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综合应用核磁共振和顺磁共振的大肠杆菌跨膜蛋白硫氰酸酶YgaP结构研究

摘要第1-6页
Abstract第6-8页
目录第8-12页
第一章 硫氰酸酶的结构和功能简介第12-24页
   ·前言第12-13页
   ·硫氰酸酶的催化机制第13-14页
   ·硫氰酸酶同源结构域第14-15页
   ·硫氰酸酶的分类第15-17页
     ·串联结构域蛋白第15页
     ·单一结构域蛋白第15-16页
     ·复合结构域蛋白第16-17页
     ·长活性位点蛋白第17页
   ·硫氰酸酶的生物学功能第17-22页
     ·氰化物解毒作用第18-19页
     ·硫胺和硫脲苷的合成第19-20页
     ·钼蛋白辅助因子的合成第20-21页
     ·含硒生物大分子的合成第21页
     ·调控细胞周期第21-22页
     ·硫氰酸酶的其他功能第22页
   ·硫氰酸酶超家族研究的展望第22-24页
第二章 电子顺磁共振基本理论及在蛋白质研究中的应用第24-44页
   ·前言第24页
   ·电子顺磁共振基本原理及谱仪简介第24-27页
     ·电子顺磁共振基本原理第24-25页
     ·电子顺磁共振谱仪第25-26页
     ·信号收集时仪器参数第26-27页
   ·自旋标记技术第27-29页
     ·自旋标记物第27-28页
     ·位点特异性自旋标记(SDSL)第28-29页
   ·从SDSL-EPR得到的主要信息第29-35页
     ·动力学信息(motion)第30-32页
     ·溶剂易趋性(Accessibilty)第32-33页
     ·距离信息第33-35页
   ·SDSL-EPR在蛋白质研究中的应用第35-41页
     ·通过动力学和易趋性信息确定蛋白质二级结构第35-37页
     ·蛋白的入膜深度第37-38页
     ·检测蛋白质的构象变化第38-41页
   ·在生物学其他方面的应用第41-42页
   ·小结第42-44页
第三章 大肠杆菌YgaP的硫氰酸酶结构域的结构及功能研究第44-72页
   ·前言第44-46页
   ·实验材料与方法第46-60页
     ·引物设计第46-47页
     ·PCR反应第47-48页
     ·PCR产物的鉴定和回收第48页
     ·双酶切反应第48-49页
     ·连接反应第49-50页
     ·连接产物的转化第50页
     ·菌落PCR和双酶切鉴定第50-51页
     ·蛋白表达条件的筛选第51-52页
     ·YgaP(1-107)的表达第52页
     ·YgaP(1-107)蛋白纯化及核磁样品的制备第52-53页
     ·核磁实验第53页
     ·主链归属第53-56页
     ·侧链原子的化学位移归属第56-58页
     ·二级结构预测及二面角约第58页
     ·距离约束信息第58-59页
     ·Na_2S_2O_3和NaSCN滴定第59-60页
   ·实验结果与讨论第60-69页
     ·YgaP硫氰酸酶结构域的化学位移归属第60-61页
     ·Talos+二级结构预测第61-62页
     ·YgaP(1-107)的溶液结构第62-66页
     ·硫氰酸酶结构域的结构比对第66页
     ·Na_2S_2O_3和NaSCN滴定实验第66-69页
   ·小结第69-72页
第四章 利用电子顺磁共振技术解析YgaP跨膜区拓扑模型第72-96页
   ·引言第72-73页
   ·实验材料和方法第73-83页
     ·YgaP蛋白序列和二级结构预测第73-74页
     ·位点突变第74-75页
     ·YgaP的表达第75页
     ·YgaP的融膜去污剂的筛选第75-76页
     ·蛋白纯化及洗脱去污剂的筛选第76页
     ·用分子筛纯化蛋白第76-77页
     ·突变位点的MTSL标记第77页
     ·圆二色谱实验第77-78页
     ·连续波EPR实验第78页
     ·功率饱和EPR实验第78-79页
     ·DEER光谱收集第79-80页
     ·CW-EPR及DEER的光谱处理及距离拟合第80-82页
     ·距离数据处理第82页
     ·YgaP刚性结构模型的搭建第82-83页
   ·实验结果与讨论第83-93页
     ·YgaP的表达纯化第83-85页
     ·YgaP跨膜区的动力学特性第85-87页
     ·YgaP跨膜区的易趋性特征第87-89页
     ·YgaP跨膜区的距离信息及结构模型建立第89-93页
   ·小结第93-96页
参考文献第96-106页
附录第106-110页
致谢第110-111页
在读期间发表的学术论文与取得的研究成果第111页

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