产方面的意义 | 第16-17页 |
| ·转录组测序(RNA-seq) | 第17-25页 |
| ·RNA-seq定义 | 第17-18页 |
| ·RNA-seq技术平台 | 第18-20页 |
| ·RNA-seq原理 | 第20-21页 |
| ·RNA-seq技术优势 | 第21-22页 |
| ·RNA-seq应用 | 第22-25页 |
| 2 研究的目的意义 | 第25-26页 |
| 3 材料与方法 | 第26-41页 |
| ·试验样品采集 | 第26页 |
| ·主要仪器和试剂 | 第26-27页 |
| ·主要仪器设备 | 第26-27页 |
| ·主要试剂 | 第27页 |
| ·试验方法 | 第27-41页 |
| ·总RNA的提取 | 第27-28页 |
| ·总RNA的质检 | 第28-29页 |
| ·RNA-seq | 第29-35页 |
| ·RNA-seq数据分析 | 第35-39页 |
| ·RNA-seq数据可靠性验证 | 第39-41页 |
| 4 结果与分析 | 第41-61页 |
| ·家猪和野猪肌肉和脂肪组织转录组测序文库的构建 | 第41-44页 |
| ·总RNA甲醛变性琼脂糖凝胶检测结果 | 第41-42页 |
| ·总RNA毛细管电泳检测结果 | 第42-43页 |
| ·cDNA文库目的片段检测结果 | 第43页 |
| ·cDNA文库PCR扩增后的聚丙烯酰胺凝胶电泳检测 | 第43-44页 |
| ·测序数据概述及数据质量评估 | 第44-51页 |
| ·测序数据概述 | 第44页 |
| ·测序数据质量评估 | 第44-48页 |
| ·Clean reads基因组比对 | 第48-49页 |
| ·家猪和野猪脂肪和肌肉组织转录组特征分析 | 第49-51页 |
| ·家猪野猪脂肪和肌肉组织转录组差异分析 | 第51-61页 |
| ·差异转录本鉴定及聚类分析 | 第51-52页 |
| ·差异转录本功能分析 | 第52-61页 |
| ·测序结果可靠性验证 | 第61页 |
| 5 讨论 | 第61-64页 |
| ·荣昌猪和亚洲野猪之间的表型差异 | 第61-62页 |
| ·脂肪组织与肌肉组织之间的组织学差异 | 第62页 |
| ·荣昌猪和亚洲野猪脂肪和肌肉组织mRNA转录组特征 | 第62-64页 |
| 6 结论 | 第64-65页 |
| 参考文献 | 第65-72页 |
| 致谢 | 第72页 |